Skillnad mellan versioner av "Bilaga 5 Hantering av riskklass 3-patogener-NLI"
Hoppa till navigering
Hoppa till sök
(17 mellanliggande sidversioner av samma användare visas inte) | |||
Rad 10: | Rad 10: | ||
---- | ---- | ||
− | |||
− | |||
− | |||
[[Kategori:Laboratoriediagnostik-Nedre luftvägsinfektioner]] | [[Kategori:Laboratoriediagnostik-Nedre luftvägsinfektioner]] | ||
Rad 18: | Rad 15: | ||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
|- | |- | ||
− | ! Agens, | + | ! Agens, Riskklass<br /> |
(de riskklass 3 agens som | (de riskklass 3 agens som | ||
betecknas med (**) innebär normalt inte risk för luftburen smitta) | betecknas med (**) innebär normalt inte risk för luftburen smitta) | ||
− | ! | + | !Riskfyllda att hantera vid rutinmässigt odlingsförfarande !! Kliniska/epidemilogiska uppgifter !! Fynd på lab (utseende, biokemi etc) som ger misstanke om detta fynd |
|- | |- | ||
− | | '''BAKTERIER''' || | + | | '''BAKTERIER''' || || || |
|- | |- | ||
− | |''Bacillus anthracis'' 3 || X || Antrax, mjältbrand || Grampositiva stavar. Växer på blod- och chokladagar, aerobt och anaerobt. Lectinasbildare. Ej (eller svag) β-hemolys. PcG-känslig. | + | |''[[Bacillus anthracis]]'' 3 || X || Antrax, mjältbrand || Grampositiva stavar. Växer på blod- och chokladagar, aerobt och anaerobt. Lectinasbildare. Ej (eller svag) β-hemolys. PcG-känslig. |
|- | |- | ||
− | | ''Brucella abortus'' 3 || X || Brucellos (undulantfeber, maltafeber) || Mycket små Gramnegativa kockobaciller ("fin sand").Växer långsamt på standardmedier i 5-10 % CO<sub>2</sub>. | + | | ''[[Brucella abortus]]'' 3 || X || Brucellos (undulantfeber, maltafeber) || Mycket små Gramnegativa kockobaciller ("fin sand"). Växer långsamt på standardmedier i 5-10 % CO<sub>2</sub>. Oxidaspositiv (''B. canis'' varierar). Orörlig. Ureaspositiv på 1 timme vid tjockt inokulat i Christensens ureaagar. |
|- | |- | ||
− | | ''Brucella canis'' 3 || X || Brucellos (undulantfeber, maltafeber) || | + | | ''[[Brucella canis]]'' 3 || X || Brucellos (undulantfeber, maltafeber) || se ovan |
|- | |- | ||
− | | ''Brucella melitensis'' 3 || X | + | | ''[http://Brucella%20melitensis Brucella melitensis]'' 3 || X || Brucellos (undulantfeber, maltafeber) || se ovan |
|- | |- | ||
− | | ''Brucella suis'' 3 || X || Brucellos (undulantfeber, maltafeber) || | + | | ''[[Brucella suis]]'' 3 || X || Brucellos (undulantfeber, maltafeber) || se ovan |
|- | |- | ||
− | | ''Burkholderia mallei'' (Pseudomonas mallei) 3 || X || Glanders, rots || | + | | ''[[Burkholderia mallei]]'' (Pseudomonas mallei) 3 || X || Glanders, rots || Gramnegativa stavar. Växer på standardmedier. Oxidas varierar. Svårtypad. Förekommer hos bl.a. hästar. |
|- | |- | ||
− | | ''Burkholderia pseudomallei'' (Pseudomonas pseudomallei) 3 || X || Melioidos. Förekommer i tropiska och subtropiska områden, ffa i Sydostasien och norra Australien. || | + | | ''[[Burkholderia pseudomallei]]'' (Pseudomonas pseudomallei) 3 || X || Melioidos. Förekommer i tropiska och subtropiska områden, ffa i Sydostasien och norra Australien. || Gramnegativa stavar. Växer på standardmedier. Oxidaspositiv. Växer på MacConkey. Svårtypad. Epidemiologi viktig! |
|- | |- | ||
− | | ''Chlamydophila psittaci'' (fågelassocierade stammar) 3 || | + | | ''[[Chlamydophila psittaci]]'' (fågelassocierade stammar) 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Coxiella burnetii'' 3 || | + | | ''[[Coxiella burnetii]]'' 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Escherichia coli'' | + | | ''[[Escherichia coli]]'' verotoxigena stammar (t.ex. O157:H7 eller O103) 3 (**) || || Blodig diarre || Typiskt utseende på Smac-agarplatta. |
|- | |- | ||
− | | ''Francisella tularensis'' 3 || X || Tularemi, harpest. Insektsbett. Prov från svullen lymfkörtel. || | + | | ''[[Francisella tularensis]]'' 3 || X || Tularemi, harpest. Insektsbett. Prov från svullen lymfkörtel. || Aerob. Långsamväxande (oftast p.g.a. litet inokulat) på bl.a. chokladagar. Gramnegativa kockobaciller. Oxidasnegativ. TSI-negativ. Kan växa vid förlängd odling. |
|- | |- | ||
− | | ''Mycobacterium africanum'' 3 || | + | | ''[[Mycobacterium africanum]]'' 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Mycobacterium bovis'' (utom BCG-stam) 3 || | + | | ''[[Mycobacterium bovis]]'' (utom BCG-stam) 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Mycobacterium leprae'' 3 || | + | | ''[[Mycobacterium leprae]]'' 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Mycobacterium microti'' 3 (**) || | + | | ''[[Mycobacterium microti]]'' 3 (**) || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Mycobacterium tuberculosis'' 3 || | + | | ''[[Mycobacterium tuberculosis]]'' 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Mycobacterium ulcerans'' 3 (**) || | + | | ''[[Mycobacterium ulcerans]]'' 3 (**) || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Orientia tsutsugamushi'' 3 | + | | ''[[Orientia tsutsugamushi]]'' 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Rickettsia akari'' 3 (**) || | + | | ''[[Rickettsia akari]]'' 3 (**) || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Rickettsia canada'' 3 (**) || | + | | ''[[Rickettsia canada]]'' 3 (**) || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Rickettsia | + | | ''[[Rickettsia conorii]]'' 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Rickettsia montana'' 3 (**) || | + | | ''[[Rickettsia montana]]'' 3 (**) || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Rickettsia typhi'' (Rickettsia mooseri) 3 || | + | | ''[[Rickettsia typhi]]'' (Rickettsia mooseri) 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Rickettsia prowazekii'' 3 || | + | | ''[[Rickettsia prowazekii]]'' 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Rickettsia | + | | ''[[Rickettsia ricketsii]]'' 3 || || || Växer ej i rutinodling |
|- | |- | ||
− | | ''Salmonella'' Typhi 3 (**) || | + | | ''[[Salmonella]]'' Typhi 3 (**) || || Tyfoidfeber || Rutinjäsning |
|- | |- | ||
− | | ''Shigella dysenteriae'' (Typ 1) 3 (**) || | + | | ''[[Shigella dysenteriae]]'' (Typ 1) 3 (**) || || Rödsot || Rutinjäsning |
|- | |- | ||
− | | ''Yersinia pestis'' 3 || X || | + | | ''[[Yersinia pestis]]'' 3 || X || Böldpest, lungpest, pest, plague. || Laktosnegativ Gramnegativ stav. Växer med nålspetsstora kolonier efter 1 dygn. |
|- | |- | ||
− | | '''SVAMP''' || | + | | '''SVAMP''' || || || |
|- | |- | ||
− | | ''Blastomyces dermatitidis (Ajellomyces dermatitidis) 3 || X || | + | | ''[[Blastomyces dermatitidis]]'' (Ajellomyces dermatitidis) 3 || X || Blastomykos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Förekommer ffa längs floder i USA men även i Sydamerika och Afrika. || Vid inkubering i 35-37°C är det osannolikt att den höggradigt smittsamma mögelfasen växer. Då växer den som jäst, vilken ej är lika smittsam. Den kan dock smitta vid hantering på laboratoriet om aerosol bildas eller vid perkutan injektion. Dimorfa svampar behöver dessutom sannolikt >10 dagars inkubering. Atypiskt mögel som växer i 25-30°C bör föranleda kontakt med laboratorium med erfarenhet av dimorfa svampar. |
|- | |- | ||
− | | ''Coccodioides immitis'' 3 || X || | + | | ''[[Coccodioides immitis]]'' 3 || X || Coccidioidomykos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Förekommer i USA, Mellan- och Sydamerika. || se ovan |
|- | |- | ||
− | | '' Histoplasma capsulatum'' var. capsulatum (Ajellomyces capsulatus) 3 || X || | + | | '' [[Histoplasma capsulatum]]'' var. capsulatum (Ajellomyces capsulatus) 3 || X || Histoplasmos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Kontakt med kväverik jord, gödsel från fåglar och fladdermöss, framför allt längs stora floder i USA. || se ovan |
|- | |- | ||
− | | '' Histoplasma capsulatum'' var. duboisii 3 || X || | + | | '' [[Histoplasma capsulatum]]'' var. duboisii 3 || X || Histoplasmos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Centralafrika. || se ovan |
|- | |- | ||
− | | ''Paracoccidioides brasiliensis'' 3 || X || | + | | ''[[Paracoccidioides brasiliensis]]'' 3 || X || Paracoccidioidomykos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Central- och Sydamerika. || se ovan |
|- | |- | ||
− | | ''Cladophialophora bantiana'' (tidigare: ''Xylohypha bantiana'', ''Cladosporium bantianum'' eller ''trichoides'') 3 || X || | + | | ''[[Cladophialophora bantiana]]'' (tidigare: ''Xylohypha bantiana'', ''Cladosporium bantianum'' eller ''trichoides'') 3 || X || Cerebral feohyfomykos. Jordmögel som visar neurotropism. Inväxt eller hematogen spridning. Förekommer i hela världen men är ovanlig i Norden. || Konidiebildande mögel som växer bäst vid 42°C. |
− | | | ||
|} | |} |
Nuvarande version från 23 april 2012 kl. 09.08
Till innehållsförteckningen för Nedre luftvägsinfektioner inklusive mykobakteriologisk diagnostik, 2:a upplagan 2005
och
Referensmetodik:Smittskyddslagens sjukdomar
Bilaga till artikeln Omhändertagande av kliniska prov samt framodlade mikroorganismer med särskild hänsyn till förekomst av riskklass 3 och 4 patogener
Agens, Riskklass (de riskklass 3 agens som betecknas med (**) innebär normalt inte risk för luftburen smitta) |
Riskfyllda att hantera vid rutinmässigt odlingsförfarande | Kliniska/epidemilogiska uppgifter | Fynd på lab (utseende, biokemi etc) som ger misstanke om detta fynd |
---|---|---|---|
BAKTERIER | |||
Bacillus anthracis 3 | X | Antrax, mjältbrand | Grampositiva stavar. Växer på blod- och chokladagar, aerobt och anaerobt. Lectinasbildare. Ej (eller svag) β-hemolys. PcG-känslig. |
Brucella abortus 3 | X | Brucellos (undulantfeber, maltafeber) | Mycket små Gramnegativa kockobaciller ("fin sand"). Växer långsamt på standardmedier i 5-10 % CO2. Oxidaspositiv (B. canis varierar). Orörlig. Ureaspositiv på 1 timme vid tjockt inokulat i Christensens ureaagar. |
Brucella canis 3 | X | Brucellos (undulantfeber, maltafeber) | se ovan |
Brucella melitensis 3 | X | Brucellos (undulantfeber, maltafeber) | se ovan |
Brucella suis 3 | X | Brucellos (undulantfeber, maltafeber) | se ovan |
Burkholderia mallei (Pseudomonas mallei) 3 | X | Glanders, rots | Gramnegativa stavar. Växer på standardmedier. Oxidas varierar. Svårtypad. Förekommer hos bl.a. hästar. |
Burkholderia pseudomallei (Pseudomonas pseudomallei) 3 | X | Melioidos. Förekommer i tropiska och subtropiska områden, ffa i Sydostasien och norra Australien. | Gramnegativa stavar. Växer på standardmedier. Oxidaspositiv. Växer på MacConkey. Svårtypad. Epidemiologi viktig! |
Chlamydophila psittaci (fågelassocierade stammar) 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Coxiella burnetii 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Escherichia coli verotoxigena stammar (t.ex. O157:H7 eller O103) 3 (**) | Blodig diarre | Typiskt utseende på Smac-agarplatta. | |
Francisella tularensis 3 | X | Tularemi, harpest. Insektsbett. Prov från svullen lymfkörtel. | Aerob. Långsamväxande (oftast p.g.a. litet inokulat) på bl.a. chokladagar. Gramnegativa kockobaciller. Oxidasnegativ. TSI-negativ. Kan växa vid förlängd odling. |
Mycobacterium africanum 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Mycobacterium bovis (utom BCG-stam) 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Mycobacterium leprae 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Mycobacterium microti 3 (**) | Växer ej i rutinodling | ||
Mycobacterium tuberculosis 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Mycobacterium ulcerans 3 (**) | Växer ej i rutinodling | ||
Orientia tsutsugamushi 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Rickettsia akari 3 (**) | Växer ej i rutinodling | ||
Rickettsia canada 3 (**) | Växer ej i rutinodling | ||
Rickettsia conorii 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Rickettsia montana 3 (**) | Växer ej i rutinodling | ||
Rickettsia typhi (Rickettsia mooseri) 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Rickettsia prowazekii 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Rickettsia ricketsii 3 | Växer ej i rutinodling | ||
Salmonella Typhi 3 (**) | Tyfoidfeber | Rutinjäsning | |
Shigella dysenteriae (Typ 1) 3 (**) | Rödsot | Rutinjäsning | |
Yersinia pestis 3 | X | Böldpest, lungpest, pest, plague. | Laktosnegativ Gramnegativ stav. Växer med nålspetsstora kolonier efter 1 dygn. |
SVAMP | |||
Blastomyces dermatitidis (Ajellomyces dermatitidis) 3 | X | Blastomykos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Förekommer ffa längs floder i USA men även i Sydamerika och Afrika. | Vid inkubering i 35-37°C är det osannolikt att den höggradigt smittsamma mögelfasen växer. Då växer den som jäst, vilken ej är lika smittsam. Den kan dock smitta vid hantering på laboratoriet om aerosol bildas eller vid perkutan injektion. Dimorfa svampar behöver dessutom sannolikt >10 dagars inkubering. Atypiskt mögel som växer i 25-30°C bör föranleda kontakt med laboratorium med erfarenhet av dimorfa svampar. |
Coccodioides immitis 3 | X | Coccidioidomykos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Förekommer i USA, Mellan- och Sydamerika. | se ovan |
Histoplasma capsulatum var. capsulatum (Ajellomyces capsulatus) 3 | X | Histoplasmos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Kontakt med kväverik jord, gödsel från fåglar och fladdermöss, framför allt längs stora floder i USA. | se ovan |
Histoplasma capsulatum var. duboisii 3 | X | Histoplasmos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Centralafrika. | se ovan |
Paracoccidioides brasiliensis 3 | X | Paracoccidioidomykos. Dimorf svamp. Systemisk mykos. Central- och Sydamerika. | se ovan |
Cladophialophora bantiana (tidigare: Xylohypha bantiana, Cladosporium bantianum eller trichoides) 3 | X | Cerebral feohyfomykos. Jordmögel som visar neurotropism. Inväxt eller hematogen spridning. Förekommer i hela världen men är ovanlig i Norden. | Konidiebildande mögel som växer bäst vid 42°C. |