Achromobacter xylosoxidans - Versionshistorik

Magnus Thore: /* Achromobacter xylosoxidans */

2012-06-03T06:18:06Z

Achromobacter xylosoxidans

Magnus Thore: /* Patogens och patofysiologi */

2009-12-13T13:45:07Z

Patogens och patofysiologi

Magnus Thore den 8 december 2009 kl. 22.48

2009-12-08T22:48:48Z

Magnus Thore: /* Identifiering och minimikriterier */

2009-11-21T19:35:08Z

Identifiering och minimikriterier

Magnus Thore: Skapade sidan med ''''Huvudartikel''' ---- Till innehållsförteckningen för ''Referensmetodik: Nedre luftvägsinfektioner, 2:a upplagan 2005'' ---- == Achromobacter (tidigare Alcaligenes)…'

2009-11-21T19:21:44Z

Skapade sidan med ''''Huvudartikel''' ---- Till innehållsförteckningen för ''Referensmetodik: Nedre luftvägsinfektioner, 2:a upplagan 2005'' ---- == Achromobacter (tidigare Alcaligenes)…'

Ny sida

'''Huvudartikel'''

----

Till innehållsförteckningen för ''[[Referensmetodik: Nedre luftvägsinfektioner, 2:a upplagan 2005]]''

----

== Achromobacter (tidigare Alcaligenes) xylosoxidans subspecies xylosoxidans ==

=== Smittämnen ===

Bakterier tillhörande genus ''Achromobacter'' är flagellförsedda nonfermentativa gramnegativa stavar med ett tjugotal arter identifierade. Av dessa är bara några få humanpatogena och intressantast ur ett luftvägsperspektiv är ''A. xylosoxidans'' (subsp. ''xylosoxidans''), nedan kallad ''A. xylosoxidans''. Bakterierna är nära besläktade med ''Alcaligenes'' (taxonomisk omgruppering sker fortlöpande) och ''Bordetella''. ''A. xylosoxidans'' finns naturligt i fuktiga miljöer, även inom vårdinrättningar där den givit upphov till nosokomiala infektionsutbrott. Den har påvisats bland annat i desinfektionsmedel, dialysvätskor, saltlösningar och anläggningar för avjonisering av vatten.

=== Patogens och patofysiologi ===

Bakterien betraktas som opportunistisk patogen som kan orsaka bland annat korneala ulcera, [[bakteriemi]], [[meningit]], cerebral ventrikulit, [[peritonit]] och [[pneumoni]] hos immunsupprimerade individer. Under senare år har man uppmärksammat bakterien som orsak till persisterande infektioner i nedre luftvägarna hos [[Cystisk fibros-CF|CF-patienter]]. Den förväxlas dock inte sällan med ''[[Burkholderia cepacia]]''-komplexet och andra nonfermentativa stavar. Detta har medfört att dess roll som patogen hos CF-patienter inte med säkerhet kunnat klarläggas. Föga är känt beträffande virulensmekanismer. Liksom t.ex. ''[[Legionella]]'' species, ''[[Chlamydophila pneumoniae]]'' och ''[[Cryptococcus neoformans]]'' är ''A. xylosoxidans'' ”amöbaresistent” med förmåga att överleva fagocytos i makrofager.

=== Epidemiologi, symtom och klinisk bild ===

Knappt 10 % av CF-patienter är koloniserade med ''A. xylosoxidans''. Man har kunnat verifiera klonal spridning mellan CF-patienter men inte mellan CF-centra. Kolonisering/infektion med ''A. xylosoxidans'' kan vara persisterande men innebär inte samma risk för progredierande destruktion av lungvävnaden som vid kolonisering med ''B. cepacia''-komplexet. Även om den i enstaka fall har associerats med starkt försämrad lungfunktion blir koloniserade patienter inte föremål för samma typ av restriktioner som vid kolonisering med ''B. cepacia''.

=== Provtagning och transport ===

Lämpligt provmaterial för påvisande av ''A. xylosoxidans'' är sputum eller prov taget via bronkoskop (skyddad borste, BAL). Transport sker enligt principer som beskrivs för respektive provtyp i denna bok.

== Laboratoriediagnostik ==

=== Allmänt ===

Eftersom kolonisering med ''A. xylosoxidans'' är betydligt mindre alarmerande än motsvarande med ''B. cepacia''-komplexet för CF-patienter är det väsentligt att i första hand kunna skilja dessa åt. Vid fenotypisk identifiering av ''A. xylosoxidans'' finns risk för förväxling bland annat med ''B. cepacia'', men också med ''Ralstonia'' och ''Pandoraea''. Genusspecifik PCR med hög specificitet för ''Achromobacter'' finns beskriven men är inte kommersiellt tillgänglig.

=== Referensmetodik ===

Referensmetodik för fenotypisk identifiering kan inte anges. Presumptiv identifiering baseras på odling.

==== Referenssubstrat ====

Växer dåligt eller inte alls på Burkholderia selective agar och cetrimidagar. God växt för övrigt på för provtypen rekommenderade substrat.

Växt på MacConkeyagar med rosa råa kolonier med relative growth index motsvarande 10 % jämfört med blodagar.

==== Isolering ====

Aerob odling i 36 C upp till 7 dygn.

==== Identifiering och minimikriterier ====

Se [[Laboratoriemetodik – diagnostiska minimikriterier]].

=== Alternativa diagnostiska metoder ===

Kommersiella analysbrickor kan vara till hjälp för presumtiv diagnos men kan ofta inte differentiera mot andra nonfermentativa stavar, särskilt ''Ralstonia'' och ''Burkholderia''.

Nukleinsyrapåvisning finns beskriven (16S rRNA-baserad) som utgående från misstänkta kolonier med hög sensitivitet (100 %) och specificitet (97 %) kan skilja ''Achromobacter'' från bland andra ''B. cepacia, Bordetella, Pandoraea'' och ''Ralstonia''.

=== Resistensbestämning och resistensutveckling ===

''A. xylosoxidans'' är känslig för nyare cefalosporiner och karbapenemer men är ofta resistent mot aminoglykosider, kolistin, ampicillin, äldre cefalosporiner inklusive cefuroxim och även kinoloner. CF-patienter med tendens till försämrad lungfunktion där endast ''A. xylosoxidans'' påvisats bör behandlas med karbapenem eller piperacillin-tazobactam. Trimsulfa har också effekt. Ofta är bakterien resistent mot desinfektionsmedel som klorhexidin. Denna resistens beror på produktion av klorhexidindegraderande enzym.

=== Epidemiologisk typning ===

AP-PCR har med framgång använts vid kartläggning av spridning mellan CF-patienter. Fortfarande återstår mycket arbete för erhållande av kunskaper beträffande bakteriens spridnigsförmåga.

=== Kvalitetskontroll ===

*Referensstam
**''Achromobacter xylosoxidans'' subspecies ''xylosoxidans'' ATCC 27061.

== Svarsrutiner ==

Enligt gängse rutiner för respektive provtyp.

== Laboratorierapportering ==

== Achromobacter xylosoxidans ==
är inte anmälningspliktig.

== REFERENSER ==

*Liu L, Coenye T, Burns JL, Whitby PW, Stull TL and LiPuma JJ. 2002. Ribosomal DNA-directed PCR for identification of ''Achromobacter (Alcaligenes) xylosoxidans'' recovered from sputum samples from cystic fibrosis patients. J. Clin. Microbiol. 40: 1210-1213.

*Krzewinski JW, Nguyen DC, Foster JM and Burns JL. 2001. Use of random amplified polymorphic DNA PCR to examine epidemiology of ''Stenotrophomonas maltophilia'' and ''Achromobacter (Alcaligenes) xylosoxidans'' from patients with cystic fibrosis. J. Clin. Microbiol. 39: 3597-3602.

[[Kategori:Nedre luftvägsinfektioner]]
[[Kategori:Bakterier]]

← Äldre version		Versionen från 3 juni 2012 kl. 06.18
Rad 78:		Rad 78:


−	== Achromobacter xylosoxidans ==	+	''Achromobacter xylosoxidans'' är inte anmälningspliktig.
−	är inte anmälningspliktig.

	== REFERENSER ==		== REFERENSER ==

@@ Rad 17: / Rad 17: @@
 === Patogens och patofysiologi ===
-Bakterien betraktas som opportunistisk patogen som kan orsaka bland annat korneala ulcera, [[bakteriemi]], [[meningit]], cerebral ventrikulit, [[peritonit]] och [[pneumoni]] hos immunsupprimerade individer. Under senare år har man uppmärksammat bakterien som orsak till persisterande infektioner i nedre luftvägarna hos [[Cystisk fibros-CF|CF-patienter]]. Den förväxlas dock inte sällan med ''[[Burkholderia cepacia]]''-komplexet och andra nonfermentativa stavar. Detta har medfört att dess roll som patogen hos CF-patienter inte med säkerhet kunnat klarläggas. Föga är känt beträffande virulensmekanismer. Liksom t.ex. ''[[Legionella]]'' species, ''[[Chlamydophila pneumoniae]]'' och ''[[Cryptococcus neoformans]]'' är ''A. xylosoxidans'' ”amöbaresistent” med förmåga att överleva fagocytos i makrofager.
+Bakterien betraktas som opportunistisk patogen som kan orsaka bland annat korneala ulcera, [[bakteriemi]], [[meningit]], cerebral ventrikulit, peritonit och [[pneumoni]] hos immunsupprimerade individer. Under senare år har man uppmärksammat bakterien som orsak till persisterande infektioner i nedre luftvägarna hos [[Cystisk fibros-CF|CF-patienter]]. Den förväxlas dock inte sällan med ''[[Burkholderia cepacia]]''-komplexet och andra nonfermentativa stavar. Detta har medfört att dess roll som patogen hos CF-patienter inte med säkerhet kunnat klarläggas. Föga är känt beträffande virulensmekanismer. Liksom t.ex. ''[[Legionella]]'' species, ''[[Chlamydophila pneumoniae]]'' och ''[[Cryptococcus neoformans]]'' är ''A. xylosoxidans'' ”amöbaresistent” med förmåga att överleva fagocytos i makrofager.
 === Epidemiologi, symtom och klinisk bild ===

@@ Rad 47: / Rad 47: @@
 ==== Isolering ====
-Aerob odling i 36 C upp till 7 dygn.
+Aerob odling i 36 °C upp till 7 dygn.
 ==== Identifiering och minimikriterier ====

@@ Rad 51: / Rad 51: @@
 ==== Identifiering och minimikriterier ====
-Se [[Laboratoriemetodik – diagnostiska minimikriterier]].
+Se [[Nonfermentativa-, långsamväxande-, och övriga gramnegativa stavar-diagnostiska minimikriterier|Laboratoriemetodik – diagnostiska minimikriterier]].
 === Alternativa diagnostiska metoder ===