Yersinia pestis-laboratoriediagnostik - Versionshistorik

Öjar Melefors: /* Kvalitetskontroll */

2014-01-13T11:08:58Z

Kvalitetskontroll

Magnus Thore: /* Kvalitetskontroll */

2012-04-27T11:04:48Z

Kvalitetskontroll

Magnus Thore den 14 april 2012 kl. 11.37

2012-04-14T11:37:47Z

Magnus Thore: /* Allmänt */

2012-04-14T11:35:33Z

Allmänt

Magnus Thore: /* Kvalitetskontroll */

2012-04-14T11:34:06Z

Kvalitetskontroll

Magnus Thore den 8 december 2009 kl. 22.44

2009-12-08T22:44:30Z

Magnus Thore: /* Kvalitetskontroll */

2009-09-15T17:14:56Z

Kvalitetskontroll

Magnus Thore: Skapade sidan med '''Till huvudartikeln Yersinia pestis'' ---- == ''Yersinia pestis'', laboratoriediagnostik == === Allmänt === För laboratoriediagnostik av pest används i första hand o...'

2009-09-15T17:10:51Z

Skapade sidan med '''Till huvudartikeln Yersinia pestis'' ---- == ''Yersinia pestis'', laboratoriediagnostik == === Allmänt === För laboratoriediagnostik av pest används i första hand o...'

Ny sida

''Till huvudartikeln [[Yersinia pestis]]''

----

== ''Yersinia pestis'', laboratoriediagnostik ==

=== Allmänt ===

För laboratoriediagnostik av pest används i första hand odling och serologi. Vid böldpest är blododling positiv i 80 % av fallen.

Odling av pestbakterier och handläggning av prov med specifik frågeställning skall ske i BSL3-laboratorium. Laboratoriepersonal måste skyddas mot hudkontakt och aerosoler.

=== Referensmetodik ===

==== Referenssubstrat ====

Pestbakterier växer på vanliga icke-selektiva rutindiagnostiska substrat.

Vid odling från kontaminerat material som sputum kan CIN-agar med reducerad mängd cefsulodin (4 mg/L) användas.

==== Isolering ====

sker enligt rutiner som används vid referenslaboratoriet. Inkubering sker vid 35 C i sju dagar innan provet rapporteras negativt. Synliga kolonier uppträder efter två dygn.

==== Identifiering och minimikriterier ====

Presumtiv diagnos av ''Y. pestis'' kan erhållas med biokemiska test. Kommersiella testsystem, t.ex. API 20E, kan oftast inte identifiera ''Y. pestis''.

Slutlig verifiering baseras idag på identifiering av specifika virulensgener med PCR samt sekvensering av 16S-rRNA gener. Fynd skickas till annat laboratorium för konfirmering.

Vid CDC används lys med en specifik fag för slutlig identifiering.

=== Övrig diagnostik ===

*Direktmikroskopi med gramfärgning visar gramnegativa stavar med typisk bipolär färgning.
*Direkt FA kan användas för presumtiv närvaro av pestbakterier. Tillgängliga reagenser består av antikroppar riktade mot F1- antigenet. Prov som förvarats i kylskåpstemperatur mer än 30 tim eller odlats vid lägre temperatur än 35 C är negativa liksom prov från loppor.
*Serologi med F1-proteinet som antigen kan användas för sen verifiering.

=== Resistensutveckling och resistensbestämning ===

Positiv erfarenhet av antibiotikabehandling finns för aminoglykosider och tetracykliner. Resistensutveckling är ovanlig.

=== Epidemiologisk typning ===
Utförs ej.

=== Kvalitetskontroll ===

*Referensstam: ''Yersinia pestis'', ATCC 19428.

Växt på använda substrat kontrolleras regelbundet.
Vid identifiering med PCR används positivt och negativt DNA-templat.
[[Kategori:Laboratoriediagnostik-Hud och mjukdelar]]

@@ Rad 49: / Rad 49: @@
 === Kvalitetskontroll ===
-Kvaliteskontroller av  SMI:s odling och nukleinsyrapåvisning sker genom ringtester inom ramen  för [[Forum för   beredskapsdiagnostik]] via [http://www.quandhip.eu/  ''Quandhip''] som är   ett Europeiskt laboratorienätverk för högpatogena   bakterier och virus   (koordineras av Robert Koch- Institut (RKI,  Tyskland) och L.  Spallanzani  National Institute for Infectious  Diseases (INMI),  Italien).
+Kvalitetskontroller av  Folkhälsomyndighetens odling och nukleinsyrapåvisning sker genom ringtester inom ramen  för [[Forum för   beredskapsdiagnostik]] via [http://www.quandhip.eu/  ''Quandhip''] som är   ett Europeiskt laboratorienätverk för högpatogena   bakterier och virus   (koordineras av Robert Koch- Institut (RKI,  Tyskland) och L.  Spallanzani  National Institute for Infectious  Diseases (INMI),  Italien).
 Växt på använda substrat kontrolleras regelbundet.
 [[Kategori:Laboratoriediagnostik-Infektioner i hud och mjukdelar]]

← Äldre version		Versionen från 14 april 2012 kl. 11.37
Rad 1:		Rad 1:
		+	'''Artikel uppdaterd april 2012, innehåll preliminärt i väntan på konsensusförfarande'''
		+	----
	''Till huvudartikeln [[Yersinia pestis]]''		''Till huvudartikeln [[Yersinia pestis]]''

@@ Rad 46: / Rad 46: @@
 === Epidemiologisk typning ===
 Utförs ej.
 === Kvalitetskontroll ===

@@ Rad 9: / Rad 9: @@
 För laboratoriediagnostik av pest används i första hand odling och serologi. Vid böldpest är blododling positiv i 80 % av fallen.
-Odling av pestbakterier och handläggning av prov med specifik frågeställning skall ske i BSL3-laboratorium. Laboratoriepersonal måste skyddas mot hudkontakt och aerosoler.
+Diagnosen kan också ställas med direktpåvisning med PCR exempelvis enligt beskrivning i artikel [[Odling och nukleinsyrapåvisning vid misstanke om riskklass 3-bakterier  i prov]]. Laboratoriepersonal måste skyddas mot hudkontakt och aerosoler.
 === Referensmetodik ===

@@ Rad 22: / Rad 22: @@
 ==== Isolering ====
-sker enligt rutiner som används vid referenslaboratoriet. Inkubering sker vid 35 C i sju dagar innan provet rapporteras negativt. Synliga kolonier uppträder efter två dygn.
+sker enligt rutiner som används vid referenslaboratoriet. Inkubering sker vid 35 °C  i sju dagar innan provet rapporteras negativt. Synliga kolonier uppträder efter två dygn.
@@ Rad 36: / Rad 36: @@
 *Direktmikroskopi med gramfärgning visar gramnegativa stavar med typisk bipolär färgning.
-*Direkt FA kan användas för presumtiv närvaro av pestbakterier. Tillgängliga reagenser består av antikroppar riktade mot F1- antigenet. Prov som förvarats i kylskåpstemperatur mer än 30 tim eller odlats vid lägre temperatur än 35 C är negativa liksom prov från loppor.
+*Direkt FA kan användas för presumtiv närvaro av pestbakterier. Tillgängliga reagenser består av antikroppar riktade mot F1- antigenet. Prov som förvarats i kylskåpstemperatur mer än 30 tim eller odlats vid lägre temperatur än 35 °C  är negativa liksom prov från loppor.
 *Serologi med F1-proteinet som antigen kan användas för sen verifiering.

@@ Rad 52: / Rad 52: @@
 Växt på använda substrat kontrolleras regelbundet.
 Vid identifiering med PCR används positivt och negativt DNA-templat.
-[[Kategori:Laboratoriediagnostik-Hud och mjukdelar]]
+[[Kategori:Laboratoriediagnostik-Infektioner i hud och mjukdelar]]