Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar
Artikel publicerad februari 2013
InnehÄll
Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar
SmittÀmnen
Till denna grupp rÀknas ett antal olika bakterier med varierande cellulÀr morfologi. Stavar med regelbunden cellmorfologi förekommer hos bakterier tillhörande genus Erysipelothrix och Lactobacillus, medan oregelbundna stavar ses hos Gardnerella och Arcanobacterium. Till gruppen kan Àven rÀknas fakultativt anaeroba Actinomyces species, Actinobaculum och Bifidobacterium, de senare anaeroba/fakultativt anaeroba och ofta uttalat aerotoleranta. Enstaka katalasnegativa isolat av grampositiva stavar förekommer ocksÄ bland vanligen katalaspositiva grampositiva stavar som Bacillus med nÀrbeslÀktade bakterier, Rothia och Microbacterium. Vissa isolat av laktobaciller kan vara svagt katalaspositiva.
Nedan beskrivs de kliniskt mest relevanta arterna.
- Erysipelothrix rhusiopathiae (en av tre arter inom genus Eryspielothrix, dÀr endast E. rhusiopathiae rÀknas som humanpatogen) Àr en miljöbakterie som frÀmst Àr djurpatogen. Den förekommer i ett knappt 20-tal serovarianter och kan hos mÀnniska (sÀrskilt vanligt bland slaktare, veterinÀrer och fiskare) orsaka erysipeloid (vÀlavgrÀnsad djupröd/purpurfÀrgad lokal hudinfektion med underliggande cellulit). Regionala lymfadeniter och artriter kan förekomma. Vid fall av disseminerad infektion kan endokardit förekomma, det senare oftast hos immunsupprimerade individer. Serovar 1 och 2 dominerar vid humana infektioner. Bakterierna har en antifagocytÀr polysackarid-kapsel. Neuramidas bidrar till bakteriernas förmÄga att invadera vÀvnad.
- Lactobacillus species Àr grampositiva stavar i normalfloran i munhÄla, tarm och vagina. Den sjukdomsframkallande förmÄgan Àr lÄg men de förekommer som kontamination i bakteriologiska prov. Man rÀknar idag med över 180 arter inom genus Lactobacillus. Tidigare nomenklatur har byggt pÄ fenoklassifikation men vÀrderat med nyare genoklassifikation tycks de vanligaste arterna i vaginalflora vara Lactobacillus crispatus, L. jensinii och L. gasseri (2, 3). Enstaka fall av UVI och endokardit har beskrivits liksom förekomst i polymikrobiella abscesser i olika organsystem. L. rhamnosus, L. casei med flera andra arter isoleras vid sÄdana infektioner. Typiskt för laktobaciller Àr resistens mot vankomycin.
- Gardnerella: Se Bakteriell vaginos. Bakterierna klassificeras ofta som âdifteroida stavarâ.
- Arcanobacterium: Se Arcanobacterium haemolyticum
- Actinomyces species: Se Actinomyces. Actinomyces species kan vara fakultativt anaeroba eller anaeroba. Aktinomyceter kan vara katalaspositiva eller negativa. De ska inte förvÀxlas med aeroba aktinomyceter som beskrivs i Diagnostik av aeroba grampositiva, katalaspositiva stavar.
- Actinobaculum species: Genus med tre arter (A. schalii, A. urinale, A. massiliense) grampositiva, fakultativt anaeroba kockoida stavar. Alla tre arterna har visats vara uropatogener framförallt hos Àldre individer, men de har ocksÄ isolerats frÄn infektioner i blod och vÀvnader.
- Bifidobacterium species: Genus Bifidobacterium omfattar ett drygt 30-tal olika species av anaeroba grampositiva stavar av vilka flera Àr aerotoleranta. De hör till normalfloran i mag-tarmkanalen och anvÀnds industriellt som probiotika. Ger mycket sÀllan upphov till generaliserade infektioner hos mÀnniska. De anses spela roll i etiologin till dental karies.
Se ocksÄ
- Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:A-K
- Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:L-Y
Provtagning och transport
Provtagningen görs enligt angivna principer för respektive provtyp. Erysipelotrix identifieras bÀst frÄn vÀvnadsbiopsier tagna frÄn infekterat omrÄde. Vid disseminerad sjukdom kan bakterierna isoleras i vanliga blododlingsflaskor.
Laboratoriediagnostik
AllmÀnt
Grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar Àr generellt svÄra att med sÀkerhet identifiera till artnivÄ. I de flesta fall, med undantag för E. rhusiopathiae, hör bakterierna till human normalflora, och isoleras ofta tillsammans med andra bakterier. Karakteristik av cellutseende i grampreparat Àr basalt viktigt liksom katalastest. Biokemisk referensmetodik för identifiering av bakterierna kan ofta inte anges, men i flera fall kan gaskromatografi anses vara referensmetod för att sÀrskilja exempelvis olika arter av laktobaciller (mjölksyra), bifidobakterier (Àttiksyra) eller Actinomyces (succininsyra) (Jousimies Somer et al Wadsworth anaerobic Bact Manual; 2002 6th ed. Star Publishing Company. Belmont. Calif). Kommersiella brickor kan vara av vÀrde, men missidentifieringar kan förekomma.
Databaserna för Maldi-Tof anger ett relativt stort urval av bakterier inom gruppen, men tillrÀcklig erfarenhet saknas Ànnu för att ange nivÄn, om Àn sannolikt hög, för resultatens tillförlitlighet. 16S rRNA-sekvensering torde i dagslÀget vara den sÀkraste metodiken för artidentifiering.
Serologiska tester saknar tillÀmpning för human diagnostik.
Isolering och identifiering
- E. rhusiopathiae vÀxer pÄ rutinsubstrat (blod, -hematin-agar) i 36 °C i luft eller 5 % CO2, pÄ blod-agar med smÄ (<0.5 mm) alfa-eller gammahemolytiska kolonier. Efter tvÄ dygns inkubering Àr kolonierna jÀmna, glatta och konvexa men samtidigt kan större rÄa, oregelbundna och platta kolonier förekomma.
Diagnostiska minimikriterier, se Grampositiva stavar-diagnostiska minimikriterier.
Serologiska tester för pÄvisande av antikroppar i humanblod mot E. rhusiopathiae finns inte tillgÀngliga.
- Lactobacillus species vÀxer pÄ rutinsubstrat inkuberade anaerobt, flera arter ocksÄ i luft eller 5 % CO2. Typsikt Àr pinpoint alfa-hemolytiska kolonier pÄ fÄrblod-agar pÄminnande om alfa-streptokocker. VÀxt pÄ CLED-agar med mycket smÄ kolonier. I gramfÀrgade preparat framtrÀder bakterierna som lÄnga, slanka grampositiva stavar som kan vara raka, böjda eller koryneforma.
Diagnostiska minimikriterier, se Grampositiva bakterier vid UVI-diagnostik
- Genus Arcanobacterium: se Arcanobacterium haemolyticum.
- Gardnerella vaginalis: se Bakteriell vaginos#SmittÀmnen och Bakteriell vaginos-provtagning.
- Actinomyces species: Se Actinomyces. Actinomyces species kan vara fakultativt anaeroba eller anaeroba. Aktinomyceter kan vara katalaspositiva eller negativa.
- Actinobaculum species: VÀxer pÄ rutinsubstraten efter 48 timmar inkuberade anaerobt eller i CO2. Actinobaculum Àr lÄngsamvÀxande och förbises dÀrför lÀtt i kliniska prover. PÄ fÄrblod-agar vÀxer de med smÄ grÄa kolonier med svag alfa-eller ingen hemolys. I gramfÀrgade preparat syns raka eller svagt böjda förgrenade stavar, enstaka eller i kluster.
- Bifidobacterium species vÀxer bÀst i anaerob miljö, men kan i flera fall vÀxa Àven i CO2. I gramfÀrgade preparat syns grampositiva, ofta förgrenade stavar.
Se ocksÄ artikeln Maldi-Tof
Referensstammar (utvÀrderas februari 2013)
- Erysipelothrix rhusiopathiae CCUG 52505
- Actinobaculum schaalii, CCUG 60260
- Bifidobacterium breve, CCUG 47844
- Lactobacillus rhamnosus, CCUG 61588
Svarsrutiner
Isolat bör identifieras till genus, om möjligt till art, vid signifikant förekomst i prov frÄn normalt sterila omrÄden (blod, csv, ledvÀtska etcetera.).
Alla fynd av E. rhusiopathiae svaras ut med angivande av art.
Se ocksÄ Actinomyces, Arcanobacterium haemolyticum och Bakteriell vaginos#SmittÀmnen
LaboratorieanmÀlan
Fynd av bakterier i den hÀr beskrivna gruppen Àr inte anmÀlningspliktiga.
Referensfunktioner
Saknas
Författare och faktagranskare
- Magnus Thore, SMI
- Berndt Claesson, Skövde (faktagranskning)
REFERENSER
- Nielsen, H.L., SĂžby, K.M., Christensen, J.J., Prag, J. Actinobaculum schaalii: a common cause of urinary tract infection in the elderly population. Bacteriological and clinical characteristics. Scand J Infect Dis. 2010;42(1):43-7.
- Tschudin-Sutter, S., Frei, R., Weisser, M., Goldenberger, D., Widmer, A.F. Actinobaculum schaalii - invasive pathogen or innocent bystander? A retrospective observational study. BMC Infect Dis. 2011 Oct 26;11:289.
- Bernard, K., A.General approaches to the identification of aerobic gram-positive rods. In Man Clin Microbiol Eds: Versalovic and others, ASM. 2011; Chapter 23
- Wade, W., G., and Könönen, E. Propionibacterium, Lactobacillus, Actinomyces and other non-spore.forming anaerobic gram-positive rods. In Man Clin Microbiol Eds: Versalovic and others, ASM. 2011; Chapter 49