Skillnad mellan versioner av "Alternativa metoder för svampdiagnostik"
(→PCR) |
|||
| (22 mellanliggande sidversioner av samma användare visas inte) | |||
| Rad 1: | Rad 1: | ||
| + | Artikeln reviderad april 2010 | ||
| + | ---- | ||
| + | |||
| + | |||
''Till innehållsförteckningen för [[Referensmetodik:Svampinfektioner]]'' | ''Till innehållsförteckningen för [[Referensmetodik:Svampinfektioner]]'' | ||
---- | ---- | ||
| Rad 9: | Rad 13: | ||
=== Immunhistokemi === | === Immunhistokemi === | ||
| − | Även om det i de typiska fallen går att morfologiskt skilja mellan | + | Även om det i de typiska fallen går att morfologiskt skilja mellan jästsvamp, mögelbildande askomyceter och zygomyceter kräver detta erfarenhet och i en del fall finns endast ett fåtal svampstrukturer i provmaterialet. En möjlighet att öka säkerheten är att utnyttja specifika antikroppar samt visualisering med hjälp av fluorescerande substanser eller enzymreaktioner. Sådana har framgångsrikt tillämpats av HE Jensen vid Danska Veterinärhögskolan i Köpenhamn. Provmaterial för immunhistokemi kan skickas dit för analys. |
| − | Köpenhamn | ||
=== Metaboliter === | === Metaboliter === | ||
| − | ''C. albicans'' samt flera andra ''Candida''-arter bildar en unik metabolit, D-arabinitol. L-enantiomeren förekommer i ett flertal olika sammanhang, medan D-enantiomeren är specifik för '' | + | ''C. albicans'' samt flera andra ''Candida''-arter bildar en unik metabolit, D-arabinitol. L-enantiomeren förekommer i ett flertal olika sammanhang, medan D-enantiomeren är specifik för de flesta patogena ''Candida''-arter. D/L-arabinitol kvot mäts med gaskromatografi/masspektrometri. Arabinitol utsöndras normalt i urinen. Vid njurinsufficiens ökar såväl D- som L-arabinitol. |
| − | + | Kvoten mellan D- och L-arabinitol ökar såväl i serum som i urin vid infektion med ''C. albicans'' utan att påverkas av njurfunktionen. En förhöjd D/L-arabinitol kvot i urinen är en känslig markör för invasiv candida infektion hos barn med cancer. | |
| − | Kvoten mellan D- och L-arabinitol ökar såväl i serum som i urin vid infektion med ''C. albicans'' utan att påverkas av njurfunktionen. | ||
| − | |||
=== PCR === | === PCR === | ||
| − | + | under revidering | |
| − | |||
=== Antigenpåvisning === | === Antigenpåvisning === | ||
| + | ''Aspergillus''-antigen (galactomannan) från ''A. fumigatus, A. flavus'' eller ''A. niger'' kan påvisas med Platelia Aspergillus EIA-kit (BioRad) som har en känslighet på 1 ng/mL. Testet har visat varierande sensitivitet i olika patientpopulationer. För vuxna patienter med risk för invasiv ''Aspergillus''-infektion har 97% sensitivitet och 91% specificitet rapporterats för analys i serum. ''Aspergillus''-antigen kan analyseras i serum och likvor (gränsvärde för ett positivt test => 0,5) och BAL (gränsvärde för ett positivt test => 1,0). Falskt positiva analysresultat har rapporterats i samband med piperacillin-tazobactam eller amoxicillin-clavulansyra behandling. Galactomannan har också påvisats i mat och näringslösningar. | ||
| − | ''Candida''-antigen kan ibland påvisas i blodet vid disseminerad candidos. Olika antigener från ''Candida''-cellen förekommer men mest pålitligt för diagnostik är mannanantigen. Kommersiellt finns tillgängligt ett | + | ''Candida''-antigen kan ibland påvisas i blodet vid disseminerad candidos. Olika antigener från ''Candida''-cellen förekommer men mest pålitligt för diagnostik är mannanantigen. Kommersiellt finns tillgängligt ett Platelia ''Candida'' ag EIA-kit (Bio-Rad) som påvisar ''Candida''-mannan i serum. Gränsvärde för positivt test är 0,5 ng/mL. Mannan från arterna ''C. albicans, C.tropicalis, C.glabrata, C.parapsilosis'' och ''C. krusei'' kan detekteras. När ''Candida''-antigen detektion har kombinerats med antikroppspåvisning med Platelia ''Candida'' AB/AC/AK kit har sensitivitet och specificitet rapporterats till 83% respektive 78%. |
| − | + | ''Cryptococcus''-antigen (glucuronoxylomannan från kapseln) påvisas med känsliga och specifika latextest. Det finns flera fullgoda kits av olika fabrikat på marknaden. Meridian Crypto LA-test system är känsligt och specifikt. Detektionsnivån för antigen är ca 50 ng/mL. Sensitivitet mellan 93 och 100 % och specificitet 93 till 98 % har rapporterats gentemot odling. Förbehandling av serum med pronas höjer sensitiviteten och skall utföras enligt missivet. Kapselsubstans från ''C. neoformans'' förekommer rikligt i CSF eller serum vid infektion. Antigenet kan ibland påvisas i urin hos AIDS-patienter. ''Trichosporon''-arter har rapporterats kunna korsreagera. | |
| − | |||
| − | ''Cryptococcus''-antigen (glucuronoxylomannan från kapseln) påvisas med känsliga och specifika latextest. Det finns flera fullgoda kits av olika fabrikat på marknaden | ||
| + | Antigenpåvisning av ''Histoplasma'' (kvantitativt), ''Blastomyces'', och ''Coccidioides'' (kvantitativt) utförs vid MiraVista Diagnostics (Indianapolis, USA). Följande provmaterial (2 mL) kan skickas för analys med MVista antigen detektionstest: serum, plasma, likvor, BAL och andra sterila kroppsvätskor. Provmaterial ska förvaras och skickas i rumstemperatur. För ytterligare information se [http://www.miravistalabs.com MiraVista Diagnostics] | ||
=== Antikroppstester === | === Antikroppstester === | ||
| Rad 37: | Rad 37: | ||
Immunelektroosmofores (IEOP) lämpar sig för påvisande av precipiterande antikroppar mot olika svampar. | Immunelektroosmofores (IEOP) lämpar sig för påvisande av precipiterande antikroppar mot olika svampar. | ||
| − | Precipiterande antikroppar mot ''Aspergillus fumigatus, A. flavus'', ''A. niger'' eller'' A. terreus'' kan påvisas t.ex. med IEOP vid ''Aspergillus''-infektioner, främst pulmonella infektioner av icke-akut karaktär. Även aspergillom och kolonisation vid t.ex. [[Cystisk fibros-CF|cystisk fibros]] ger upphov till precipitat. IgE- och IgG-antikroppar påvisas vid allergisk aspergillos. | + | Precipiterande IgG antikroppar mot ''Aspergillus fumigatus, A. flavus'', ''A. niger'', ''A. nidulans'' eller'' A. terreus'' kan påvisas t.ex. med IEOP vid ''Aspergillus''-infektioner, främst pulmonella infektioner av icke-akut karaktär. Även aspergillom och kolonisation vid t.ex. [[Cystisk fibros-CF|cystisk fibros]] ger upphov till precipitat. IgE- och IgG-antikroppar påvisas vid allergisk aspergillos. |
| − | Antikroppar mot ''Histoplasma, Blastomyces'' (dessa korsreagerar i många system),''Coccidioides | + | Antikroppar mot ''Histoplasma, Blastomyces'' (dessa korsreagerar i många system), ''Coccidioides'' och ''Paracoccidioides'' kan också påvisas med IEOP (klinisk mikrobiologi, Karolinska universitetslaboratoriet, [[8. Adresser-svamp|bilaga 8]]). |
== REFERENSER == | == REFERENSER == | ||
| − | *Ainscough S, Kibbler CC. An evaluation of the cost-effectiveness of using CHROMagar for yeast identification in a routine microbiology laboratory. J Med Microbiol 1998;47:623-628. | + | *Ainscough S, Kibbler CC. An evaluation of the cost-effectiveness of using CHROMagar for yeast identification in a routine microbiology laboratory. J Med Microbiol 1998;47:623-628. |
| + | |||
| + | *Arendrup MC, Bergmann OJ, Larsson L. et al. Detection of candidemia in patients with and without underlying haematological disease. Clin Microbiol Infect 2010 | ||
*Christensson B, Wiebe T, Pehrson C, Larsson L. Diagnosis of invasive candidiasis in neutropenic children with cancer by determination of D-arabinitol/L-arabinitol ratios in urine. J Clin Microbiol 1997;35:636-640. | *Christensson B, Wiebe T, Pehrson C, Larsson L. Diagnosis of invasive candidiasis in neutropenic children with cancer by determination of D-arabinitol/L-arabinitol ratios in urine. J Clin Microbiol 1997;35:636-640. | ||
| − | |||
| − | |||
*Evans EGV, Richardson MD. General guidelines on laboratory diagnosis. i EGV Evans & MD Richardson. Medical mycology a practical approach sid 4. IRL Press at Oxford University Press, 1989. | *Evans EGV, Richardson MD. General guidelines on laboratory diagnosis. i EGV Evans & MD Richardson. Medical mycology a practical approach sid 4. IRL Press at Oxford University Press, 1989. | ||
| − | * | + | *Jensen HE, Salonen J, Ekfors TO. The use of immunohistochemistry to improve sensitivity and specificity in the diagnosis of systemic mycoses in patients with haematological malignancies. J Pathol 1997;1:100-105. |
| − | * | + | *Maertens JA, Klont R, Masson C. et al. Optimization of the cutoff value for the Aspergillus double-sandwich enzyme immunoassay. Clin Infect Dis 2007;44:1329-1336. |
| − | |||
| − | |||
*Milne LJR, Direct microscopy. i EGV Evans & MD Richardson. Medical mycology a practical approach sid 19. IRL Press at Oxford University Press, 1989. | *Milne LJR, Direct microscopy. i EGV Evans & MD Richardson. Medical mycology a practical approach sid 19. IRL Press at Oxford University Press, 1989. | ||
| − | |||
| − | |||
*Tanner DC, Weinstein M P, Fedorciw B et al. Comparison of commercial kits for detection of cryptococcal antigen. J Clin Microbiol 1994;32:1680-1684. | *Tanner DC, Weinstein M P, Fedorciw B et al. Comparison of commercial kits for detection of cryptococcal antigen. J Clin Microbiol 1994;32:1680-1684. | ||
Nuvarande version från 9 juni 2010 kl. 12.10
Artikeln reviderad april 2010
Till innehållsförteckningen för Referensmetodik:Svampinfektioner
Alternativa metoder för svampdiagnostik[redigera]
Immunhistokemi[redigera]
Även om det i de typiska fallen går att morfologiskt skilja mellan jästsvamp, mögelbildande askomyceter och zygomyceter kräver detta erfarenhet och i en del fall finns endast ett fåtal svampstrukturer i provmaterialet. En möjlighet att öka säkerheten är att utnyttja specifika antikroppar samt visualisering med hjälp av fluorescerande substanser eller enzymreaktioner. Sådana har framgångsrikt tillämpats av HE Jensen vid Danska Veterinärhögskolan i Köpenhamn. Provmaterial för immunhistokemi kan skickas dit för analys.
Metaboliter[redigera]
C. albicans samt flera andra Candida-arter bildar en unik metabolit, D-arabinitol. L-enantiomeren förekommer i ett flertal olika sammanhang, medan D-enantiomeren är specifik för de flesta patogena Candida-arter. D/L-arabinitol kvot mäts med gaskromatografi/masspektrometri. Arabinitol utsöndras normalt i urinen. Vid njurinsufficiens ökar såväl D- som L-arabinitol. Kvoten mellan D- och L-arabinitol ökar såväl i serum som i urin vid infektion med C. albicans utan att påverkas av njurfunktionen. En förhöjd D/L-arabinitol kvot i urinen är en känslig markör för invasiv candida infektion hos barn med cancer.
PCR[redigera]
under revidering
Antigenpåvisning[redigera]
Aspergillus-antigen (galactomannan) från A. fumigatus, A. flavus eller A. niger kan påvisas med Platelia Aspergillus EIA-kit (BioRad) som har en känslighet på 1 ng/mL. Testet har visat varierande sensitivitet i olika patientpopulationer. För vuxna patienter med risk för invasiv Aspergillus-infektion har 97% sensitivitet och 91% specificitet rapporterats för analys i serum. Aspergillus-antigen kan analyseras i serum och likvor (gränsvärde för ett positivt test => 0,5) och BAL (gränsvärde för ett positivt test => 1,0). Falskt positiva analysresultat har rapporterats i samband med piperacillin-tazobactam eller amoxicillin-clavulansyra behandling. Galactomannan har också påvisats i mat och näringslösningar.
Candida-antigen kan ibland påvisas i blodet vid disseminerad candidos. Olika antigener från Candida-cellen förekommer men mest pålitligt för diagnostik är mannanantigen. Kommersiellt finns tillgängligt ett Platelia Candida ag EIA-kit (Bio-Rad) som påvisar Candida-mannan i serum. Gränsvärde för positivt test är 0,5 ng/mL. Mannan från arterna C. albicans, C.tropicalis, C.glabrata, C.parapsilosis och C. krusei kan detekteras. När Candida-antigen detektion har kombinerats med antikroppspåvisning med Platelia Candida AB/AC/AK kit har sensitivitet och specificitet rapporterats till 83% respektive 78%.
Cryptococcus-antigen (glucuronoxylomannan från kapseln) påvisas med känsliga och specifika latextest. Det finns flera fullgoda kits av olika fabrikat på marknaden. Meridian Crypto LA-test system är känsligt och specifikt. Detektionsnivån för antigen är ca 50 ng/mL. Sensitivitet mellan 93 och 100 % och specificitet 93 till 98 % har rapporterats gentemot odling. Förbehandling av serum med pronas höjer sensitiviteten och skall utföras enligt missivet. Kapselsubstans från C. neoformans förekommer rikligt i CSF eller serum vid infektion. Antigenet kan ibland påvisas i urin hos AIDS-patienter. Trichosporon-arter har rapporterats kunna korsreagera.
Antigenpåvisning av Histoplasma (kvantitativt), Blastomyces, och Coccidioides (kvantitativt) utförs vid MiraVista Diagnostics (Indianapolis, USA). Följande provmaterial (2 mL) kan skickas för analys med MVista antigen detektionstest: serum, plasma, likvor, BAL och andra sterila kroppsvätskor. Provmaterial ska förvaras och skickas i rumstemperatur. För ytterligare information se MiraVista Diagnostics
Antikroppstester[redigera]
Immunelektroosmofores (IEOP) lämpar sig för påvisande av precipiterande antikroppar mot olika svampar.
Precipiterande IgG antikroppar mot Aspergillus fumigatus, A. flavus, A. niger, A. nidulans eller A. terreus kan påvisas t.ex. med IEOP vid Aspergillus-infektioner, främst pulmonella infektioner av icke-akut karaktär. Även aspergillom och kolonisation vid t.ex. cystisk fibros ger upphov till precipitat. IgE- och IgG-antikroppar påvisas vid allergisk aspergillos.
Antikroppar mot Histoplasma, Blastomyces (dessa korsreagerar i många system), Coccidioides och Paracoccidioides kan också påvisas med IEOP (klinisk mikrobiologi, Karolinska universitetslaboratoriet, bilaga 8).
REFERENSER[redigera]
- Ainscough S, Kibbler CC. An evaluation of the cost-effectiveness of using CHROMagar for yeast identification in a routine microbiology laboratory. J Med Microbiol 1998;47:623-628.
- Arendrup MC, Bergmann OJ, Larsson L. et al. Detection of candidemia in patients with and without underlying haematological disease. Clin Microbiol Infect 2010
- Christensson B, Wiebe T, Pehrson C, Larsson L. Diagnosis of invasive candidiasis in neutropenic children with cancer by determination of D-arabinitol/L-arabinitol ratios in urine. J Clin Microbiol 1997;35:636-640.
- Evans EGV, Richardson MD. General guidelines on laboratory diagnosis. i EGV Evans & MD Richardson. Medical mycology a practical approach sid 4. IRL Press at Oxford University Press, 1989.
- Jensen HE, Salonen J, Ekfors TO. The use of immunohistochemistry to improve sensitivity and specificity in the diagnosis of systemic mycoses in patients with haematological malignancies. J Pathol 1997;1:100-105.
- Maertens JA, Klont R, Masson C. et al. Optimization of the cutoff value for the Aspergillus double-sandwich enzyme immunoassay. Clin Infect Dis 2007;44:1329-1336.
- Milne LJR, Direct microscopy. i EGV Evans & MD Richardson. Medical mycology a practical approach sid 19. IRL Press at Oxford University Press, 1989.
- Tanner DC, Weinstein M P, Fedorciw B et al. Comparison of commercial kits for detection of cryptococcal antigen. J Clin Microbiol 1994;32:1680-1684.