Skillnad mellan versioner av "Calicivirus-Laboratoriediagnostik"
| (6 mellanliggande sidversioner av 2 användare visas inte) | |||
| Rad 5: | Rad 5: | ||
---- | ---- | ||
| − | == Laboratoriediagnostik av | + | == Laboratoriediagnostik av calicivirus == |
=== Allmänt === | === Allmänt === | ||
| − | Calicivirus diagnostiseras rutinmässigt med | + | Calicivirus diagnostiseras rutinmässigt med molekylärbiologiska metoder (PCR). Elektronmikroskopi används fortfarande vid Folkhälsomyndigheten för att påvisa medlemmar i calicivirusfamiljen som med den tekniken kan särskiljas morfologiskt. För epidemiologiska utredningar används PCR och sekvensering. |
| − | |||
=== Referensmetodik === | === Referensmetodik === | ||
| − | + | PCR för påvisande av calicivirus används rutinmässigt vid de flesta svenska mikrobiologiska laboratorier ( [[RT-PCR för detektion av Norwalk-liknande humant calicivirus|Bilaga 4.2]] ). Primers som identifierar norovirus tillhörande genogrupp I och II används. PCR för sapovirus finns också etablerad och används av flera av de större laboratorierna. Primers är riktade mot konserverade delar av polymerasgenen. Känsligheten för PCR är högre än elektronmikroskopi som var den tidigare referensmetodiken, men den genetiska variationen inom calicivirusfamiljen resulterar i att alla calicivirusisolat inte för närvarande kan påvisas med PCR. | |
| + | Utsvaras: Norovirus (eller sapovirus) påvisade/ej påvisade med PCR. | ||
== Alternativ laboratoriediagnostik == | == Alternativ laboratoriediagnostik == | ||
| + | === Antigen-tester=== | ||
| − | + | Metoder för påvisande av norovirus finns etablerade men används sparsamt i Sverige. Försök utomlands har visat på stora immunologiska skillnader hos olika norovirus vilket försvårat etablering av en ELISA-test. Ett flertal antigenpåvisningsmetoder är under utprövning och kan komma att utgöra ett värdefullt komplement till PCR. | |
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
=== Serologi === | === Serologi === | ||
| − | Rekombinant framställda calicivirusproteiner finns | + | Rekombinant framställda calicivirusproteiner finns kommersiellt tillgängliga för användning i serologiska test för påvisande av antikroppar. I Sverige utförs ingen serologi för närvarande. |
| − | |||
| − | |||
| − | + | === Elektronmikroskopi === | |
| + | EM-metodens känslighet är cirka <math>10^6</math> viruspartiklar/mL fecessuspension. Metoden utförs vid Folkhälsomyndigheten och är ett komplement till PCR-diagnostik. Används huvudsakligen för att identifiera nya typer av virus som kan ha undgått detektion med annan metodik. | ||
| − | == | + | == Kvalitetskontroll == |
| − | + | Kvalitetskontroll sker med nationella och internationella laboratoriejämförelser. Externa kvalitetspanaler finns via EQUALIS och QCMD. | |
== Laboratorierapportering == | == Laboratorierapportering == | ||
| − | Calicivirusinfektioner är ej anmälningspliktiga enligt smittskyddslagen. | + | Calicivirusinfektioner är ej anmälningspliktiga enligt smittskyddslagen. Frivillig veckorapportering till Folkhälsomyndigheten. |
| − | |||
| − | |||
[[Kategori:Laboratoriediagnostik-Infektioner i mage och tarm]] | [[Kategori:Laboratoriediagnostik-Infektioner i mage och tarm]] | ||
Nuvarande version från 13 januari 2014 kl. 12.02
Till huvudartikeln Calicivirus
Se också bilagan
Laboratoriediagnostik av calicivirus[redigera]
Allmänt[redigera]
Calicivirus diagnostiseras rutinmässigt med molekylärbiologiska metoder (PCR). Elektronmikroskopi används fortfarande vid Folkhälsomyndigheten för att påvisa medlemmar i calicivirusfamiljen som med den tekniken kan särskiljas morfologiskt. För epidemiologiska utredningar används PCR och sekvensering.
Referensmetodik[redigera]
PCR för påvisande av calicivirus används rutinmässigt vid de flesta svenska mikrobiologiska laboratorier ( Bilaga 4.2 ). Primers som identifierar norovirus tillhörande genogrupp I och II används. PCR för sapovirus finns också etablerad och används av flera av de större laboratorierna. Primers är riktade mot konserverade delar av polymerasgenen. Känsligheten för PCR är högre än elektronmikroskopi som var den tidigare referensmetodiken, men den genetiska variationen inom calicivirusfamiljen resulterar i att alla calicivirusisolat inte för närvarande kan påvisas med PCR.
Utsvaras: Norovirus (eller sapovirus) påvisade/ej påvisade med PCR.
Alternativ laboratoriediagnostik[redigera]
Antigen-tester[redigera]
Metoder för påvisande av norovirus finns etablerade men används sparsamt i Sverige. Försök utomlands har visat på stora immunologiska skillnader hos olika norovirus vilket försvårat etablering av en ELISA-test. Ett flertal antigenpåvisningsmetoder är under utprövning och kan komma att utgöra ett värdefullt komplement till PCR.
Serologi[redigera]
Rekombinant framställda calicivirusproteiner finns kommersiellt tillgängliga för användning i serologiska test för påvisande av antikroppar. I Sverige utförs ingen serologi för närvarande.
Elektronmikroskopi[redigera]
EM-metodens känslighet är cirka viruspartiklar/mL fecessuspension. Metoden utförs vid Folkhälsomyndigheten och är ett komplement till PCR-diagnostik. Används huvudsakligen för att identifiera nya typer av virus som kan ha undgått detektion med annan metodik.
Kvalitetskontroll[redigera]
Kvalitetskontroll sker med nationella och internationella laboratoriejämförelser. Externa kvalitetspanaler finns via EQUALIS och QCMD.
Laboratorierapportering[redigera]
Calicivirusinfektioner är ej anmälningspliktiga enligt smittskyddslagen. Frivillig veckorapportering till Folkhälsomyndigheten.