Enterohemorragiska Escherichia coli-laboratoriediagnostik - Versionshistorik

Öjar Melefors: /* PCR-screening */

2014-01-13T10:05:08Z

PCR-screening

2014-01-10T14:00:22Z

Epidemiologisk typning

2014-01-10T14:00:12Z

Identifiering och minimikriterier

2014-01-10T13:59:39Z

Serologi

2014-01-10T13:57:36Z

Serologi

2014-01-10T13:56:57Z

Serologi

2014-01-10T13:56:41Z

Identifiering och minimikriterier

2014-01-10T13:55:54Z

Allmänt

2012-04-20T13:13:40Z

Serologi

2009-12-13T10:43:32Z

PCR-screening

@@ Rad 30: / Rad 30: @@
 ==== PCR-screening ====
-''stx1'', ''stx2'' och ''eae'' påvisas med PCR på primärkultur eller enskilda kolonier. Metodbeskrivning ”Diarréframkallande ''Escherichia coli'' och shigatoxigena ''[[Enterobacteriaceae]]'' - påvisning med PCR”, som tillämpas vid SMI bifogas som exempel ([[Bilaga 3. PCR-diagnostik av diarréframkallande E coli och EHEC]]).
+''stx1'', ''stx2'' och ''eae'' påvisas med PCR på primärkultur eller enskilda kolonier. Metodbeskrivning ”Diarréframkallande ''Escherichia coli'' och shigatoxigena ''[[Enterobacteriaceae]]'' - påvisning med PCR”, som tillämpas vid Folkhälsomyndigheten bifogas som exempel ([[Bilaga 3. PCR-diagnostik av diarréframkallande E coli och EHEC]]).
 ==== Isolering av EHEC från PCR-positiva prover ====

@@ Rad 78: / Rad 78: @@
 === Epidemiologisk typning ===
-SMI utför epidemiologisk typning av EHEC med PFGE och serotypning.
+Folkhälsomyndigheten utför epidemiologisk typning av EHEC med PFGE och serotypning.
 === Kvalitetskontroll ===

@@ Rad 62: / Rad 62: @@
 Om misstanke på EHEC O157:H7 finns utförs agglutinationstest i serogrupp specifikt antiserum (bilaga 2.2) på bleka kolonier från SMAC. Om sorbitol-negativt isolatet agglutinerar som O157 anses diagnosen EHEC O157 verifierad.
-Isolat som ej agglutinerar i O157 skickas till Folkhälsomyndigheten för serotypning (O:H). SMI utför också analys av ett flertal virulensgener. Även O157 skickas till Folkhälsomyndigheten för påvisande av H7-antigen med fliCH7-PCR och epidemiologisk typning med PFGE.
+Isolat som ej agglutinerar i O157 skickas till Folkhälsomyndigheten för serotypning (O:H). Folkhälsomyndigheten utför också analys av ett flertal virulensgener. Även O157 skickas till Folkhälsomyndigheten för påvisande av H7-antigen med fliCH7-PCR och epidemiologisk typning med PFGE.
 === Alternativ diagnostik ===

@@ Rad 74: / Rad 74: @@
 ==== Serologi ====
-Serologi för påvisande av antikroppar mot EHEC-LPS har beskrivits i litteraturen och kan t.ex. användas för att komplettera ett ''stx''-positivt PCR-resultat i avsaknad av isolat. Folkhälsomyndigheten vidarebefordrar prover till [http://www.hpa.org.uk/ Public Health England] för O157-serologi.
+Serologi för påvisande av antikroppar mot EHEC-LPS har beskrivits i litteraturen och kan t.ex. användas för att komplettera ett ''stx''-positivt PCR-resultat i avsaknad av isolat. Folkhälsomyndigheten vidarebefordrar prover till [https://www.gov.uk/government/organisations/public-health-england Public Health England] för O157-serologi.
 === Epidemiologisk typning ===

@@ Rad 74: / Rad 74: @@
 ==== Serologi ====
-Serologi för påvisande av antikroppar mot EHEC-LPS har beskrivits i litteraturen och kan t.ex. användas för att komplettera ett ''stx''-positivt PCR-resultat i avsaknad av isolat. Folkhälsomyndigheten vidarebefordrar prover till [http://www.hpa.org.uk/ HPA] för O157-serologi.
+Serologi för påvisande av antikroppar mot EHEC-LPS har beskrivits i litteraturen och kan t.ex. användas för att komplettera ett ''stx''-positivt PCR-resultat i avsaknad av isolat. Folkhälsomyndigheten vidarebefordrar prover till [http://www.hpa.org.uk/ Public Health England] för O157-serologi.
 === Epidemiologisk typning ===

@@ Rad 13: / Rad 13: @@
 Diagnostiken hos människa är baserad på att med PCR påvisa ''stx''-genen i utodlade prover. Påvisad ''stx1''- och/eller ''stx2''-gen utgör grunden för en EHEC-diagnos. Från positiva prover görs försök att isolera stx-positiv bakterie för artbestämning. För rapportering enligt smittskyddslagen av EHEC O157 krävs fastställande av serogrupp. Om försök att isolera EHEC misslyckas kan laboratoriediagnosen baseras enbart på PCR under förutsättning att detta förhållande uttrycks i svaret.
-Det är angeläget att ''stx''-positiva non-O157 isolat skickas till SMI för serotypning och analys av flera virulensgener. Resultaten kommer att utgöra ett underlag för framtida virulensassocierad definition av EHEC och därmed sammanhängande revision av smittskyddslagen.
+Det är angeläget att ''stx''-positiva non-O157 isolat skickas till Folkhälsomyndigheten för serotypning och analys av flera virulensgener. Resultaten kommer att utgöra ett underlag för framtida virulensassocierad definition av EHEC och därmed sammanhängande revision av smittskyddslagen.
 === Referensmetodik ===

@@ Rad 76: / Rad 76: @@
 ==== Serologi ====
-Serologi för påvisande av antikroppar mot EHEC-LPS har beskrivits i litteraturen och kan t.ex. användas för att komplettera ett ''stx''-positivt PCR-resultat i avsaknad av isolat. SMI vidarebefordrar prover till PHLS för O157-serologi.
+Serologi för påvisande av antikroppar mot EHEC-LPS har beskrivits i litteraturen och kan t.ex. användas för att komplettera ett ''stx''-positivt PCR-resultat i avsaknad av isolat. SMI vidarebefordrar prover till [http://www.hpa.org.uk/ HPA] för O157-serologi.
 === Epidemiologisk typning ===