Skillnad mellan versioner av "Calicivirus"

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik
Hoppa till navigering Hoppa till sök
(Skapade sidan med ''''Huvudartikel''' ---- Till innehållsförteckningen för ''Referensmetodik: Tarminfektioner, 2:a upplagan 2002'' ---- == Norovirus/calicivirus == === Smittämnet === ...')
 
 
(12 mellanliggande sidversioner av samma användare visas inte)
Rad 1: Rad 1:
 +
 
'''Huvudartikel'''
 
'''Huvudartikel'''
 
----
 
----
  
 
Till innehållsförteckningen för ''[[Referensmetodik: Tarminfektioner, 2:a upplagan 2002]]''
 
Till innehållsförteckningen för ''[[Referensmetodik: Tarminfektioner, 2:a upplagan 2002]]''
 +
----
 +
'''Artikeln uppdaterad februari 2010'''
 +
 
----
 
----
  
== Norovirus/calicivirus ==
+
== Norovirus/Sapovirus ("Calicivirus") ==
  
  
Rad 11: Rad 15:
 
=== Smittämnet ===
 
=== Smittämnet ===
  
Till virusfamiljen ''Caliciviridae'' ("Calicivirus") räknas idag fyra genera av virus av vilka två kan ge diarré hos människa, nämligen Norovirus och Sapovirus.  De två humanpatogena arterna benämns med ett samlingsbegrepp humana calicivirus och kallades tidigare "Norwalk-liknande virus" och "Sapporoliknande virus". Calicivirus är icke-höljebärande virus med en diameter om 27-32 nm. Genomet består av enkelsträngat RNA. Caliciviruspartiklar är liksom andra gastrovirus mycket stabila för pH-förändringar, detergent och värme.
+
Till virusfamiljen ''Caliciviridae'' ("Calicivirus") räknas idag fyra genera av virus av vilka två kan ge diarré hos människa, nämligen Norovirus och Sapovirus.  De två humanpatogena arterna benämns med ett samlingsbegrepp humana calicivirus och kallades tidigare "Norwalk-liknande virus" och "Sapporoliknande virus". Calicivirus är icke-höljebärande virus med en diameter om 32-35 nm. Genomet består av enkelsträngat RNA. Caliciviruspartiklar är liksom andra gastrovirus mycket stabila för pH-förändringar, detergent och värme.  
 
 
Calicivirus är en serologiskt och genetiskt heterogen grupp av virus. Norovirus utgörs av fem genogrupper där GG I, II och IV är humanpatogena. Sapovirus utgörs av fem genogrupper av vilka GG I, II, IV, och V är humanpatogena. Båda arterna orsakar kortvariga intensiva utbrott med kräkningar och diarré hos patienter i alla åldrar  på institutioner, kryssningsfartyg, campingplatser, förläggningar, skolor, restauranger, sjukhusavdelningar och andra vårdinstitutioner.
 
  
 +
Calicivirus är en serologiskt och genetiskt heterogen grupp av virus. Norovirus utgörs av fem genogrupper där GG I, II och IV är humanpatogena. Sapovirus utgörs av fem genogrupper av vilka GG I, II, IV, och V är humanpatogena. Båda arterna orsakar kortvariga intensiva utbrott med kräkningar och diarré hos patienter i alla åldrar  på institutioner, kryssningsfartyg, campingplatser, förläggningar, skolor, restauranger, sjukhusavdelningar och andra vårdinstitutioner. Inom vården dominerar norovirus GG II, särskilt undergrupp 4. Samhällsutbrott förorsakas oftast av norovirus GG I och II. Utbrott med sapovirus är betydligt ovanligare (cirka 5 % av alla fall) men kan förekomma i alla åldergrupper.
  
 
=== Patogenes ===
 
=== Patogenes ===
Rad 24: Rad 27:
  
 
Calicivirus orsakar ofta våldsamma kaskadliknande kräkningar, diarré, buksmärtor och influensaliknande symtom. Virus överförs som fekal-oral smitta. Inkubationstiden är 12-48 timmar och symtomen avtar inom 12-60 timmar. Calicivirus drabbar patienter i alla åldrar även små barn under sex månader. Då calicivirus utgör en mycket heterogen grupp av virus uppstår ingen övergripande immunitet. Trots att antikroppar kan föreligga mot virus kan en individ ofta reinfekteras med samma typ av virus.
 
Calicivirus orsakar ofta våldsamma kaskadliknande kräkningar, diarré, buksmärtor och influensaliknande symtom. Virus överförs som fekal-oral smitta. Inkubationstiden är 12-48 timmar och symtomen avtar inom 12-60 timmar. Calicivirus drabbar patienter i alla åldrar även små barn under sex månader. Då calicivirus utgör en mycket heterogen grupp av virus uppstår ingen övergripande immunitet. Trots att antikroppar kan föreligga mot virus kan en individ ofta reinfekteras med samma typ av virus.
Sjukdomen är som regel självbegränsande men kan orsaka mild/måttlig dehyd-rering. Enstaka fall av kronisk utsöndring av calicivirus hos immunsupprimerade individer har setts.
 
  
 +
Sjukdomen är som regel självbegränsande men kan orsaka mild/måttlig dehydrering. I normalfallet utsöndrar den infekterade individen virus i feces under flera dagar, men erfarenheten visar att smittsamheten är mycket låg två dygn efter det att symptomen upphört. Enstaka fall av kronisk utsöndring av calicivirus hos immunsupprimerade individer har setts.
  
 
== Laboratoriediagnostik ==
 
== Laboratoriediagnostik ==
 
+
[[Calicivirus-Laboratoriediagnostik|Följ länken för detaljerad information]]
 
 
=== Allmänt ===
 
 
 
Calicivirus diagnostiseras rutinmässigt med EM eller PCR. Elektronmikroskopi används vid SMI för att påvisa medlemmar i calicivirusfamiljen och Norwalk-liknande och Sapporo-liknande virus kan särskiljas morfologiskt. För epidemiologiska utredningar används PCR och sekvensering.
 
 
 
 
 
=== Referensmetodik ===
 
 
 
EM är referensmetod. Då calicivirus är genetiskt mycket heterogent kan PCR ej ännu anses ha status som referensmetod. EM-metodens känslighet är  106 viruspartiklar /mL fecessuspension. Utsvaras: Med EM påvisas/påvisas ej Norwalk-liknande eller Sapporo-liknande calicivirus.
 
 
 
 
 
== Alternativ laboratoriediagnostik ==
 
 
 
 
 
=== PCR ===
 
 
 
PCR används också rutinmässigt vid flera svenska diagnostiska laboratorier (Bilaga 4.2). Primers som identifierar Norwalk-liknande calicivirus tillhörande genogrupp 1 och 2 används. PCR för Sapporo-liknande calicivirus finns etable-rad men an¬vänds för närvarande ej i diagnostiska sammanhang. Primers är riktade mot konserverade delar av polymerasgenen. Känsligheten för PCR är högre än EM, men den genetiska variationen inom calicivirusfamiljen resulterar i att alla cali¬civirusisolat inte för närvarande kan påvisas med PCR.
 
Utsvaras: Calicivirus PCR positiv/negativ.
 
 
 
 
 
=== Antigen-ELISA ===
 
 
 
Metod finns ej etablerad i Sverige. Försök utomlands har visat på stora immunologiska skillnader mellan medlemmarna i calicivirusgruppen vilket försvårat etablering av en ELISA-test för påvisande av flertalet calicivirus. Ett flertal antigen påvisningsmetoder med ELISA är under utprövning och skulle utgöra ett värdefullt komplement till PCR/EM.
 
 
 
 
 
=== Serologi ===
 
 
 
Rekombinant framställda calicivirusproteiner finns producerade i USA för användning i serologiska test. I Sverige utförs ingen serologi  för närvarande.
 
 
 
 
 
=== Kvalitetskontroll ===
 
 
 
Kvalitetskontroll sker med nationella och internationella laboratoriejämförelser. Externa kvalitetspanaler finns ej att tillgå.
 
 
 
 
 
== Svarsrutin ==
 
 
 
Se ovan.
 
 
 
  
 
== Laboratorierapportering ==
 
== Laboratorierapportering ==
Rad 76: Rad 40:
 
== REFERENSER ==
 
== REFERENSER ==
  
Hedlund K-O et al. Epidemiology of Calicivirus Infections in Sweden, 1994-1998. J Infec Dis Suppl 2 2000;181:275-280.
+
*Hedlund K-O et al. Epidemiology of Calicivirus Infections in Sweden, 1994-1998. J Infec Dis Suppl 2 2000;181:275-280.
  
Vinjé J et. al. Molecular detection and epidemiology of small round-structured vi¬ru¬ses in outbreaks of gastroenteritis in the Netherlands J Infec Dis. 1996;174: 610-615.  
+
*Vinjé J et. al. Molecular detection and epidemiology of small round-structured viruses in outbreaks of gastroenteritis in the Netherlands J Infec Dis. 1996;174: 610-615.  
 
   
 
   
  
 
[[Kategori:Virus]]
 
[[Kategori:Virus]]
 
[[Kategori:Infektioner i mage och tarm]]
 
[[Kategori:Infektioner i mage och tarm]]

Nuvarande version från 2 mars 2010 kl. 18.21

Huvudartikel


Till innehållsförteckningen för Referensmetodik: Tarminfektioner, 2:a upplagan 2002


Artikeln uppdaterad februari 2010


Norovirus/Sapovirus ("Calicivirus")[redigera]

Smittämnet[redigera]

Till virusfamiljen Caliciviridae ("Calicivirus") räknas idag fyra genera av virus av vilka två kan ge diarré hos människa, nämligen Norovirus och Sapovirus. De två humanpatogena arterna benämns med ett samlingsbegrepp humana calicivirus och kallades tidigare "Norwalk-liknande virus" och "Sapporoliknande virus". Calicivirus är icke-höljebärande virus med en diameter om 32-35 nm. Genomet består av enkelsträngat RNA. Caliciviruspartiklar är liksom andra gastrovirus mycket stabila för pH-förändringar, detergent och värme.

Calicivirus är en serologiskt och genetiskt heterogen grupp av virus. Norovirus utgörs av fem genogrupper där GG I, II och IV är humanpatogena. Sapovirus utgörs av fem genogrupper av vilka GG I, II, IV, och V är humanpatogena. Båda arterna orsakar kortvariga intensiva utbrott med kräkningar och diarré hos patienter i alla åldrar på institutioner, kryssningsfartyg, campingplatser, förläggningar, skolor, restauranger, sjukhusavdelningar och andra vårdinstitutioner. Inom vården dominerar norovirus GG II, särskilt undergrupp 4. Samhällsutbrott förorsakas oftast av norovirus GG I och II. Utbrott med sapovirus är betydligt ovanligare (cirka 5 % av alla fall) men kan förekomma i alla åldergrupper.

Patogenes[redigera]

Calicivirus infekterar epitelceller främst i övre tunntarmen, replikerar i cytoplasman och utsöndras med lys av infekterade celler.


Symtom och klinisk bild[redigera]

Calicivirus orsakar ofta våldsamma kaskadliknande kräkningar, diarré, buksmärtor och influensaliknande symtom. Virus överförs som fekal-oral smitta. Inkubationstiden är 12-48 timmar och symtomen avtar inom 12-60 timmar. Calicivirus drabbar patienter i alla åldrar även små barn under sex månader. Då calicivirus utgör en mycket heterogen grupp av virus uppstår ingen övergripande immunitet. Trots att antikroppar kan föreligga mot virus kan en individ ofta reinfekteras med samma typ av virus.

Sjukdomen är som regel självbegränsande men kan orsaka mild/måttlig dehydrering. I normalfallet utsöndrar den infekterade individen virus i feces under flera dagar, men erfarenheten visar att smittsamheten är mycket låg två dygn efter det att symptomen upphört. Enstaka fall av kronisk utsöndring av calicivirus hos immunsupprimerade individer har setts.

Laboratoriediagnostik[redigera]

Följ länken för detaljerad information

Laboratorierapportering[redigera]

Calicivirusinfektioner är ej anmälningspliktiga enligt smittskyddslagen.


REFERENSER[redigera]

  • Hedlund K-O et al. Epidemiology of Calicivirus Infections in Sweden, 1994-1998. J Infec Dis Suppl 2 2000;181:275-280.
  • Vinjé J et. al. Molecular detection and epidemiology of small round-structured viruses in outbreaks of gastroenteritis in the Netherlands J Infec Dis. 1996;174: 610-615.