Kromogena substrat - Versionshistorik

Magnus Thore: /* Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov */

2013-01-29T13:05:50Z

Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov

Magnus Thore: /* Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov */

2013-01-29T12:57:23Z

Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov

Magnus Thore: /* REFERENSER */

2012-06-19T10:17:50Z

REFERENSER

Magnus Thore: /* Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov */

2012-06-19T10:13:32Z

Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov

Magnus Thore: /* Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov */

2012-06-15T10:19:31Z

Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov

Magnus Thore: /* GBS */

2012-06-03T06:31:59Z

GBS

Magnus Thore: /* GBS */

2012-06-03T06:30:52Z

GBS

Magnus Thore: /* GBS */

2012-06-03T06:29:55Z

GBS

Magnus Thore: /* Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov */

2012-04-30T15:03:27Z

Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov

Magnus Thore: /* Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov */

2012-04-23T20:33:38Z

Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov

@@ Rad 64: / Rad 64: @@
 ====Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov====
-Ett antal kromogena substrat finns tillgängliga för primärisolering och presumtiv identifiering av olika typer av antibiotikaresistens. Dessa baseras på kromogena media som gjorts selektiva genom tillsats av antibiotika. Substrat finns (2011) för [[MRSA]], [[VRE]], [[Screeningmetodik för ESBL|ESBL]], CTX-M och KPC. Generellt hänvisar vi till gällande referensmetodik avseende påvisande av antibiotikaresistenta bakterier (REF) och inget av substraten rekommenderas som referenssubstrat.
+Ett antal kromogena substrat finns tillgängliga för primärisolering och presumtiv identifiering av olika typer av antibiotikaresistens. Dessa baseras på kromogena media som gjorts selektiva genom tillsats av antibiotika. Substrat finns (2011) för [[MRSA]], [[VRE]], [[Screeningmetodik för ESBL|ESBL]]. Generellt hänvisar vi till gällande referensmetodik avseende påvisande av antibiotikaresistenta bakterier (REF) och inget av substraten rekommenderas som referenssubstrat.
 ''VRE:'' I en studie av Malhotra-Kumar et al 2009 presenterades resultaten av en jämförelse mellan fyra olika fasta substrat av vilka två var avsedda för selektiv isolering av glykopeptidresistenta enterokocker från fecesprov. Författarna konkluderade att de selektiva substraten fungerade bra med känslighetsnivåer på 98-99 %. Det skall observeras att nivån av vankomycin är 8 mg/L i flera kromogena substrat för VRE, vilket kan innebära att en del av låggradigt resistenta stammar kan missas med sådana substrat. I [[Vankomycinresistenta enterokocker (VRE), referensmetodik|gällande referensmetodik]] rekommenderas nivån 4 mg/L för optimal känslighet för isolering av enterokocker med ''vanB''-gener.
@@ Rad 72: / Rad 72: @@
 [[Fil:ESBL_013.jpg|thumb|500px|left| Kromogent ESBL-medium (''bioMerieux'') med screeningprov från feces. Två olika kolonityper kan urskiljas (''E. coli'' och ''Enterobacter'' species).'' Foto; Camilla Svensson'']]
-''ESBL, CTX-M och KPC:'' Färdigberedda plattor eller supplement till kromagarfabrikat för påvisning av ESBL-producerande ''Enterobacteriaceae'' finns tillgängliga. Dessa innehåller olika antibiotikablandningar, exempelvis med cefpodoxim som ett av dessa, för att bli selektiva för ESBL-producerande bakterier. I en studie på fecesprover (Glupczynski et al, 2007) jämfördes det selektiva kromogena mediet ESBL-Bx, bioMérieux, med egentillverkade MacConkey-plattor med ceftazidim 2 mg /L. Känsligheten avseende påvisande av ESBL var 97.7 % för ESBL-Bx mot 84.1 % för de egentillverkade plattorna. Kromogena substrat marknadsförs också för selektiv isolering av CTX-M-ESBL. I en studie (Randall et al 2009) rapporteras ett sådant medium ha en känslighet motsvarande 100 % för selektiv isolering av ''Enterobacteriaceae'' med blaCTX-M-gen.
+''ESBL-producerande bakterier:'' Färdigberedda plattor eller supplement till kromagarfabrikat för påvisning av ESBL-producerande ''Enterobacteriaceae'' finns tillgängliga. Dessa innehåller olika antibiotikablandningar, exempelvis med cefpodoxim som ett av dessa, för att bli selektiva för ESBL-producerande bakterier. I en studie på fecesprover (Glupczynski et al, 2007) jämfördes det selektiva kromogena mediet ESBL-Bx, bioMérieux, med egentillverkade MacConkey-plattor med ceftazidim 2 mg /L. Känsligheten avseende påvisande av ESBL var 97.7 % för ESBL-Bx mot 84.1 % för de egentillverkade plattorna. Kromogena substrat marknadsförs också för selektiv isolering av CTX-M-ESBL. I en studie (Randall et al 2009) rapporteras ett sådant medium ha en känslighet motsvarande 100 % för selektiv isolering av ''Enterobacteriaceae'' med bland annat CTX-M-gen.
 Selektiva kromogena substrat för rutinpåvisning av karbapenemasproducerande ''Enterobacteriaceae'' finns men används hittills endast i begränsad omfattning (Perry et al 2011, Vrioni et al 2012). Dessa är ännu inte utvärderade avseende prestanda och behovet för humant bruk. Se också artikeln  [[Screeningmetodik för ESBL]].

@@ Rad 64: / Rad 64: @@
 ====Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov====
-Ett antal kromogena substrat finns tillgängliga för primärisolering och presumtiv identifiering av olika typer av antibiotikaresistens. Dessa baseras på kromogena media som gjorts selektiva genom tillsatts av antibiotika. Substrat finns (2011) för [[MRSA]], [[VRE]], [[Screeningmetodik för ESBL|ESBL]], CTX-M och KPC. Generellt hänvisar vi till gällande referensmetodik avseende påvisande av antibiotikaresistenta bakterier (REF) och inget av substraten rekommenderas som referenssubstrat.
+Ett antal kromogena substrat finns tillgängliga för primärisolering och presumtiv identifiering av olika typer av antibiotikaresistens. Dessa baseras på kromogena media som gjorts selektiva genom tillsats av antibiotika. Substrat finns (2011) för [[MRSA]], [[VRE]], [[Screeningmetodik för ESBL|ESBL]], CTX-M och KPC. Generellt hänvisar vi till gällande referensmetodik avseende påvisande av antibiotikaresistenta bakterier (REF) och inget av substraten rekommenderas som referenssubstrat.
 ''VRE:'' I en studie av Malhotra-Kumar et al 2009 presenterades resultaten av en jämförelse mellan fyra olika fasta substrat av vilka två var avsedda för selektiv isolering av glykopeptidresistenta enterokocker från fecesprov. Författarna konkluderade att de selektiva substraten fungerade bra med känslighetsnivåer på 98-99 %. Det skall observeras att nivån av vankomycin är 8 mg/L i flera kromogena substrat för VRE, vilket kan innebära att en del av låggradigt resistenta stammar kan missas med sådana substrat. I [[Vankomycinresistenta enterokocker (VRE), referensmetodik|gällande referensmetodik]] rekommenderas nivån 4 mg/L för optimal känslighet för isolering av enterokocker med ''vanB''-gener.

@@ Rad 94: / Rad 94: @@
 *14. Malhotra-Kumar, S., et al. Evaluation of culture-based approaches for rapid detection of glycopeptides-resistant enterococci: a randomized, investigator-blinded study. Abstract number 0251. ESCMID 2009
 *15. Randall, L.P., et al. Evaluation of CHROMagar CTX, a novel medium for isolating CTX-M-ESBL-positive Enterobacteriaceae while inhibiting AmpC-producing strains. J Antimicrob Chemother. 2009;63:302-308
 *16. Nakashima, Y., et al. A Chromogenic Substrate Culture Plate for early identification of Vibrio vulnificus and Isolation of other marine Vibrios. Ann Clin Lab Science. 2007;37:330-334
 [[Kategori:Laboratoriediagnostik]]

@@ Rad 74: / Rad 74: @@
 ''ESBL, CTX-M och KPC:'' Färdigberedda plattor eller supplement till kromagarfabrikat för påvisning av ESBL-producerande ''Enterobacteriaceae'' finns tillgängliga. Dessa innehåller olika antibiotikablandningar, exempelvis med cefpodoxim som ett av dessa, för att bli selektiva för ESBL-producerande bakterier. I en studie på fecesprover (Glupczynski et al, 2007) jämfördes det selektiva kromogena mediet ESBL-Bx, bioMérieux, med egentillverkade MacConkey-plattor med ceftazidim 2 mg /L. Känsligheten avseende påvisande av ESBL var 97.7 % för ESBL-Bx mot 84.1 % för de egentillverkade plattorna. Kromogena substrat marknadsförs också för selektiv isolering av CTX-M-ESBL. I en studie (Randall et al 2009) rapporteras ett sådant medium ha en känslighet motsvarande 100 % för selektiv isolering av ''Enterobacteriaceae'' med blaCTX-M-gen.
-Selektiva kromogena substrat för rutinpåvisning av karbapenemasproducerande ''Enterobacteriaceae'' finns men används hittills endast i begränsad omfattning (Perry et al 2011). Dessa är ännu inte utvärderade avseende prestanda och behovet för humant bruk. Se också artikeln  [[Screeningmetodik för ESBL]].
+Selektiva kromogena substrat för rutinpåvisning av karbapenemasproducerande ''Enterobacteriaceae'' finns men används hittills endast i begränsad omfattning (Perry et al 2011, Vrioni et al 2012). Dessa är ännu inte utvärderade avseende prestanda och behovet för humant bruk. Se också artikeln  [[Screeningmetodik för ESBL]].
 ==Länkar==

@@ Rad 65: / Rad 65: @@
 ====Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov====
 Ett antal kromogena substrat finns tillgängliga för primärisolering och presumtiv identifiering av olika typer av antibiotikaresistens. Dessa baseras på kromogena media som gjorts selektiva genom tillsatts av antibiotika. Substrat finns (2011) för [[MRSA]], [[VRE]], [[Screeningmetodik för ESBL|ESBL]], CTX-M och KPC. Generellt hänvisar vi till gällande referensmetodik avseende påvisande av antibiotikaresistenta bakterier (REF) och inget av substraten rekommenderas som referenssubstrat.
-−
 ''VRE:'' I en studie av Malhotra-Kumar et al 2009 presenterades resultaten av en jämförelse mellan fyra olika fasta substrat av vilka två var avsedda för selektiv isolering av glykopeptidresistenta enterokocker från fecesprov. Författarna konkluderade att de selektiva substraten fungerade bra med känslighetsnivåer på 98-99 %. Det skall observeras att nivån av vankomycin är 8 mg/L i flera kromogena substrat för VRE, vilket kan innebära att en del av låggradigt resistenta stammar kan missas med sådana substrat. I [[Vankomycinresistenta enterokocker (VRE), referensmetodik|gällande referensmetodik]] rekommenderas nivån 4 mg/L för optimal känslighet för isolering av enterokocker med ''vanB''-gener.
-−
 ''MRSA:'' Ett antal kromogena substrat för detektion av MRSA finns tillgängliga. Över tid har olika selektiva antibiotika använts i dessa (meticillin, oxacillin, cefoxitin) varvid medier med cefoxitin uppvisat bäst känslighet, vilket möjligen kan förklaras av att den substansen inducerar PBP2´effektivare än de andra. Andra antibiotikakombinationer förekommer också och känsligheten avseende påvisande av MRSA i olika prover är med nyare medier mycket hög (>99 %, Perry and Freydière, 2007).
 [[Fil:ESBL_013.jpg|thumb|500px|left| Kromogent ESBL-medium (''bioMerieux'') med screeningprov från feces. Två olika kolonityper kan urskiljas (''E. coli'' och ''Enterobacter'' species).'' Foto; Camilla Svensson'']]
 ''ESBL, CTX-M och KPC:'' Färdigberedda plattor eller supplement till kromagarfabrikat för påvisning av ESBL-producerande ''Enterobacteriaceae'' finns tillgängliga. Dessa innehåller olika antibiotikablandningar, exempelvis med cefpodoxim som ett av dessa, för att bli selektiva för ESBL-producerande bakterier. I en studie på fecesprover (Glupczynski et al, 2007) jämfördes det selektiva kromogena mediet ESBL-Bx, bioMérieux, med egentillverkade MacConkey-plattor med ceftazidim 2 mg /L. Känsligheten avseende påvisande av ESBL var 97.7 % för ESBL-Bx mot 84.1 % för de egentillverkade plattorna. Kromogena substrat marknadsförs också för selektiv isolering av CTX-M-ESBL. I en studie (Randall et al 2009) rapporteras ett sådant medium ha en känslighet motsvarande 100 % för selektiv isolering av ''Enterobacteriaceae'' med blaCTX-M-gen.
-Selektiva kromogena substrat för rutinpåvisning av karbapenemasproducerande ''Enterobacteriaceae'' finns men används hittills endast i begränsad omfattning (Perry et al 2011). Dessa är ännu inte utvärderade avseende prestanda och behovet för humant bruk.
+Selektiva kromogena substrat för rutinpåvisning av karbapenemasproducerande ''Enterobacteriaceae'' finns men används hittills endast i begränsad omfattning (Perry et al 2011). Dessa är ännu inte utvärderade avseende prestanda och behovet för humant bruk. Se också artikeln  [[Screeningmetodik för ESBL]].
 ==Länkar==

@@ Rad 61: / Rad 61: @@
 ====GBS====
-Fortfarande orsakar GBS ett antal invasiva neonatala early onset-infektioner. Smittan överförs till barnet via vagina hos koloniserade mödrar i samband med förlossningen. Oavsett vilket fast substrat som används för primäridentifieringen skall varje screeningsprov för [[Streptococcus agalactiae (GBS)|GBS]] anrikas i särskild anrikningsbuljong. Olika fasta differentierande substrat finns tillgängliga, bland andra Islam-agar (modifierad som Grananda-medium) som bygger på egenskapen hos hemolytiska GBS-isolat att producera ett orange-färgat pigment. Både sensitivitet och specificitet blir lidande av att ickehemolytiska GBS-isolat inte producerar pigment, varför kromogena substrat för organismerna har utvecklats. Dessa har rapporterats ha högre känslighet än blod-agar och Granada-medium (Roure et al. 2006).
+Fortfarande orsakar GBS ett antal invasiva neonatala early onset-infektioner. Smittan överförs till barnet via vagina hos koloniserade mödrar i samband med förlossningen. Oavsett vilket fast substrat som används för primäridentifieringen skall varje screeningsprov för [[Streptococcus agalactiae (GBS)|GBS]] anrikas i [[Bilaga 1: Substratrecept- Hud, mjukdelar, skelett och inre organ#11.  Selektiv anrikningsbuljong för betahemolyserande streptokocker (här  använd som ”GBS-buljong”)|selektiv anrikningsbuljong]]. Olika fasta differentierande substrat finns tillgängliga, bland andra Islam-agar (modifierad som Grananda-medium) som bygger på egenskapen hos hemolytiska GBS-isolat att producera ett orange-färgat pigment. Både sensitivitet och specificitet blir lidande av att ickehemolytiska GBS-isolat inte producerar pigment, varför kromogena substrat för organismerna har utvecklats. Dessa har rapporterats ha högre känslighet än blod-agar och Granada-medium (Roure et al. 2006).
 ====Kromogena substrat för detektion av antibiotikaresistenta bakterier i kliniska prov====

← Äldre version		Versionen från 30 april 2012 kl. 15.03
Rad 71:		Rad 71:
	''MRSA:'' Ett antal kromogena substrat för detektion av MRSA finns tillgängliga. Över tid har olika selektiva antibiotika använts i dessa (meticillin, oxacillin, cefoxitin) varvid medier med cefoxitin uppvisat bäst känslighet, vilket möjligen kan förklaras av att den substansen inducerar PBP2´effektivare än de andra. Andra antibiotikakombinationer förekommer också och känsligheten avseende påvisande av MRSA i olika prover är med nyare medier mycket hög (>99 %, Perry and Freydière, 2007).		''MRSA:'' Ett antal kromogena substrat för detektion av MRSA finns tillgängliga. Över tid har olika selektiva antibiotika använts i dessa (meticillin, oxacillin, cefoxitin) varvid medier med cefoxitin uppvisat bäst känslighet, vilket möjligen kan förklaras av att den substansen inducerar PBP2´effektivare än de andra. Andra antibiotikakombinationer förekommer också och känsligheten avseende påvisande av MRSA i olika prover är med nyare medier mycket hög (>99 %, Perry and Freydière, 2007).

		+	[[Fil:ESBL_013.jpg\|thumb\|500px\|left\| Kromogent ESBL-medium (''bioMerieux'') med screeningprov från feces. Två olika kolonityper kan urskiljas (''E. coli'' och ''Enterobacter'' species).'' Foto; Camilla Svensson'']]
		+
	''ESBL, CTX-M och KPC:'' Färdigberedda plattor eller supplement till kromagarfabrikat för påvisning av ESBL-producerande ''Enterobacteriaceae'' finns tillgängliga. Dessa innehåller olika antibiotikablandningar, exempelvis med cefpodoxim som ett av dessa, för att bli selektiva för ESBL-producerande bakterier. I en studie på fecesprover (Glupczynski et al, 2007) jämfördes det selektiva kromogena mediet ESBL-Bx, bioMérieux, med egentillverkade MacConkey-plattor med ceftazidim 2 mg /L. Känsligheten avseende påvisande av ESBL var 97.7 % för ESBL-Bx mot 84.1 % för de egentillverkade plattorna. Kromogena substrat marknadsförs också för selektiv isolering av CTX-M-ESBL. I en studie (Randall et al 2009) rapporteras ett sådant medium ha en känslighet motsvarande 100 % för selektiv isolering av ''Enterobacteriaceae'' med blaCTX-M-gen.		''ESBL, CTX-M och KPC:'' Färdigberedda plattor eller supplement till kromagarfabrikat för påvisning av ESBL-producerande ''Enterobacteriaceae'' finns tillgängliga. Dessa innehåller olika antibiotikablandningar, exempelvis med cefpodoxim som ett av dessa, för att bli selektiva för ESBL-producerande bakterier. I en studie på fecesprover (Glupczynski et al, 2007) jämfördes det selektiva kromogena mediet ESBL-Bx, bioMérieux, med egentillverkade MacConkey-plattor med ceftazidim 2 mg /L. Känsligheten avseende påvisande av ESBL var 97.7 % för ESBL-Bx mot 84.1 % för de egentillverkade plattorna. Kromogena substrat marknadsförs också för selektiv isolering av CTX-M-ESBL. I en studie (Randall et al 2009) rapporteras ett sådant medium ha en känslighet motsvarande 100 % för selektiv isolering av ''Enterobacteriaceae'' med blaCTX-M-gen.