Skillnad mellan versioner av "PAR 10 Odling av Acanthamoeba"

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik
Hoppa till navigering Hoppa till sök
Rad 40: Rad 40:
  
 
3. ''E. coli K12 kultur''  
 
3. ''E. coli K12 kultur''  
 +
 
Förvaring: kylskåp
 
Förvaring: kylskåp
 
    
 
    
Rad 59: Rad 60:
 
Arbetet utförs i säkerhetsbänk. Handskar används genomgående.
 
Arbetet utförs i säkerhetsbänk. Handskar används genomgående.
 
====Förberedelser====  
 
====Förberedelser====  
A Subkultivering av ''E. coli'' (1-2 dagar innan analysdag, äldre bakterier fungerar också)
+
A Subkultivering av ''E. coli'' (1-2 dagar innan analysdag, äldre bakterier fungerar också).
 +
 
 
1. Stryk ut ''E. coli'' K12 på en ny blodagar platta.  
 
1. Stryk ut ''E. coli'' K12 på en ny blodagar platta.  
2. Inkubera plattorna upp och ned, minst 1 dygn, i 30 °C.   
+
 
 +
2. Inkubera plattorna upp och ned, minst 1 dygn, i 30 °C.  
 +
   
 
B Gjutning av agarplattor (kan göras samma dag eller i förväg)
 
B Gjutning av agarplattor (kan göras samma dag eller i förväg)
 +
 
1. Beräkna en agarplatta per provmaterial, plus en platta till positiva kontrollen. Till varje platta åtgår ett rör med non-nutrient agar.
 
1. Beräkna en agarplatta per provmaterial, plus en platta till positiva kontrollen. Till varje platta åtgår ett rör med non-nutrient agar.
 +
 
2. Smält non-nutrient agar i kokande vattenbad.  
 
2. Smält non-nutrient agar i kokande vattenbad.  
 +
 
3. Häll den smälta agarn i en petriskål och låt den stelna.  
 
3. Häll den smälta agarn i en petriskål och låt den stelna.  
4. Förvara förgjutna plattor till analysdag i kylskåp.  
+
 
 +
4. Förvara förgjutna plattor till analysdag i kylskåp.
 +
 
5. Plattor inpackade i parafilm kan förvaras i en månad.
 
5. Plattor inpackade i parafilm kan förvaras i en månad.
 
====Analysdag====
 
====Analysdag====
 
1. Rumstemperera agarplattorna.
 
1. Rumstemperera agarplattorna.
 +
 
2. Häll ca 0,5 mL Page´s saltlösning på blodagarplattan och slamma upp lite kolibakterier med en 10 µL bakteriologisk ögla. Tillsätt 3-4 droppar bakterie-suspension mitt på varje nonnutrient agarplatta. Sprid ut bakterierna med en 10 µL bakteriologisk ögla. Obs! Bakterielagret får inte vara flytande (låt överflödig vätska absorberas in i plattan).
 
2. Häll ca 0,5 mL Page´s saltlösning på blodagarplattan och slamma upp lite kolibakterier med en 10 µL bakteriologisk ögla. Tillsätt 3-4 droppar bakterie-suspension mitt på varje nonnutrient agarplatta. Sprid ut bakterierna med en 10 µL bakteriologisk ögla. Obs! Bakterielagret får inte vara flytande (låt överflödig vätska absorberas in i plattan).
 +
 
3. Märk plattorna med analysdatum och provnummer. Märk också en platta för positiv kontroll och sätt undan till punkt 8.
 
3. Märk plattorna med analysdatum och provnummer. Märk också en platta för positiv kontroll och sätt undan till punkt 8.
 +
 
4. A. Linsvätska centrifugeras först 500 x g, 5 min. Supernatanten sugs av och sedimentet inokuleras på plattan.  
 
4. A. Linsvätska centrifugeras först 500 x g, 5 min. Supernatanten sugs av och sedimentet inokuleras på plattan.  
 
       B. Rör med biopsimaterial i transportmedium centrifugeras 500 x g, 5 min och supernatanten sugs av. Vävnadsbiopsi samt sediment inokuleras i mitten av plattan. Försök att undvika överflödig vätska!  
 
       B. Rör med biopsimaterial i transportmedium centrifugeras 500 x g, 5 min och supernatanten sugs av. Vävnadsbiopsi samt sediment inokuleras i mitten av plattan. Försök att undvika överflödig vätska!  

Versionen från 26 mars 2012 kl. 14.19

Huvudartikel, skapad i mars 2012. Texten är preliminär, ännu ej beslutad genom konsensusförfarande.


Till innehållsförteckningen för Referensmetodik:Parasitologisk diagnostik och till


Odling av Acanthamoeba på non-nutrient agar

Analysprincip

Anrikning av Acanthamoeba från patientprov genom odling på non-nutrient agarplatta täckt med E. coli K12 bakterier som föda. Enstaka cystor som kan finnas i materialet excysterar och trofozoiter förökar sig och utvecklas så småningom till karakteristiska cystor som identifieras mikroskopiskt.

Reagenser

1. Page´s saltlösning, steril

Lösning 1

Na2HPO4 2.84 g

KH2PO4 2.72 g

destillerat vatten 500 ml

Autoklavera, 20 min, 121ºC

Lösning 2

MgSO4 7H2O 8.0 g

CaCl2 2 H2O 8.0 g

NaCl 0. 240 g

destillerat vatten 500 ml

Autoklavera, 20 min, 121ºC. Låt kallna till rumstemperatur, blanda lösning 1 och 2.

Förvaring: kylskåp

2. Blodagar plattor

Förvaring: kylskåp

Hållbarhet: ca 4 veckor

3. E. coli K12 kultur

Förvaring: kylskåp

Hållbarhet: ca 4 veckor

4. Non-nutrient agar i rör, steril

Agar utan tillsatser 15g

Destillerat vatten, eller PBS eller Page´s saltlösning 1 000 ml

Autoklavera, 20 min, 121 ºC. Portionera i sterila rör (20 ml/ rör)

5. Positiv kontroll: Acanthamoeba spp. kultur.

Förvaring: kylskåp Hållbarhet: flera månader, så länge agarn ej är intorkad.

Analysprocedur

Arbetet utförs i säkerhetsbänk. Handskar används genomgående.

Förberedelser

A Subkultivering av E. coli (1-2 dagar innan analysdag, äldre bakterier fungerar också).

1. Stryk ut E. coli K12 på en ny blodagar platta.

2. Inkubera plattorna upp och ned, minst 1 dygn, i 30 °C.

B Gjutning av agarplattor (kan göras samma dag eller i förväg)

1. Beräkna en agarplatta per provmaterial, plus en platta till positiva kontrollen. Till varje platta åtgår ett rör med non-nutrient agar.

2. Smält non-nutrient agar i kokande vattenbad.

3. Häll den smälta agarn i en petriskål och låt den stelna.

4. Förvara förgjutna plattor till analysdag i kylskåp.

5. Plattor inpackade i parafilm kan förvaras i en månad.

Analysdag

1. Rumstemperera agarplattorna.

2. Häll ca 0,5 mL Page´s saltlösning på blodagarplattan och slamma upp lite kolibakterier med en 10 µL bakteriologisk ögla. Tillsätt 3-4 droppar bakterie-suspension mitt på varje nonnutrient agarplatta. Sprid ut bakterierna med en 10 µL bakteriologisk ögla. Obs! Bakterielagret får inte vara flytande (låt överflödig vätska absorberas in i plattan).

3. Märk plattorna med analysdatum och provnummer. Märk också en platta för positiv kontroll och sätt undan till punkt 8.

4. A. Linsvätska centrifugeras först 500 x g, 5 min. Supernatanten sugs av och sedimentet inokuleras på plattan.

     B. Rör med biopsimaterial i transportmedium centrifugeras 500 x g, 5 min och supernatanten sugs av. Vävnadsbiopsi samt sediment inokuleras i mitten av plattan. Försök att undvika överflödig vätska! 

C. Kontaktlinser placeras i mitten av plattan. 5. Inkubera plattorna upp och ned i 30 °C i fuktkammare (plastpåse med en liten bit fuktad pappershandduk). 6. Tvätta arbetsytan med 70 % sprit. 7. Byt handskar. 8. Skär en ca 1 cm2 stor agarbit från platta med uppodlad referensstam av Acanthamoeba. Notera stamidentitet i analysprotokollet. Placera agarbiten upp och ned i mitten av plattan märkt positiv kontroll. 9. Inkubera plattan upp och ned i 30 °C i separat fuktkammare. 10. Inkubera alla plattor i en vecka. Avläsning och bedömning. Varje arbetsdag granskas hela plattan i inverterat mikroskop. Leta efter cystor och/eller trofozoiter. Börja varje avläsning med patientprov, tvätta därefter mikroskopbordet, byt handskar och kontrollera referenskulturen. Gör ett utstryk eller imprint av kulturen vid positivt fynd i patientprov. Låt preparaten lufttorka. För färgning med Giemsa se bilaga PAR09. Kriterier för identifiering av Acanthamoeba spp. Trofozoiter kan variera mellan 20–40 µm i diameter och kan ha olika former. Direktmikroskopi: Levande trofozoiter har en vakuol som tömmer sig flera gånger per minut. Cystorna, 12–18 µm i diameter, är polygonala, har dubbla väggar och ser ut som kristaller. Giemsafärgning: Cytoplasman i färgade trofozoiter innehåller flera vakuoler och har en centralt placerad kärna med en stor endosom (ref. 3). Svarsrutin Växt av trofozoiter och/eller cystor av Acanthamoeba spp. påvisade i odling. Ingen växt av Acanthamoeba spp. i odling. Kvalitetssäkring Intern: Referensstam odlas samtidigt med proverna. Extern: saknas Prestanda Negativt fynd utesluter ej Acanthamoeba spp.- infektion. Sensitivitet: är i genomsnitt 76 % för odling av ögonskrap. Högre sensitivitet kan fås vid odling av djup biopsi från hornhinnan (ref. 2). Specificitet: vid mikroskopisk påvisning kan endast genus anges.

Säkerhetsaspekter och avfallshantering Acanthamoeba spp tillhör skyddsklass 2 patogener. Både cystor och trofozoiter kan vara infektiösa för människor. Avdöda odlingsplattor med provmaterial och referensstam med 70 % sprit och placera dem i riskavfallskartonger efter avslutad inkubation.

Referenser 1. Visvesvara G S. Laboratory diagnosis. In: E. G. Rondanelli, editors. Amphizoic amoebae. Human pathology. Padova: Piccin Nuova Libraria 1987:194-215. 2. Auran JD, Starr MB, Jakobiec FA. Acanthamoeba Keratitis. A Review of the Literature. Cornea 1987;6 (1):2-26. 3. Ash L, Orihel T. Atlas of human Parasitology.