Nedre luftvägsinfektioner orsakade av virus-provtagning

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik
Hoppa till navigering Hoppa till sök

Virologisk diagnostik- indikation, provtagning, bedömning och svarsrutiner

V 1 Svalg

V 1.1 Virusodling Aktuella virus Adenovirus (referensmetod) Morbillivirus Indikation och bakgrund Diagnostik av luftvägsinfektion genom virusodling från svalgsekret förekommer. Klinisk bild av adenovirus kan lätt förväxlas med bakteriell infektion eller Epstein Barr Virus infektion. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Pinnprov kan tas med kommersiellt tillgänglig provpinne och rör med transportmedium (Virocult). Provtagningsförfarande Skrapa bakre svalgväggen så att celler från slemhinnan kommer med. Stoppa ner pinnen i virocultröret och kläm om rörets botten så att pinnen fuktas. Förvaring/ Transport Transporten till viruslaboratorium bör vara snabb och kort. Transport i kyla förlänger överlevnad av virus, men provet bör ej frysas. I avvaktan på ympning på cellkultur kan provet förvaras i +4 C. Aldrig frys! Om provet skall förvaras längre tid kontaktas vederbörande laboratorium för förvaringsinstruktioner. Laboratoriediagnostik Virusodling, se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Se under respektive virus.


V 1.2 Antigenpåvisning Aktuella virus Adenovirus Indikation och bakgrund Undersökningen sker med immunfluorescensmetodik (IF) för påvisning av virala antigen i infekterade celler i svalgsekret. För en korrekt bedömning och tolkning fordras vana vid undersökning av kliniska prov med fluorescensmetodik. Tekniken kan med fördel användas när svar önskas inom en dag. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Se ovan under V 1.1 virusodling. Provtagningsförfarande Se ovan under V 1.1 virusodling. Förvaring/ Transport Se ovan under V 1.1 virusodling. Laboratoriediagnostik Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Se under respektive virus.

V 1.3 Prov för nukleinsyrabaserad diagnostik Aktuella virus Adenovirus Influensavirus A och B Indikation och bakgrund Diagnostik av misstänkt luftvägsinfektion genom nukleinsyrapåvisning från svalgsekret förekommer. Klinisk bild av adenovirus kan lätt förväxlas med bakteriell infektion eller Epstein Barr Virus. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Se under V 1.1 virusodling.

Provtagningsförfarande Se under V 1.1 virusodling. Förvaring/ Transport Se under V 1.1 virusodling. Laboratoriediagnostik Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Se under respektive virus.


V 2 Nasofarynx Nasofarynxsekret innehåller mer virus och virala antigen än andra provtagningsmaterial från luftvägarna och rikligt med virusinfekterade celler. Prov, som tas i slemsamlare med sug, kan användas för såväl virusodling som för påvisning av virala antigen i infekterade celler i nasofarynxsekret med immunfluorescens (IF) eller med EIA.

V 2.1 Virusodling Aktuella virus Adenovirus Influensavirus A och B ( referensmetod) Morbillivirus Parainfluensavirus (referensmetod) RS-virus Metapneumovirus SARS-CoV Indikation och bakgrund Diagnostik av allvarlig luftvägsinfektion där snabbdiagnostiskt test (se nedan) utfallit negativt, behöver kontrolleras eller ej utförs. Isolering av influensavirus utförs dessutom av epidemiologiska skäl för att möjliggöra vidare karakterisering av virus. Provtagning Provtagningsmaterial. Transportkärl Aspirat: Trakeal-sugset och sugkateter alternativt 50 mL steril spruta, sugkateter och sterilt rör. Sekret/pinnprov: Provpinne med böjlig metalltråd och virocultrör. Provtagningsförfarande Aspirat: En sugkateter kopplas till det mindre munstycket på trakeal-sugsetet eller till en 50 mL steril spruta. Trakeal-sugsetets större munstycke kopplas till en pump. Sugkatetern förs in längs nässkiljeväggen tills spetsen når bakre svalgväggen, i syfte att samla ett prov innehållande virusinfekterade epitelceller. Aspirera sekret tills det befinner sig i sugkatetern. Vid aspiration med hjälp av spruta kan den behöva kopplas bort, ut med luft, kopplas på igen och aspirera på nytt. Sugkatetern roteras lätt under proceduren (hjälper till att skrapa loss epitelceller). Eftersug i båda fallen med ca 1 mL fysiologisk koksalt så att sekretet förs ner i slemsamlaren. Trakeal-sugset: Eftersug med ca 2 mL fysiologisk koksaltlösning så att sekretet förs ner i slemsamlaren. Steril spruta: Koppla loss sprutan. Fyll den med ca 2 mL fysiologisk koksaltlösning och spola igenom sonden så att sekretet förs ner i sterilt rör. Vid svårighet att få ett utbyte kan förslagsvis 0,5 mL fysiologisk koksaltlösning sprutas in via sugkatetern för att sedan aspireras.

Figur 10. Provtagningsset för nasofarynxaspirat med sugkateter. (Foto; Najah Samaan). Trakeal-sugset: Efter provtagningen byts skruvlocket med de två nipplarna mot tätt skruvlock, som medföljer slemsamlarens förpackning. På så vis undviks kontamination från omgivningen. Sekret/pinnprov: Pinnprov för isolering av virus kan tas från nasofarynx, tonsiller och svalg. Pinnprov är enklare att ta, men innebär i övrigt inga fördelar framför nasofarynxsekret erhållet med sug. Sensitiviteten av odlingen är ofta mindre för pinnprov. Pinnprov kan tas med kommersiellt tillgänglig provpinne med böjlig metalltråd och rör med transportmedium (Virocult). För pinnen genom näsöppningen utefter näshålans botten mot bakväggen av nasofarynx. Låt ligga kvar i 20-30 sekunder. Stoppa pinnen i virocultröret och kläm om rörets botten så att pinnen fuktas. Förvaring/Transport Transporten till viruslaboratorium bör vara snabb och kort. Nasofarynxaspirat taget med sug/50 mL spruta insänds utan särskild tillsats till virus¬laboratorium för isolering. Transport i kyla förlänger överlevnad av virus, men provet bör ej frysas. I avvaktan på ympning på cellkultur kan provet förvaras i +4 C. Aldrig frys! Om provet skall förvaras längre tid kontaktas vederbörande laboratorium för förvaringsinstruktioner. Laboratoriediagnostik Virusodling . Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Virusodling utförs på viruslaboratorier. Isolering kan svaras efter 1-4 veckor beroende på virus, negativt svar ofta efter 2-4 veckor beroende på frågeställning.

V 2.2 Antigenpåvisning Aktuella virus Adenovirus Influensavirus A och B Morbillivirus RS-virus (referensmetod) Parainfluensavirus Metapneumovirus Indikation och bakgrund Misstänkt virusinfektion i luftvägarna, där svar önskas inom en dag. Undersökningen sker med immunfluorescensmetodik (IF) för påvisning av virala antigen i infekterade celler i nasofarynxsekret eller med EIA (ELISA, TR-FIA). I tidigt sjukdomsförlopp innehåller nasofarynxsekret rikligt med virusinfekterade celler. I den infekterade cellen påvisas med in situ-metoder virala antigen med specifika antikroppar. Tekniken lämpar sig för såväl snabbdiagnostik som epidemiologisk screening, speciellt vid diagnostik på barn. För en korrekt bedömning och tolkning fordras vana vid undersökning av kliniska prov med fluorescensmetodik. Med moderna reagens är diagnostik av RS-virus relativt lätt, då förekomsten av infekterade celler vanligen är riklig. Diagnostik av influensavirus kan däremot vara mycket svår. Kommersiella kit av god kvalitet beroende på EIA-teknik marknadsförs för påvisning av influensa och RSV. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Se under V 2.1 Virusodling Provtagningsförfarande Se ovan under V2.1 Virusodling. Förvaring/Transport Transporteras till viruslaboratorium snarast. Laboratoriediagnostik Antigenpåvisning. Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Antigenpåvisning utförs på viruslaboratorier. Diagnostiken tar ca 2-3 timmar från det att provet inkommer till laboratoriet. Således kan svar fås samma dag om provet inte anländer för sent på eftermiddagen.

V 2.3 Nukleinsyrabaserad diagnostik Aktuella virus Adenovirus Influensavirus A och B RS-virus Metapneumovirus (referensmetod) SARS-CoV (referensmetod)

Indikation och bakgrund Känslig och snabb direktpåvisningsmetod vid misstänkt luftvägsinfektion.

Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Se under V2.1 Virusodling. Provtagningsförfarande Se ovan under V2.1 Virusodling. Förvaring/Transport Transporteras till viruslaboratorium snarast. Laboratoriediagnostik Nukleinsyrapåvisning. Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Nukleinsyrapåvisning utförs på viruslaboratorier. Svar lämnas inom 2-3 dagar.

V 2.4. Prov för elektronmikroskopi Aktuella virus Okänt prov, misstanke om SARS-infektion. Indikation och bakgrund Sällsynt. Vid misstanke om SARS-infektion eller då misstanke om odiagnostiserad luftvägsinfektion och betydelsen av känt agens är mycket betydelsefullt. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Se under V 2.1 virusodling. Provtagningsförfarande Se under V 2.1 virusodling. Förvaring/Transport Se under V 2.1 virusodling. Laboratoriediagnostik Påvisande av virus genom elektronmikroskopi. Bedömning och svarsrutiner Individuellt svar beroende på frågeställning.


V 3 Sputum Sputum används ytterst sällan för virologisk diagnostik.

V 4 Prov via bronkoskop Allmänt Prov anländer till laboratoriet antingen som sekret på skyddad borste (V 4.1, beskrivs ej) eller som sköljvätska – bronkoalveolärt lavage (BAL). För virusdiagnostik rekommenderas BAL. Transbronkial biopsi kan också användas för viruspåvisning.

V 4.2 Bronkoalveolärt lavage (BAL)

V 4.2.1 Virusodling

Aktuella virus RS-virus Influensavirus A och B Parainfluensavirus Adenovirus Herpes Simplex virus 1 och 2 Cytomegalovirus Metapneumovirus SARS-CoV Indikation och bakgrund, Misstanke på viralt agens i de djupa nedre luftvägarna. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Endoskopisk cytologiborste. Sterilt rör med 1 mL 0,9% NaCl. Provtagningsförfarande Kan utföras på flera sätt. Oftast kilas bronkoskopspetsen fast i en segmentbronk i den afficierade lungdelen, varefter sköljning sker med 3 4x50 mL kroppsvarm 0,9 % NaCl. Så mycket som möjligt, i regel ca 100 mL, reaspireras och analyseras.

Förvaring/ Transport Förvaras kylt 2-8C till dess transport till laboratoriet kan ske. Laboratoriediagnostik Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Se under respektive virus.

V 4.2.2 Antigenpåvisning Aktuella virus RS-virus Influensavirus A och B Parainfluensavirus SARS-CoV Herpes simplex virus Cytomegalovirus Adenovirus Indikation och bakgrund Diagnostisering vid misstänkt djup luftvägsinfektion. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Se under V 2.1 virusodling. Provtagningsförfarande Se under V 2.1 virusodling. Förvaring/ Transport Se under V 2.1 virusodling. Laboratoriediagnostik Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Se under respektive virus.


V 4.2.3 Nukleinsyrabaserad diagnostik Aktuella virus Influensavirus A och B SARS-CoV Adenovirus Metapneumovirus Herpes simplex virus Cytomegalovirus Indikation och bakgrund Diagnostisering vid misstänkt djup luftvägsinfektion. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Se under V 2.1 virusodling. Provtagningsförfarande Se under V 2.1 virusodling. Förvaring/ Transport Se under V 2.1 virusodling. Laboratoriediagnostik Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Se under respektive virus.

V 8.2 Blod, antikroppsdetektion Aktuella virus Adenovirus Herpes simplex virus 1 och 2 Cytomegalovirus Influensavirus A och B Morbillivirus (referensmetod) Parainfluensavirus RS-virus Metapneumovirus SARS-CoV

Indikation och bakgrund Vid negativa resultat avseende virologisk direktpåvisning kan serologi fylla en viktig funktion och vara ett viktigt komplement. Akut- och konvalescent¬prov krävs för diagnostik avseende adenovirus, influensavirus A och B, parainfluensavirus och RS-virus. Akut- och konvalescentprov är att föredra avseende cytomegalovirus, och morbillivirus, men IgM-diagnostiken är ofta adekvat för CMV. För primär herpes-simplex är serologi av värde endast vid primär infektion. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Rör utan tillsats eller rör med gel. Provtagningsförfarande Förvaring/Transport Transporteras till viruslaboratorium snarast. Laboratoriediagnostik Serologi. Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Serologi utförs på viruslaboratorium. Resultat av serologi kan vara svårtolkade. Serologi rörande reaktiverade infektioner eller serologi hos immun-supprimerade patienter kan vara svårbedömda. Svar lämnas inom en vecka.

V 10 Obduktionsmaterial

V 10.2 Prov för molekylärbiologisk diagnostik Indikation och bakgrund Indikation vid dödsfall i akut okänd luftvägsinfektion, ofta vid lungengagemang. Före provtagning skall kontakt tas med virologiskt laboratorium. Provtagning Provtagningsmateriel. Transportkärl Biopsier placeras i sterila rör och fuktas med fysiologiskt NaCl.

Provtagningsförfarande Förvaras i kyla till transport till viruslaboratorium kan ske. Förvaring/Transport Transporteras till viruslaboratorium snarast. Laboratoriediagnostik Se under respektive virus. Bedömning och svarsrutiner Se under respektive virus.

V 11 Övrigt (konjunktivalsekret, feces) Aktuella virus Adenovirus (konjunktivalsekret) SARS-CoV (feces) Se under respektive virus.

Hämtad från "http://referensmetodik.folkhalsomyndigheten.se/index.php?title=Nedre_luftvägsinfektioner_orsakade_av_virus-provtagning&oldid=876"