Hierarkisk metodstruktur-översikt - Versionshistorik

Magnus Thore: /* Nivå 1: Låg rutinnivå eller screening */

2010-02-09T09:31:44Z

Nivå 1: Låg rutinnivå eller screening

Magnus Thore: /* Nivå 4: Definitiv referensnivå */

2009-12-24T09:58:39Z

Nivå 4: Definitiv referensnivå

Magnus Thore: /* Hierarkisk metodstruktur vid laboratoriediagnostik av urinvägsinfektioner */

2009-12-24T09:56:54Z

Hierarkisk metodstruktur vid laboratoriediagnostik av urinvägsinfektioner

Magnus Thore: /* Hierarkisk metodstruktur vid laboratoriediagnostik av urinvägsinfektioner */

2009-12-22T14:21:30Z

Hierarkisk metodstruktur vid laboratoriediagnostik av urinvägsinfektioner

Magnus Thore den 16 december 2009 kl. 18.12

2009-12-16T18:12:43Z

Magnus Thore den 16 december 2009 kl. 18.02

2009-12-16T18:02:22Z

Magnus Thore: /* Nivå 4: Definitiv referensnivå */

2009-12-01T10:18:03Z

Nivå 4: Definitiv referensnivå

Magnus Thore: /* Nivå 1: Låg rutinnivå eller screening */

2009-11-24T23:03:48Z

Nivå 1: Låg rutinnivå eller screening

Magnus Thore: /* Nivå 2: Hög rutinnivå */

2009-11-24T23:02:50Z

Nivå 2: Hög rutinnivå

Magnus Thore: /* Nivå 3: Referensmetod/jämförelsemetod */

2009-11-24T23:01:26Z

Nivå 3: Referensmetod/jämförelsemetod

@@ Rad 39: / Rad 39: @@
 === Nivå 1: Låg rutinnivå eller screening ===
-[[Kvantitativ urinodling-låg rutinnivå (screening)|Metodik på denna nivå]] är formgiven för isolering av snabbväxande urinvägspatogener. Sensitiviteten försämras något men speciellt kan specificiteten påverkas genom att kontaminerande grampositiv flora från genitalia inte påvisas. Med dipslideteknik kan det p.g.a. den lilla agarytan och det icke selektiva inokuleringsförfarandet även vara svårt att påvisa blandflora av snabbväxande mer.
+[[Kvantitativ urinodling-låg rutinnivå (screening)|Metodik på denna nivå]] är utformad för isolering av snabbväxande urinvägspatogener. Sensitiviteten försämras något men speciellt kan specificiteten påverkas genom att kontaminerande grampositiv flora från genitalia inte påvisas. Med dipslideteknik kan det p.g.a. den lilla agarytan och det icke selektiva inokuleringsförfarandet även vara svårt att påvisa blandflora av snabbväxande mer.
 Kvantifieringen är osäkrare än vid nivå 2 eftersom endast en istället för två inokulatmängder används. Precisionen i det lägre mätområdet måste ifrågasättas vid utodling med ögla och för dipslide torde endast kvantifiering enligt en ordinalskala vara möjlig. Denna nivå skall tillåta kvantifiering ned till <math>10^7</math> CFU/L.

@@ Rad 16: / Rad 16: @@
 En sådan teknik skall vara grundligt utvärderad och entydigt visats ge sanna och precisa mätvärden/observationer. Förhållanden och tillvägagångssätt skall vara exakt och klart beskrivna samt tillåta karakterisering av referensmaterial.
-Definitiva referensmetoder (kan i bland ha status som "gold standard") saknas oftast inom klinisk mikrobiologi.
+Definitiva referensmetoder saknas oftast inom klinisk mikrobiologi.
 === Nivå 3: Referensmetod/jämförelsemetod ===

@@ Rad 5: / Rad 5: @@
 == Hierarkisk metodstruktur vid laboratoriediagnostik av urinvägsinfektioner==
-Det externa kvalitetssäkringsprogrammet har tydliggjort att den metodologiska variationen för urinodling är stor trots tidigare harmoniseringsförsök ([[Urin-bilaga 2]]). Dessutom har decentralisering och kommersialisering en tendens att driva diagnostiken mot snabbare och billigare lösningar vilka emellertid inte alltid är mikrobiologiskt optimala. Specificitetens stora vikt vid låga prevalenser uppmärksammas  allt för lite; vid en sensitivitet och specificitet på 90 % blir PV<sub>pos</sub> 50 % om p=l0 %.
+Det externa kvalitetssäkringsprogrammet har tydliggjort att den metodologiska variationen för urinodling är stor trots tidigare harmoniseringsförsök ([[Urin-bilaga 2]]). Dessutom har decentralisering och kommersialisering en tendens att driva diagnostiken mot snabbare och billigare lösningar vilka emellertid inte alltid är mikrobiologiskt optimala. Specificitetens stora vikt vid låga prevalenser uppmärksammas  allt för lite; vid en sensitivitet och specificitet på 90 % blir PV<sub>pos</sub> 50 % om p=10 %.
 I vissa situationer som ackreditering och offertgivning är det därför av medicinskt intresse att vald ambitionsnivå specificeras så att mikrobiologiskt adekvatare lösningar inte missgynnas på grund av otydlighet.

@@ Rad 5: / Rad 5: @@
 == Hierarkisk metodstruktur vid laboratoriediagnostik av urinvägsinfektioner==
-Det externa kvalitetssäkringsprogrammet har tydliggjort att den metodologiska variationen för urinodling är stor trots tidigare harmoniseringsförsök (bilaga 2). Dessutom har decentralisering och kommersialisering en tendens att driva diagnostiken mot snabbare och billigare lösningar vilka emellertid inte alltid är mikrobiologiskt optimala. Specificitetens stora vikt vid låga prevalenser uppmärksammas  allt för lite; vid en sensitivitet och specificitet på 90 % blir PVpos 50 % om p=l0 %.
+Det externa kvalitetssäkringsprogrammet har tydliggjort att den metodologiska variationen för urinodling är stor trots tidigare harmoniseringsförsök ([[Urin-bilaga 2]]). Dessutom har decentralisering och kommersialisering en tendens att driva diagnostiken mot snabbare och billigare lösningar vilka emellertid inte alltid är mikrobiologiskt optimala. Specificitetens stora vikt vid låga prevalenser uppmärksammas  allt för lite; vid en sensitivitet och specificitet på 90 % blir PV<sub>pos</sub> 50 % om p=l0 %.
 I vissa situationer som ackreditering och offertgivning är det därför av medicinskt intresse att vald ambitionsnivå specificeras så att mikrobiologiskt adekvatare lösningar inte missgynnas på grund av otydlighet.

@@ Rad 41: / Rad 41: @@
 [[Kvantitativ urinodling-låg rutinnivå (screening)|Metodik på denna nivå]] är formgiven för isolering av snabbväxande urinvägspatogener. Sensitiviteten försämras något men speciellt kan specificiteten påverkas genom att kontaminerande grampositiv flora från genitalia inte påvisas. Med dipslideteknik kan det p.g.a. den lilla agarytan och det icke selektiva inokuleringsförfarandet även vara svårt att påvisa blandflora av snabbväxande mer.
-Kvantifieringen är osäkrare än vid nivå 2 eftersom endast en istället för två inokulatmängder används. Precisionen i det lägre mätområdet måste ifrågasättas vid utodling med ögla och för dipslide torde endast kvantifiering enligt en ordinalskala vara möjlig. Denna nivå skall tillåta kvantifiering ned till 10e7 CFU/L.
+Kvantifieringen är osäkrare än vid nivå 2 eftersom endast en istället för två inokulatmängder används. Precisionen i det lägre mätområdet måste ifrågasättas vid utodling med ögla och för dipslide torde endast kvantifiering enligt en ordinalskala vara möjlig. Denna nivå skall tillåta kvantifiering ned till <math>10^7</math> CFU/L.
 Identifiering av mikroorganismer kan variera från den ambitionsnivå av nivå typ som används vid mikrobiologiska laboratorier till enbart screening för ''[[E. coli]]'' som med dipslide trio.

@@ Rad 29: / Rad 29: @@
 Denna [[Kvantitativ urinodling-hög rutinnivå|högsta rutinnivå]] på mikrobiologiskt laboratorium är en förenklad kvantitativ odling som ansluter sig till jämförelsemetoden genom användning av två substrat och därigenom säker isolering av mikroorganismer som kräver särskilda tillväxtförhållanden. Detta förfarande ger ökad sensitivitet men stärker i synnerhet specificiteten genom att tillåta identifiering av grampositiv flora från genitalia som tecken på provtagningsförorening.
-Kvantifieringen är osäkrare än vid nivå 3 eftersom inokulering med ögla tillåts men är säkrare än vid nivå 1. Denna nivå skall tillåta kvantifiering ned till 10e6 CFU/L.
+Kvantifieringen är osäkrare än vid nivå 3 eftersom inokulering med ögla tillåts men är säkrare än vid nivå 1. Denna nivå skall tillåta kvantifiering ned till <math>10^6</math> CFU/L.
 I sin referensversion rekommenderas två dygns inkubering. Härigenom ökas sensitivitet och specificitet ytterligare dels genom att långsamväxare tillåts växa ut dels genom att identifiering av blandflora underlättas. Två dygns odling erbjuder dessutom sekundärgranskning av annan avläsare med möjlighet till korrigeringar, utbildning och harmonisering inom laboratoriet. Inkuberingstiden kan dock anpassas till lokala överenskommelser med remitterande kliniker, typ av prov osv.

@@ Rad 28: / Rad 28: @@
 === Nivå 2: Hög rutinnivå ===
-Denna högsta rutinnivå på mikrobiologiskt laboratorium är en förenklad kvantitativ odling som ansluter sig till jämförelsemetoden genom användning av två substrat och därigenom säker isolering av mikroorganismer som kräver särskilda tillväxtförhållanden. Detta förfarande ger ökad sensitivitet men stärker i synnerhet specificiteten genom att tillåta identifiering av grampositiv flora från genitalia som tecken på provtagningsförorening.
+Denna [[Kvantitativ urinodling-hög rutinnivå|högsta rutinnivå]] på mikrobiologiskt laboratorium är en förenklad kvantitativ odling som ansluter sig till jämförelsemetoden genom användning av två substrat och därigenom säker isolering av mikroorganismer som kräver särskilda tillväxtförhållanden. Detta förfarande ger ökad sensitivitet men stärker i synnerhet specificiteten genom att tillåta identifiering av grampositiv flora från genitalia som tecken på provtagningsförorening.
 Kvantifieringen är osäkrare än vid nivå 3 eftersom inokulering med ögla tillåts men är säkrare än vid nivå 1. Denna nivå skall tillåta kvantifiering ned till 10e6 CFU/L.
@@ Rad 37: / Rad 37: @@
 Nivå 2 kan ofta användas för validering av nivå 1 om procedurens svagheter välkända och beaktade.
 === Nivå 1: Låg rutinnivå eller screening ===

@@ Rad 21: / Rad 21: @@
 === Nivå 3: Referensmetod/jämförelsemetod ===
-För undersökning av bakteriuri beskrivs istället en kvalificerad jämförelsemetod eller referensmetod av något lägre dignitet.
+För undersökning av bakteriuri beskrivs istället en kvalificerad [[Kvantitativ urinodling-jämförelsenivå|jämförelsemetod eller referensmetod]] av något lägre dignitet.
 Den skall tillåta utodling av de flesta mikroorganismer som kräver speciella tillväxtbetingelser och ge en för ändamålet acceptabel kvantitativ reproducerbarhet. Isolerade organismer skall kunna identifieras till speciesnivå.
 Metoden är p.g.a. merarbete och kostnad inte lämplig som rutinmetod utan endast avsedd för diagnostik i utvalda fall efter individuell bedömning samt som bas för vetenskapliga studier.
 === Nivå 2: Hög rutinnivå ===