Skillnad mellan versioner av "På gång"

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik
Hoppa till navigering Hoppa till sök
(Tömde sidan)
 
(32 mellanliggande sidversioner av samma användare visas inte)
Rad 1: Rad 1:
'''Artikel under utarbetande. Innehållet får i detta skede inte betraktas som referensmetodik '''
 
---- 
 
==Diagnostik av anaeroba grampositiva ej sporbildande stavar==
 
===Smittämnen===
 
Till denna grupp räknas ett flertal bakteriearter inom klasserna ''Actinobacteria'' och ''Firmicutes'' av vilka flera är aerotoleranta och kan växa även vid aerob inkubering på fasta substrat.
 
*''Actinobacteria''
 
**''[[Actinomyces]]'' (flera arter),
 
** [[Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar|''Actinobaculum'']] (''A. massiliense, A. schaalii, A. urinale''),
 
** [[Bakteriell vaginos|''Mobiluncus'']] (med två strikt anaeroba arter; ''M. curtisii, M. mulieris''). Bakterierna är associerade med [[bakteriell vaginos]], och också med infektioner i samband med förtida födsel.
 
** ''Varibaculum'', den senare närstående ''Mobiluncus'', associerad med infektioner i munhåla, hjärna, ögon och intrauterina infektioner i samband med spiral
 
**[[Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:L-Y|''Propionibacterium'']]  med fem aerotoleranta arter som har associerats med humana infektioner (''P. acnes, P. avidum, P. granulosum, P. propionicum'' och ''P. acidifaciens'')
 
**Humanpatogen är också bakterier inom arten ''Propionimicrobium lymphophilum''
 
**''Propioniferax innocua'' hör till human hudflora
 
**[[ Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar|''Bifidobacterium'']] med 32 arter av vilka ett drygt 10-tal har associerats med humana infektioner
 
**''Alloscardovia, Parascardovia, Scardovia'', strikt anaeroba
 
** [[Bakteriell vaginos|''Atopobium'']] (associerad med [[bakteriell vaginos]], genitala infektioner som abscesser och [[pelvic inflammatory disease (PID)]]), ''Olsenella'' (associerad med infektioner i munhåla och tänder, har isolerats från blodbanan), ''Eggerthella'' och ''Paraeggerthella'' (de två senare associerade med intraabdominella abscesser, peritonit, bakteriemier och infektioner efter humana bett)
 
** ''Collinsella, Slackia, Cryptobacterium, Adlercreutzia'' och ''Gordonibacter''.
 
*''Firmicutes''
 
**[[Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar|''Lactobacillus'']]
 
**''Mogibacterium''
 
**[[Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:A-K|''Eubacterium'']] (flera arter är närstående ''Clostridia'' trots att de är ej sporbildande)
 
**''Anaerofustis stercorihominis, Pseudoramibacter alactolyticus, Bulleidia extructa, Holdemania filiformis, Solobacterium moorei'' och ''Turicibacter sanguinis, Filifactor (?), Marvinbryantia formatexigens, Oribacterium sinus, Lachnospira, Anaerostipes, Coprococcus'' och ''Catabacter''.
 
  
===Klinik===
 
De flesta bakterier som beskrivs i detta avsnitt hör till normal human-eller djurflora på hud och slemhinnor inklusive de inom uro-genitalorganen. Detta medför att de mer sällan orsakar infektioner, när de gör det är de att betrakta som opportunistiska infektioner som oftast utgår från slemhinnor. Bakterierna återfinns då vanligen som del i en polymikrobiell flora. Det är möjligt att förekomst av septisk spridning i blodbanan underdiagnosticeras eftersom bakterierna i gruppen är långsamväxande.
 
 
Beträffande infektioner orsakade av de olika genera inom gruppen, se text och länkar ovan för information.
 
 
==Provtagning och transport==
 
Prov lämpade för diagnostik av bakterier ur denna grupp innefattar blod, vävnadsbiopsier och aspirat (även från rotkanaler). Pinnprov från slemhinna i munhåla eller genitalia är inte lämpade.
 
 
Provtagning och transport bör ske efter anaeroba principer. För bakteriell vaginos, se [[Bakteriell vaginos-provtagning]].
 
 
==Laboratorierdiagnostik==
 
Bakterierna inom gruppen identifieras genom odling, men efterföljande fenotypisk karakterisering är ofta svår och minimikriterier för diagnos kan inte anges. Gaskromatografi i kombination med enkla biokemiska tester och kommersiella brickor kan i flera fall ge diagnos, i första hand till genusnivå. Databaserna för [[Maldi-Tof]] är också otillräckliga för säker diagnostik till artnivå. Säker diagnos kräver i flera fall sekvensering med 16S rRNA-sekvensering. Identifiering av bakterier i gruppen till genus-(eller art)nivå är relevant vid fynd i renkultur i pus/sårodling eller vid fynd i normalt sterila områden. 
 
 
===Odling===
 
*För diagnostik av [[Actinomyces]] är odling referensmetodik. Lämpat för presumptiv diagnos av sådana infektioner är direktmikroskopi av prov från vävnad (se länk).
 
*Ett antal av bakterierna inom gruppen är aerotoleranta och identifieras enligt beskrivning i [[Diagnostik av aeroba/aerotoleranta grampositiva katalasnegativa ej sporbildande stavar]]
 
*Övriga bakterier i gruppen växer i CO<sub>2</sub> eller anaerobt och diagnosticeras genom odling på [[Översikt fasta substrat för bakteriologiska odlingar|anaerob FAA-agar]].
 
 
===Bakteriell vaginos===
 
*Diagnostik av [[bakteriell vaginos]] beskrivs under angiven länk.
 
===Serologi===
 
Antikroppsdiagnostik spelar föga roll för diagnostik av infektioner orsakade av bakterier inom gruppen.
 
 
==Svarsrutiner==
 
 
 
 
     
 
[[Kategori:Laboratoriediagnostik]]
 

Nuvarande version från 21 februari 2013 kl. 17.41