Värd-mikroorganism - Versionshistorik

Magnus Thore: /* Virulens */

2010-01-12T15:27:18Z

Virulens

Magnus Thore: /* Mikroorganismer */

2010-01-12T15:26:24Z

Mikroorganismer

Magnus Thore: /* Mikroorganismer */

2010-01-12T15:25:23Z

Mikroorganismer

Magnus Thore: /* Mikroorganismer */

2010-01-12T15:24:28Z

Mikroorganismer

Magnus Thore: /* Mikroorganismer */

2010-01-12T15:22:43Z

Mikroorganismer

Magnus Thore: /* Mikroorganismer */

2010-01-12T15:22:18Z

Mikroorganismer

Magnus Thore: /* Skadepanorama */

2010-01-12T15:21:29Z

Skadepanorama

Magnus Thore: /* Skadepanorama */

2010-01-12T15:20:03Z

Skadepanorama

Magnus Thore: /* Inledning */

2010-01-12T14:56:18Z

Inledning

Magnus Thore den 16 december 2009 kl. 18.08

2009-12-16T18:08:46Z

@@ Rad 66: / Rad 66: @@
 *3.	Föga patogen: Mikroorganism som kan förekomma vid infektion som ensamart eller tillsammans med andra arter i regel endast vid mycket utbredda vävnadsskador, låg syretension, svår lever-, eller njursvikt, eller hos gravt immundefekta individer, t.ex. AIDS, neutropeni < 0,5 x <math>10^9</math>/L.
-Ett förslag till vilka mikroorganismer som klassificerar sig till resp. kategori vid hud- och mjukdelsinfektioner finns i [[Tabell 1. Etiologisk betydelse av olika bakteriella fynd|Tabell 1.]] Vid infektioner i inre organ, urogenitalt, vid skelett- och ledinfektioner samt endokarditer kan en annan indelnings¬grund vara aktuell.
+Ett förslag till vilka mikroorganismer som klassificerar sig till resp. kategori vid hud- och mjukdelsinfektioner finns i [[Tabell 1. Etiologisk betydelse av olika bakteriella fynd|Tabell 1.]] Vid infektioner i inre organ, urogenitalt, vid skelett- och ledinfektioner samt endokarditer kan en annan indelningsgrund vara aktuell.
 I tabellen finns också begreppet ”Prediktivitet”. Det avser här en sannolikhetsbedömning för att det aktuella fyndet kan ha patoetiologisk betydelse. Hög prediktivitet innebär att den framodlade bakterien med stor sannolikhet orsakar infektionen. Låg prediktivitet utesluter inte att bakterien medverkat aktivt i infektionsförloppet men det är mer osäkert om så är fallet.

@@ Rad 51: / Rad 51: @@
 *[[Fil:Hudmjukfigur1.jpg]]
-Illustration av odlingsmetodens detektionsgräns vid polymikrobiell infektion med bakteriestammarna A, B resp. C. Före tidpunkt 1 visar odling växt av stam A och B; under tiden 1-2: stam A; under tiden 2-3: stammarna A och C; efter tidpunkt 3: stam C.
 Infektionsdosen varierar starkt med vävnadens viabilitet och med förekomst av främmande kropp. I Eleks klassiska försök med ''Staphylococcus aureus'' krävdes 7,5x <math>10^6</math> CFU för att åstadkomma infektion i frisk vävnad. Vid närvaro av en silkessutur reducerades dosen 10 000 gånger. En sigmoid dosresponskurva har kunnat påvisas för tarmbakterier inom bukkirurgi, där kontaminationsmängd är starkt korrelerad till infektionsutfall. Transplantation av delhud har angivits som framgångsrik om mängden ej översteg <math>10^5</math> CFU/g. Ett antal studier visar att <math>10^5</math> CFU/g är en gräns som anger att infektionsförsvaret fallerat, och denna mängd måste krympas för att läkning skall ske.

← Äldre version		Versionen från 12 januari 2010 kl. 15.25
Rad 45:		Rad 45:
	Vissa infektionstyper med polymikrobiell genes, t.ex. abscesser och peritonit efter endogent kontaminerad bukkirurgi, har en speciell dynamik. Bakterier som tillväxer snabbare i närvaro av syre reducerar successivt pO<SUB>2</SUB> till fördel för strikt anaeroba bakterier. På så sätt kan en art överväga kvantitativt i ett tidigt skede för att senare stå tillbaka för andra arter. Då odlingssvaret anländer kan därför scenariot vara ett annat ('''Figur 1'''). I försöksmodeller har aeroba och anaeroba bakterier uppvisat synergistiska effekter, vilket har betydelse vid val av antibiotika.		Vissa infektionstyper med polymikrobiell genes, t.ex. abscesser och peritonit efter endogent kontaminerad bukkirurgi, har en speciell dynamik. Bakterier som tillväxer snabbare i närvaro av syre reducerar successivt pO<SUB>2</SUB> till fördel för strikt anaeroba bakterier. På så sätt kan en art överväga kvantitativt i ett tidigt skede för att senare stå tillbaka för andra arter. Då odlingssvaret anländer kan därför scenariot vara ett annat ('''Figur 1'''). I försöksmodeller har aeroba och anaeroba bakterier uppvisat synergistiska effekter, vilket har betydelse vid val av antibiotika.

−	Som framgår av Figur 1 är odlingsresultatet beroende av vid vilken tidpunkt i infektionsförloppet som provet tas och metodens detektionsgräns. Den senare har ett mycket brett konfidensintervall (se provtagning ”[[#Provtagning-klinisk del\|Öppna sår]]” i speciell del). Det är därför uppenbart att kvantitativa bedömningar inte skall anges i odlingssvaret.	+	Som framgår av Figur 1 är odlingsresultatet beroende av vid vilken tidpunkt i infektionsförloppet som provet tas och metodens detektionsgräns. Den senare har ett mycket brett konfidensintervall (se provtagning ”[[Hud och mjukdelar: Provtagning-allmänt#Provtagning-klinisk del\|Öppna sår]]” i speciell del). Det är därför uppenbart att kvantitativa bedömningar inte skall anges i odlingssvaret.

← Äldre version		Versionen från 12 januari 2010 kl. 15.24
Rad 45:		Rad 45:
	Vissa infektionstyper med polymikrobiell genes, t.ex. abscesser och peritonit efter endogent kontaminerad bukkirurgi, har en speciell dynamik. Bakterier som tillväxer snabbare i närvaro av syre reducerar successivt pO<SUB>2</SUB> till fördel för strikt anaeroba bakterier. På så sätt kan en art överväga kvantitativt i ett tidigt skede för att senare stå tillbaka för andra arter. Då odlingssvaret anländer kan därför scenariot vara ett annat ('''Figur 1'''). I försöksmodeller har aeroba och anaeroba bakterier uppvisat synergistiska effekter, vilket har betydelse vid val av antibiotika.		Vissa infektionstyper med polymikrobiell genes, t.ex. abscesser och peritonit efter endogent kontaminerad bukkirurgi, har en speciell dynamik. Bakterier som tillväxer snabbare i närvaro av syre reducerar successivt pO<SUB>2</SUB> till fördel för strikt anaeroba bakterier. På så sätt kan en art överväga kvantitativt i ett tidigt skede för att senare stå tillbaka för andra arter. Då odlingssvaret anländer kan därför scenariot vara ett annat ('''Figur 1'''). I försöksmodeller har aeroba och anaeroba bakterier uppvisat synergistiska effekter, vilket har betydelse vid val av antibiotika.

−	Som framgår av Figur 1 är odlingsresultatet beroende av vid vilken tidpunkt i infektionsförloppet som provet tas och metodens detektionsgräns. Den senare har ett mycket brett konfidensintervall (se provtagning ”[[Öppna sår]]” i speciell del). Det är därför uppenbart att kvantitativa bedömningar inte skall anges i odlingssvaret.	+	Som framgår av Figur 1 är odlingsresultatet beroende av vid vilken tidpunkt i infektionsförloppet som provet tas och metodens detektionsgräns. Den senare har ett mycket brett konfidensintervall (se provtagning ”[[#Provtagning-klinisk del\|Öppna sår]]” i speciell del). Det är därför uppenbart att kvantitativa bedömningar inte skall anges i odlingssvaret.

← Äldre version		Versionen från 12 januari 2010 kl. 15.22
Rad 45:		Rad 45:
	Vissa infektionstyper med polymikrobiell genes, t.ex. abscesser och peritonit efter endogent kontaminerad bukkirurgi, har en speciell dynamik. Bakterier som tillväxer snabbare i närvaro av syre reducerar successivt pO<SUB>2</SUB> till fördel för strikt anaeroba bakterier. På så sätt kan en art överväga kvantitativt i ett tidigt skede för att senare stå tillbaka för andra arter. Då odlingssvaret anländer kan därför scenariot vara ett annat ('''Figur 1'''). I försöksmodeller har aeroba och anaeroba bakterier uppvisat synergistiska effekter, vilket har betydelse vid val av antibiotika.		Vissa infektionstyper med polymikrobiell genes, t.ex. abscesser och peritonit efter endogent kontaminerad bukkirurgi, har en speciell dynamik. Bakterier som tillväxer snabbare i närvaro av syre reducerar successivt pO<SUB>2</SUB> till fördel för strikt anaeroba bakterier. På så sätt kan en art överväga kvantitativt i ett tidigt skede för att senare stå tillbaka för andra arter. Då odlingssvaret anländer kan därför scenariot vara ett annat ('''Figur 1'''). I försöksmodeller har aeroba och anaeroba bakterier uppvisat synergistiska effekter, vilket har betydelse vid val av antibiotika.

−	Som framgår av Figur 1 är odlingsresultatet beroende av vid vilken tidpunkt i infektionsförloppet som provet tas och metodens detektionsgräns. Den senare har ett mycket brett konfidensintervall (se provtagning ~~”Öppna sår”~~ i speciell del). Det är därför uppenbart att kvantitativa bedömningar inte skall anges i odlingssvaret.	+	Som framgår av Figur 1 är odlingsresultatet beroende av vid vilken tidpunkt i infektionsförloppet som provet tas och metodens detektionsgräns. Den senare har ett mycket brett konfidensintervall (se provtagning ”[[Öppna sår]]” i speciell del). Det är därför uppenbart att kvantitativa bedömningar inte skall anges i odlingssvaret.

@@ Rad 43: / Rad 43: @@
 För varje klinisk entitet har byggts upp en kunskap som ger associationer till vissa agens där det första behandlingsförsöket baseras på empiri, d.v.s. en kvalificerad gissning. Kunskap om den endogena mikrofloran är också essentiell för denna bedömning.
-Vissa infektionstyper med polymikrobiell genes, t.ex. abscesser och peritonit efter endogent kontaminerad bukkirurgi, har en speciell dynamik. Bakterier som tillväxer snabbare i närvaro av syre reducerar successivt pO<SUB>2</SUB> till fördel för strikt anaeroba bakterier. På så sätt kan en art överväga kvantitativt i ett tidigt skede för att senare stå tillbaka för andra arter. Då odlingssvaret anländer kan därför scenariot vara ett annat (Figur 1). I försöksmodeller har aeroba och anaeroba bakterier uppvisat synergistiska effekter, vilket har betydelse vid val av antibiotika.
+Vissa infektionstyper med polymikrobiell genes, t.ex. abscesser och peritonit efter endogent kontaminerad bukkirurgi, har en speciell dynamik. Bakterier som tillväxer snabbare i närvaro av syre reducerar successivt pO<SUB>2</SUB> till fördel för strikt anaeroba bakterier. På så sätt kan en art överväga kvantitativt i ett tidigt skede för att senare stå tillbaka för andra arter. Då odlingssvaret anländer kan därför scenariot vara ett annat ('''Figur 1'''). I försöksmodeller har aeroba och anaeroba bakterier uppvisat synergistiska effekter, vilket har betydelse vid val av antibiotika.
 Som framgår av Figur 1 är odlingsresultatet beroende av vid vilken tidpunkt i infektionsförloppet som provet tas och metodens detektionsgräns. Den senare har ett mycket brett konfidensintervall (se provtagning ”Öppna sår” i speciell del). Det är därför uppenbart att kvantitativa bedömningar inte skall anges i odlingssvaret.

@@ Rad 31: / Rad 31: @@
 Formation av biofilm är en utmaning för implantationskirurgin som stimulerat mycket forskning kring nya material. Adhesion av koagulasnegativa stafylokocker via vävnadsproteiner till främmande kropp styrs sannolikt både av specifika och icke-specifika bindningar såsom hydrofobicitet. Den låga metabolismen hos mikroorganismerna och deras "slime"-produktion bidrar också till deras evasiva kapacitet både mot immunförsvar och ev. antibiotika.
-Även vissa hormonella och metabola förändringar som leder till funktionsstörningar lokalt i vävnader eller generellt, är förenade med ökad infektionsrisk. Diabetes mellitus innebär en kraftigt ökad infektionsrisk (se avsnittet ”[[Diabetiska fotsår]]”).
+Även vissa hormonella och metabola förändringar som leder till funktionsstörningar lokalt i vävnader eller generellt, är förenade med ökad infektionsrisk. Diabetes mellitus innebär en kraftigt ökad infektionsrisk (se avsnittet ”[[Ischemiska sår#Diabetiska fotsår (E10.5 eller E11.5)|Diabetiska fotsår]]”).
 Bakteriell translokation föregås av att enterocyternas ”tight junctions” vidgats och bakterier tillåts vandra från tarmlumen genom tarmslemhinnan till lymfa och blod med ev. insådd i traumatiserad vävnad. Detta sker vid svält då enterocyterna utsätts för brist på vissa essentiella aminosyror som endast är tillgängliga via enteral nutrition.

@@ Rad 31: / Rad 31: @@
 Formation av biofilm är en utmaning för implantationskirurgin som stimulerat mycket forskning kring nya material. Adhesion av koagulasnegativa stafylokocker via vävnadsproteiner till främmande kropp styrs sannolikt både av specifika och icke-specifika bindningar såsom hydrofobicitet. Den låga metabolismen hos mikroorganismerna och deras "slime"-produktion bidrar också till deras evasiva kapacitet både mot immunförsvar och ev. antibiotika.
-Även vissa hormonella och metabola förändringar som leder till funktionsstörningar lokalt i vävnader eller generellt, är förenade med ökad infektionsrisk. Diabetes mellitus innebär en kraftigt ökad infektionsrisk (se avsnittet ”Diabetiska fotsår”).
+Även vissa hormonella och metabola förändringar som leder till funktionsstörningar lokalt i vävnader eller generellt, är förenade med ökad infektionsrisk. Diabetes mellitus innebär en kraftigt ökad infektionsrisk (se avsnittet ”[[Diabetiska fotsår]]”).
 Bakteriell translokation föregås av att enterocyternas ”tight junctions” vidgats och bakterier tillåts vandra från tarmlumen genom tarmslemhinnan till lymfa och blod med ev. insådd i traumatiserad vävnad. Detta sker vid svält då enterocyterna utsätts för brist på vissa essentiella aminosyror som endast är tillgängliga via enteral nutrition.
@@ Rad 37: / Rad 37: @@
 Den lokala syretensionen i traumatiserad vävnad har stor betydelse för uppkomst av infektion. Den har sannolikt mindre betydelse för den kontaminerande mikrobens överlevnad, då även strikt anaeroba arter av klinisk valör är aerotoleranta. Mer avgörande är att granulocytens avdödande funktion är beroende av bl.a. respiratory burst activity, vilken är kraftigt försämrad under anaeroba förhållanden och signifikant reducerad redan vid pO<SUB>2</SUB> <30 mmHg.
 Syretensionen är låg i abscesser och kroniska sår. Hög O<SUB>2</SUB>-tensionen och tillgänglighet på tillväxtstimulerande faktor (GSF) är essentiell för celldelning av fibroblaster. Hög läkningstendens ses om pO<SUB>2</SUB>är >40 mm Hg men lägre vid pO<SUB>2</SUB> < 20  mm  Hg. Oretade kroniska sår skall inte odlas eftersom där ofta finns en rikhaltig flora som inte påverkar sårläkning negativt (det finns t.o.m. funderingar på motsatsen). Ett odlingssvar kan då ge den kliniska kollegan en missledande information.
 === Mikroorganismer ===

@@ Rad 11: / Rad 11: @@
 I ett evolutionshistoriskt perspektiv av relationen värd - mikroorganism skulle begreppet 'patogenicitet' förenklat betyda att patogener är sådana mikroorganismer, vars förhållande med värden inte har utvecklat sig till en helt harmonisk relation. Graden av ömsesidig anpassning avgör sannolikheten för kolonisation och eventuell parasitär påverkan vid samexistens.
-Vår ökade kunskap om immunförsvarets betydelse för en välbalanserad jämvikt med mikroorganismer gör det tveksamt att dela upp den mikrobiella världen i patogener och apatogener. Medan den helt friska individen kan drabbas av livshotande septisk sjukdom med ''Streptococcus pyogenes'', d.v.s. Grupp A streptokocker (GAS) i den inflammatoriska överreaktion som bakteriella superantigener utlöser, är det också känt att tillståndet för svårt immunkomprometterade dramatiskt kan försämras genom systeminfektion med alfastreptokocker, som ju normalt räknas till den ordinära floran. Den moderna sepsisforskningen har dessutom visat att mikro¬organismer inte ens behöver vara närvarande för att utlösa s.k. SIRS (Septic Inflammatory Response Syndrome).
+Vår ökade kunskap om immunförsvarets betydelse för en välbalanserad jämvikt med mikroorganismer gör det tveksamt att dela upp den mikrobiella världen i patogener och apatogener. Medan den helt friska individen kan drabbas av livshotande septisk sjukdom med ''Streptococcus pyogenes'', d.v.s. Grupp A streptokocker (GAS) i den inflammatoriska överreaktion som bakteriella superantigener utlöser, är det också känt att tillståndet för svårt immunkomprometterade dramatiskt kan försämras genom systeminfektion med alfastreptokocker, som ju normalt räknas till den ordinära floran. Den moderna sepsisforskningen har dessutom visat att mikroorganismer inte ens behöver vara närvarande för att utlösa s.k. SIRS (Septic Inflammatory Response Syndrome).
 === Värdfaktorer ===

@@ Rad 53: / Rad 53: @@
 Illustration av odlingsmetodens detektionsgräns vid polymikrobiell infektion med bakteriestammarna A, B resp. C. Före tidpunkt 1 visar odling växt av stam A och B; under tiden 1-2: stam A; under tiden 2-3: stammarna A och C; efter tidpunkt 3: stam C.
-Infektionsdosen varierar starkt med vävnadens viabilitet och med förekomst av främmande kropp. I Eleks klassiska försök med ''Staphylococcus aureus'' krävdes 7,5x 10e6 CFU för att åstadkomma infektion i frisk vävnad. Vid närvaro av en silkessutur reducerades dosen 10 000 gånger. En sigmoid dosresponskurva har kunnat påvisas för tarmbakterier inom bukkirurgi, där kontaminationsmängd är starkt korrelerad till infektionsutfall. Transplantation av delhud har angivits som framgångsrik om mängden ej översteg <math>10^5</math> CFU/g. Ett antal studier visar att <math>10^5</math> CFU/g är en gräns som anger att infektionsförsvaret fallerat, och denna mängd måste krympas för att läkning skall ske.
+Infektionsdosen varierar starkt med vävnadens viabilitet och med förekomst av främmande kropp. I Eleks klassiska försök med ''Staphylococcus aureus'' krävdes 7,5x <math>10^6</math> CFU för att åstadkomma infektion i frisk vävnad. Vid närvaro av en silkessutur reducerades dosen 10 000 gånger. En sigmoid dosresponskurva har kunnat påvisas för tarmbakterier inom bukkirurgi, där kontaminationsmängd är starkt korrelerad till infektionsutfall. Transplantation av delhud har angivits som framgångsrik om mängden ej översteg <math>10^5</math> CFU/g. Ett antal studier visar att <math>10^5</math> CFU/g är en gräns som anger att infektionsförsvaret fallerat, och denna mängd måste krympas för att läkning skall ske.
 Frågan är dock inte bara av kvantitativ natur. Vissa mikroorganismer har en infektionspotential även vid lägre koncentration. För ''Streptococcus pyogenes'' anges <math>10^4</math> CFU/g vävnad som tröskelvärde för invasivitet.