Shigella-laboratoriediagnostik - Versionshistorik

Öjar Melefors: /* Tabell 10. Biokemiska referenssubstrat och förväntade resultat efter inkubering i 35-37 °C vid identifiering av Shigella-bakterier */

2014-01-13T09:53:13Z

Tabell 10. Biokemiska referenssubstrat och förväntade resultat efter inkubering i 35-37 °C vid identifiering av Shigella-bakterier

Öjar Melefors: /* Svarsrutiner */

2014-01-13T09:52:11Z

Svarsrutiner

Öjar Melefors: /* Alternativ diagnostik */

2014-01-13T09:51:57Z

Alternativ diagnostik

Magnus Thore: /* Svarsrutiner */

2012-04-28T16:24:47Z

Svarsrutiner

Magnus Thore: /* Identifiering och minimikriterier */

2012-04-23T20:24:32Z

Identifiering och minimikriterier

Magnus Thore den 21 mars 2010 kl. 17.25

2010-03-21T17:25:02Z

Magnus Thore: /* Referenssubstrat */

2009-12-13T18:54:00Z

Referenssubstrat

Magnus Thore: /* Referenssubstrat */

2009-12-13T18:53:41Z

Referenssubstrat

Magnus Thore: /* Referenssubstrat */

2009-12-13T08:59:49Z

Referenssubstrat

Magnus Thore den 8 december 2009 kl. 23.01

2009-12-08T23:01:06Z

@@ Rad 73: / Rad 73: @@
 |''Shigella dysenteriae'', variant 2 || -|| - || - ||- || -||- || -
 |}
-−
 *1) Mannit utan gas i Durhamrör. Enstaka stammar av ''Sh. boydii'' och ''Sh. flexneri'' kan jäsa mannit under gasutveckling. Enstaka stammar av ''Sh. flexneri'', ''Sh. boydii'' och ''Sh. sonnei'' är negativa i mannit.
 *2) Positiv reaktion i endera LD, H<sub>2</sub>S, urea eller oxidas utesluter genus ''Shigella''.
@@ Rad 85: / Rad 85: @@
 Ett isolat som avviker i mer än en reaktion (enligt fotnot 1-4 tabell 10) kan i praktiken uteslutas från genus ''Shigella''.
-Isolat som misstänks vara ''Shigella'' karakteriseras ytterligare med ett kommersiellt testsystem (t.ex. API 20E). Kvarstår därefter misstanke om ''Shigella'', sänds isolatet till SMI för identifiering och typning.
+Isolat som misstänks vara ''Shigella'' karakteriseras ytterligare med ett kommersiellt testsystem (t.ex. API 20E). Kvarstår därefter misstanke om ''Shigella'', sänds isolatet till Folkhälsomyndigheten för identifiering och typning.
-−
 ''Slutlig diagnos'': För identifiering av ''Shigella'' krävs förutom testerna i den primära identifieringen att stammen är negativ i rörlighet och VP. Vidare krävs att bakterier avdödade genom kokning i 2 timmar agglutinerar i monospecifikt antiserum. Anledningen till att agglutinationen skall göras på kokta bakterier är förekomst av ett antal korsreaktioner, med främst'' [[E. coli]]'' där olika proteinantigener är ansvariga. Dessa förstörs genom kokning.
 Vid ett konsensusmöte om fecesdiagnostik i april år 2002 beslutades att alla invasiva bakterier i gråzoonen mellan ''Shigella'' och EIEC, d.v.s jäser som ''Shigella'', har virulensplasmiden men som inte agglutinerar i specifikt antiserum efter kokning, skall betraktas som EIEC och inte som ''Shigella''.
-Det är lämpligt att SMI t.v. handhar den slutliga identifieringen av ''Shigella'' då de samlade erfarenheterna vid SMI, i samarbete med internationella referenslaboratorier, kan komma att påverka framtida klassificering av ''Shigella'', och att stammarna då finns tillgängliga för typning.
+Det är lämpligt att Folkhälsomyndigheten t.v. handhar den slutliga identifieringen av ''Shigella'' då de samlade erfarenheterna vid Folkhälsomyndigheten, i samarbete med internationella referenslaboratorier, kan komma att påverka framtida klassificering av ''Shigella'', och att stammarna då finns tillgängliga för typning.
 === Avvikelser från referensmetodiken ===

@@ Rad 149: / Rad 149: @@
 == Svarsrutiner==
-Svar formuleras enligt laboratoriets rutiner. Vid stark misstanke om ''Shigella'' kan ett preliminärsvar om växt av misstänkt ''Shigella'' anges, samt att isolatet sänts till SMI för verifiering. Efter erhållet svar meddelas detta till inremitterande med angivande av species samt i förekommande fall serotyp. Resistensmönster mot antibiotika skall bifogas preliminärsvaret.
+Svar formuleras enligt laboratoriets rutiner. Vid stark misstanke om ''Shigella'' kan ett preliminärsvar om växt av misstänkt ''Shigella'' anges, samt att isolatet sänts till Folkhälsomyndigheten för verifiering. Efter erhållet svar meddelas detta till inremitterande med angivande av species samt i förekommande fall serotyp. Resistensmönster mot antibiotika skall bifogas preliminärsvaret.
 [[Kategori:Laboratoriediagnostik-Infektioner i mage och tarm]]

@@ Rad 100: / Rad 100: @@
 == Alternativ diagnostik ==
-''Shigella''-liknande bakterier, här definierade som både ''Shigella'' och EIEC, kan med god säkerhet och med stor känslighet identifieras genom påvisande av virulensplasmiden i ett fecesprov. Vid SMI görs detta genom att utodla feces på en MacConkey-platta och därefter analysera utväxta kolonier med PCR.
+''Shigella''-liknande bakterier, här definierade som både ''Shigella'' och EIEC, kan med god säkerhet och med stor känslighet identifieras genom påvisande av virulensplasmiden i ett fecesprov. Vid Folkhälsomyndigheten görs detta genom att utodla feces på en MacConkey-platta och därefter analysera utväxta kolonier med PCR.
@@ Rad 110: / Rad 110: @@
 === Epidemiologisk typning ===
-SMI utför rutinmässigt en begränsad serologisk typning av ''Shigella''. Detta är särskilt viktigt vid misstanke om utbrott och inhemsk smitta. Vid behov kompletteras denna genom typning med bl.a. DNA-baserad metodik.
+Folkhälsomyndigheten utför rutinmässigt en begränsad serologisk typning av ''Shigella''. Detta är särskilt viktigt vid misstanke om utbrott och inhemsk smitta. Vid behov kompletteras denna genom typning med bl.a. DNA-baserad metodik.
 === Kvalitetskontroll och metodkalibrering ===
 Utförs efter de principer som anges under kvalitetssäkring i den allmänna delen
 == Referensstammar ==

@@ Rad 148: / Rad 148: @@
 *''Sh. sonnei'' SoR		(Reagensia AB)
-=== Svarsrutiner ===
+== Svarsrutiner==
 Svar formuleras enligt laboratoriets rutiner. Vid stark misstanke om ''Shigella'' kan ett preliminärsvar om växt av misstänkt ''Shigella'' anges, samt att isolatet sänts till SMI för verifiering. Efter erhållet svar meddelas detta till inremitterande med angivande av species samt i förekommande fall serotyp. Resistensmönster mot antibiotika skall bifogas preliminärsvaret.

@@ Rad 42: / Rad 42: @@
 På DC-agar enligt Hynes växer ''Shigella'' inom två dygn (ca 1/3 av stammarna har inte växt ut efter 1 dygn) med semiopaka, släta eller råa, färglösa (ibland rosa/röda opaka, ''Shigella dysenteriae'' typ 1 kan vara rödlila). Centralt upphöjda (”stekt ägg”) kolonier förekommer.
-Misstänkta kolonier plockas, rensprids på MacConkey-agar och identifieras med testbatteri enligt Tabell 10 efter växt över natten i 35°C - 37°C.
+Misstänkta kolonier plockas, rensprids på MacConkey-agar och identifieras med testbatteri enligt Tabell 10 efter växt över natten i 35°C - 37°C. Testbatteriet definieras i artikeln [[Bilaga 1c. Biokemiska referenssubstrat för testbatteri vid identifiering av bakteriella tarmpatogener]].
 Testbatteriet inkuberas över natten i 35°C - 37°C. Resultatet avläses och tolkas enligt tabell 10.
 === Tabell 10. Biokemiska referenssubstrat och förväntade resultat efter inkubering i 35-37 °C  vid identifiering av ''Shigella''-bakterier ===

← Äldre version		Versionen från 21 mars 2010 kl. 17.25
Rad 5:		Rad 5:

	== Laboratoriediagnostik ==		== Laboratoriediagnostik ==
−	~~[[Shigella-laboratoriediagnostik\|Följ länken för detaljerad information]]~~

	=== Säkerhetsaspekter ===		=== Säkerhetsaspekter ===

@@ Rad 28: / Rad 28: @@
 '''MacConkey-agar''': ''Shigella''-bakterier växer inom ett dygn (GI överstigande 50 %) med konvexa, semiopaka, råa och färglösa kolonier. Inkuberas i 35 °C – 37 °C i ett dygn.
-Ett bra anrikningssubstrat saknas för ''Shigella'' men Selenit-buljong kan anrika särskilt ''Sh. sonnei'' [[Bilaga 1. Bakteriologiska referenssubstrat]].
+Ett bra anrikningssubstrat saknas för ''Shigella'' men Selenit-buljong kan anrika särskilt ''Sh. sonnei'' ([[Bilaga 1. Bakteriologiska referenssubstrat]]).
 === Isolering ===

@@ Rad 18: / Rad 18: @@
 Nedanstående substrat utgör referenssubstrat för isolering av Shigella-bakterier från humana fecesprov (recepten återfinns i [[Bilaga 1. Bakteriologiska referenssubstrat]]).
-Generellt rekommenderas något av de kommersiella halvfabrikat som finns på marknaden. Angående testning av loter och fortlöpande kvalitetskontroll, se [[bilaga 2.2 - substratkontroll]].
+Generellt rekommenderas något av de kommersiella halvfabrikat som finns på marknaden. Angående testning av loter och fortlöpande kvalitetskontroll, se [[Bilaga 2. Bakteriologiska referensmaterial]] om substratkontroll.
 '''XLD-agar:''' ''Shigella''-bakterier växer inom ett dygn med semiopaka, släta och blanka färglösa 0,5-2 mm stora kolonier (framstår röda mot mediets grundfärg). Särskilt ''Shigella sonnei'' kan uppvisa fasvariation inom och mellan kolonier. Råa kolonier med ojämna kanter kan därvid förekomma.

@@ Rad 56: / Rad 56: @@
 |width="100"|'''LD 2)
 |width="100"|'''OD 3)
-|width="100"|'''H2S 2)
+|width="100"|'''H<sub>2</sub>S 2)
 |width="100"|'''ONPG
 |width="100"|'''Indol 4)