Yersinia enterocolitica och Yersinia pseudotuberculosis-laboratoriediagnostik - Versionshistorik

Magnus Thore den 3 november 2013 kl. 10.24

2013-11-03T10:24:48Z

Magnus Thore: /* Identifiering och minimikriterier */

2012-06-19T11:07:24Z

Identifiering och minimikriterier

Magnus Thore: /* Övrig diagnostik */

2012-06-01T16:12:35Z

Övrig diagnostik

Magnus Thore: /* Övrig diagnostik */

2012-04-26T14:56:27Z

Övrig diagnostik

Magnus Thore: /* Övrig diagnostik */

2012-04-26T14:55:23Z

Övrig diagnostik

Magnus Thore: /* Övrig diagnostik */

2012-04-26T14:52:58Z

Övrig diagnostik

Magnus Thore: /* Epidemiologisk typning */

2012-04-26T06:32:17Z

Epidemiologisk typning

Magnus Thore: /* Referenstammar */

2012-04-26T06:29:58Z

Referenstammar

Magnus Thore: /* Tabell 15. Lista över Yersinia-stammar som utgör referensstammar vid kontroll av substrat och övriga diagnostiska procedurer */

2012-04-26T06:29:37Z

Tabell 15. Lista över Yersinia-stammar som utgör referensstammar vid kontroll av substrat och övriga diagnostiska procedurer

Magnus Thore: /* Identifiering och minimikriterier */

2012-04-26T06:28:34Z

Identifiering och minimikriterier

@@ Rad 1: / Rad 1: @@
-'''Artikel uppdaterad april 2012. Innehållet preliminärt i väntan på konsensusförfarande'''
+'''Artikel uppdaterad april 2012'''
 ----
 ''Huvudartikel: [[Yersinia enterocolitica och Yersinia pseudotuberculosis]]''

← Äldre version		Versionen från 19 juni 2012 kl. 11.07
Rad 53:		Rad 53:
	Vid misstanke på ''Yersinia'' enligt utfall enligt tabell 12 kan agglutinationstest i serogrupp-specifikt (O3 och O9) antiserum med bakterier utväxta på MacConkey-agarplattor inkuberade vid 28 °C - 30 °C utföras. Observera att inget O-antigen produceras vid 37 °C . Inte heller VP-reaktionen är positiv vid 37 °C.		Vid misstanke på ''Yersinia'' enligt utfall enligt tabell 12 kan agglutinationstest i serogrupp-specifikt (O3 och O9) antiserum med bakterier utväxta på MacConkey-agarplattor inkuberade vid 28 °C - 30 °C utföras. Observera att inget O-antigen produceras vid 37 °C . Inte heller VP-reaktionen är positiv vid 37 °C.

−	Oavsett resultatet av agglutinationstestet skall ytterligare identifiering ske med kommersiell analysbricka (t.ex. API 20E), vilken inkuberas enligt tillverkarens rekommendationer. Den kommersiella testbrickan skall kompletteras med test för ''eskulinhydrolys'' (om sådan saknas i brickan) t.ex. med ROSCO-tabletter för att särskilja ''Y. enterocolitica'' biotyp 1A, som är eskulinpositiv. Notera att även ''Y. pseudotuberculosis'' är positiv i eskulin. I '''tabell 13''' sammanfattas olika utfall av referenstesterna och i '''tabell 14''' anges ytterligare kriterier (ej minimikriterier).	+	Oavsett resultatet av agglutinationstestet skall ytterligare identifiering ske med kommersiell analysbricka (t.ex. API 20E), vilken inkuberas enligt tillverkarens rekommendationer. Den kommersiella testbrickan skall kompletteras med test för ''eskulinhydrolys'' (om sådan saknas i brickan) t.ex. med ROSCO-tabletter för att särskilja ''Y. enterocolitica'' biotyp 1A, som är eskulinpositiv. Notera att även ''Y. pseudotuberculosis'' är positiv i eskulin. Ett likvärdigt alternativ till eskulintest är pyrazinamidtest som också finns tillgänglig som ROSCO-tabletter. I '''tabell 13''' sammanfattas olika utfall av referenstesterna och i '''tabell 14''' och '''tabell 15''' anges ytterligare kriterier (ej minimikriterier).

← Äldre version		Versionen från 1 juni 2012 kl. 16.12
Rad 125:		Rad 125:


−	[[Fil:~~Yersiniatabell15~~.jpg\|thumb\|center\|700px\| ]]	+	[[Fil:Tabell15yers.jpg\|thumb\|center\|700px\| ]]

← Äldre version		Versionen från 26 april 2012 kl. 14.56
Rad 124:		Rad 124:


−	~~'''Tabell 15.''' Biotypningsschema för ''Y. enterocolitica''~~	+
	[[Fil:Yersiniatabell15.jpg\|thumb\|center\|700px\| ]]		[[Fil:Yersiniatabell15.jpg\|thumb\|center\|700px\| ]]

← Äldre version		Versionen från 26 april 2012 kl. 14.55
Rad 125:		Rad 125:

	'''Tabell 15.''' Biotypningsschema för ''Y. enterocolitica''		'''Tabell 15.''' Biotypningsschema för ''Y. enterocolitica''
−		+	[[Fil:Yersiniatabell15.jpg\|thumb\|center\|700px\| ]]

@@ Rad 124: / Rad 124: @@
-'''Tabell 15.''' Biotypningsschema för Y. enterocolitica
+'''Tabell 15.''' Biotypningsschema för ''Y. enterocolitica''
-        Test         Reaktioner hos olika biotyper                       1A         1B         2         3         4         5             Lipastest (Tween-hydrolys)         +         +         −         −         −         −             Eskulinhydrolys         v         −         −         −         −         −             Indoltest         +         +         (+)         −         −         −             d-xylosfermentation         +         +         +         +         −         v             D-trehalosfermentation         +         +         +         +         +         −             Pyrazinamidas         +         −         −         −         −         −
 Diagnosen ''Yersina''-infektion kan efter en infektion med serotyp O3 även ställas med serologi. Känsligast är en ELISA baserad på lipopolysackarid vilken används vid vissa laboratorier. Serologiska tester som använder avdödade bakterier som antigen finns också.
-−
 ===Epidemiologisk typning===
 Utöver serotypning har en rad molekylära metoder etablerats för epidemiologisk typning t.ex. [[Andra metoder för molekylärepidemiologisk typning|MLST, PFGE]] och [[MLVA]].

@@ Rad 132: / Rad 132: @@
 ===Epidemiologisk typning===
-Utöver serotypning har en rad molekylära metoder etablerats för epidemiologisk typning t.ex. [[MLST]], [[PFGE]] och [[MLVA]].
+Utöver serotypning har en rad molekylära metoder etablerats för epidemiologisk typning t.ex. [[Andra metoder för molekylärepidemiologisk typning|MLST, PFGE]] och [[MLVA]].
 ==Kvalitetskontroll==
 Metodkalibrering förväntas ske efter de principer som skisseras under avsnittet kvalitetssäkring i allmän del.

@@ Rad 137: / Rad 137: @@
 ===Referenstammar===
 '''Tabell 16.''' Lista över ''Yersinia''-stammar som utgör referensstammar vid kontroll av substrat och övriga diagnostiska procedurer
-        Bakterie          CCUG          ATCC          Karakteristika          Växt (1) på CIN              Y.   enterocolitica O3          8 233            Normalvariant,   indol -          >50              Y.   enterocolitica O8          33 055         27 729         Normalvariant,   indol-          >10              Y.   enterocolitica O9         82 39A            Normalvariant,   indol+          >50              Y.   pseudotuberculosis            17 342               >25 (2)
+{|
+|-
-) Avser relative growth index (uttryckt i procent), d.v.s. antalet CFU på testagar x100/antalet CFU på kontrollagar (CLED eller MacConkey), se Bilaga 1.2 sub¬strat-prövning.
+|width="100"|'''Bakterie
-) Efter 2 dygns inkubering.
+|width="80"|'''CCUG
 ===Referensserum===
 ''Yersinia'' O3 och O9 (Reagensia AB)

@@ Rad 149: / Rad 149: @@
 Svar formuleras enligt laboratoriets rutiner. Det skall observeras att isolat av ''Y. enterocolitica'' biotyp 1A generellt inte betraktas som humanpatogen, men vissa stammar kan vara sjukdomsframkallande. Denna biotyp har hittills visats sig vara eskulinpositiva och därför har testning för eskulinhydrolys medtagits i referensmetodiken. Fynd av ''Yersinia enterocolitica'' (utom biotyp 1A) och ''Yersinia pseudotuberculosis'' är anmälningspliktiga.
 [[Kategori:Smittskyddslagens sjukdomar]]
 [[Kategori:Infektioner i mage och tarm]]

@@ Rad 86: / Rad 86: @@
 '''Tabell 14'''. Identifiering av agens motsvarande smittskyddslagens yersinos
-           VP, 22 C          VP, 37 C          Rhamnos          Salicin          Melibios          Sackaros          AA* 22 C          AA 37 C          Pyz**          Oxidas              YE O3          +         -         -          -          -          +          -          +          -          -              YE O9          +         -         -          -          -          +          -          +          -          -              YE 5/27 mm         +         -          -          -          -         +          -         +          -          -              Y.   pseudo          -         -         +          +/-          +          -          -          +             -
+{|
+|-
-* Autoagglutination för påvisande av virulensplasmid, kan ersättas med, CR-MOX-agartest eller specifik PCR
+|width="100"|
-**Pyrazin amidas-test
+|width="80"|'''VP, 22 C
 ====Avvikelser från referensmetodiken====