Skillnad mellan versioner av "På gång"

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik
Hoppa till navigering Hoppa till sök
(Tömde sidan)
 
(29 mellanliggande sidversioner av samma användare visas inte)
Rad 1: Rad 1:
'''Artikel under utarbetande. Innehållet får i detta skede inte betraktas som referensmetodik '''
 
---- 
 
==Diagnostik av anaeroba grampositiva ej sporbildande stavar==
 
===Smittämnen===
 
Till denna grupp räknas ett flertal bakteriearter inom klasserna ''Actinobacteria'' och ''Firmicutes'' av vilka flera är aerotoleranta och kan växa även vid aerob inkubering på fasta substrat.
 
*''Actinobacteria''
 
**''[[Actinomyces]]'' (flera arter),
 
** [[Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar|''Actinobaculum'']] (''A. massiliense, A. schaalii, A. urinale''),
 
** [[Bakteriell vaginos|''Mobiluncus'']] (med två strikt anaeroba arter; ''M. curtisii, M. mulieris''). Bakterierna är associerade med [[bakteriell vaginos]], och också med infektioner i samband med förtida födsel.
 
** ''Varibaculum'', den senare närstående ''Mobiluncus'', associerad med infektioner i munhåla, hjärna, ögon och intrauterina infektioner i samband med spiral
 
**[[Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:L-Y|''Propionibacterium'']]  med fem aerotoleranta arter som har associerats med humana infektioner (''P. acnes, P. avidum, P. granulosum, P. propionicum'' och ''P. acidifaciens'')
 
**Humanpatogen är också bakterier inom arten ''Propionimicrobium lymphophilum''
 
**''Propioniferax innocua'' hör till human hudflora
 
**[[ Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar|''Bifidobacterium'']] med 32 arter av vilka ett drygt 10-tal har associerats med humana infektioner
 
**''Alloscardovia, Parascardovia, Scardovia'', strikt anaeroba
 
** [[Bakteriell vaginos|''Atopobium'']] (associerad med [[bakteriell vaginos]], genitala infektioner som abscesser och [[pelvic inflammatory disease (PID)]]), ''Olsenella'' (associerad med infektioner i munhåla och tänder, har isolerats från blodbanan), ''Eggerthella'' och ''Paraeggerthella'' (de två senare associerade med intraabdominella abscesser, peritonit, bakteriemier och infektioner efter humana bett)
 
** ''Collinsella, Slackia, Cryptobacterium, Adlercreutzia'' och ''Gordonibacter''.
 
*''Firmicutes''
 
**[[Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar|''Lactobacillus'']]
 
**''Mogibacterium''
 
**[[Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:A-K|''Eubacterium'']] (flera arter är närstående ''Clostridia'' trots att de är ej sporbildande)
 
**''Anaerofustis stercorihominis, Pseudoramibacter alactolyticus, Bulleidia extructa, Holdemania filiformis, Solobacterium moorei'' och ''Turicibacter sanguinis, Filifactor (?), Marvinbryantia formatexigens, Oribacterium sinus, Lachnospira, Anaerostipes, Coprococcus'' och ''Catabacter''.
 
  
===Klinik===
 
De flesta bakterier som beskrivs i detta avsnitt hör till normal human-eller djurflora på hud och slemhinnor inklusive de inom uro-genitalorganen. Detta medför att de mer sällan orsakar infektioner, när de gör det är de att betrakta som opportunistiska infektioner som oftast utgår från slemhinnor. Bakterierna återfinns då vanligen som del i en polymikrobiell flora. Det är möjligt att förekomst av septisk spridning i blodbanan underdiagnosticeras eftersom bakterierna i gruppen är långsamväxande.
 
 
Beträffande infektioner orsakade av de olika genera inom gruppen, se text och länkar ovan för information.
 
 
==Provtagning och transport==
 
Prov lämpade för diagnostik av bakterier ur denna grupp innefattar blod, vävnadsbiopsier och aspirat (även från rotkanaler). Pinnprov från slemhinna i munhåla eller genitalia är inte lämpade.
 
 
Provtagning och transport bör ske efter anaeroba principer. För bakteriell vaginos, se [[Bakteriell vaginos-provtagning]].
 
 
==Laboratorierdiagnostik==
 
Bakterierna inom gruppen identifieras genom odling, men efterföljande fenotypisk karakterisering är ofta svår och minimikriterier för diagnos kan inte anges. Vid riktad frågeställning mot bakterier i gruppen rekommenderas förlängd odling upp till minst 7 dygn. Gaskromatografi i kombination med enkla biokemiska tester och kommersiella brickor kan i flera fall ge diagnos, i första hand till genusnivå. Databaserna för [[Maldi-Tof]] är i vissa fall otillräckliga för säker diagnostik till artnivå. Säker diagnos kräver i flera fall sekvensering med 16S rRNA-sekvensering. Identifiering av bakterier i gruppen till genus-(eller art)nivå är relevant vid fynd i renkultur i pus/sårodling eller vid fynd i normalt sterila områden. 
 
 
===Odling===
 
*För diagnostik av [[Actinomyces]] är odling referensmetodik. Lämpat för presumptiv diagnos av sådana infektioner är direktmikroskopi av prov från vävnad (se länk).
 
*Ett antal av bakterierna inom gruppen är aerotoleranta och identifieras enligt beskrivning i [[Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar]]
 
*Övriga bakterier i gruppen växer i CO<sub>2</sub> eller anaerobt och diagnosticeras genom odling på [[Översikt fasta substrat för bakteriologiska odlingar|anaerob FAA-agar]].
 
 
===Bakteriell vaginos===
 
*Diagnostik av [[bakteriell vaginos]] beskrivs under angiven länk.
 
===Serologi===
 
Antikroppsdiagnostik spelar ingen roll för diagnostik av infektioner orsakade av bakterier inom gruppen.
 
 
==Svarsrutiner==
 
Bakterierna hör till den normala floran i hud och slemhinnor, vilket gör att eventuella fynd ska tolkas med försiktighet. Alla isolat från normalt sterila lokaler ska identifieras till genusnivå (om möjligt till artnivå) och rapporteras. Resistensbestämning utförs utförs och rapporteras enligt  rekommendationer.     
 
 
 
Aktinomykos (''Actinomyces'' species) rapporteras i förekommande fall med fynd vid direktmikroskopi med eventuell närvaro av sulfurgranulae.
 
     
 
[[Kategori:Laboratoriediagnostik]]
 

Nuvarande version från 21 februari 2013 kl. 16.41