Anaeroba bakterier -diagnostiska minimikriterier
Anaeroba bakterier Definition se under identifieringsbegrepp, växtsätt.
Identifiering, referensmetod Identifiering av anaeroba bakterier omfattar kolonimorfologi (storlek, pigmentering, svärmning, hemolys) gramfärgning, resistensbestämning för kliniken inkluderande kanamycin-vankomycin i diagnostiskt syfte. Analys av fettsyror med gaskromatografi (enligt, Jousimies Somer et al Wadsworth anaerobic Bact Manual; 2002 6th ed. Star Publishing Company. Belmont. Calif.,) är referensnivå för definitiv artdiagnostik. Biokemiska tester och kommersiella kit kan vara av värde. Avvikelse från referensmetodik I rutindiagnostiken är det som regel tillräckligt att identifiera B. fragilis och Clostridium perfingens till speciesnivå. Övriga anaerober kan identifieras till presumtiv speciesnivå, t.ex. Bacteroides species, Prevotella species etc. Nedan beskrivs minimikriterier för denna rutindiagnostiska nivå.
Anaeroba grampositiva kocker
Speciesbestämning, minimikriterier
Peptococcus niger
Ovanlig i kliniskt material. Skiljer sig från peptostreptokocker genom svag katalaspositivitet och pigmentering synlig i plattmikroskop.
Gruppbestämning
Peptostreptokocker
Grampositiva kocker. Kanamycin och vankomycinkänsliga. Katalas- och indolnegativa.
Anaeroba grampositiva stavar
Speciesbestämning, minimikriterier
Clostridium perfringens
Stora, lådformade grampositiva stavar. Betahemo¬lyserande med dubbelzon. Omvänt CAMP- positiv. Kanamycin och vankomycinkänslig.
Propionibacterium acnes
Typiska grampositiva stavar. Katalas- och indolpositiv.
Clostridium species
Grampositiva stavar. Kan ibland te sig gram¬negativa. Kanamycin och vankomycin¬känsliga. Katalasnegativa. Sporbildare, sporerna kan dock vara svåra att se vid gramfärgning. Inne¬fattar bl.a. C. bifermentans, C. fallax, C. histiolyticum, C. novyi, C. septicum.
Anaeroba gramnegativa kocker
Gruppbestämning
Gramnegativa kocker
Kanamycinkänsliga och vankomycinresistenta.
Anaeroba gramnegativa stavar
Gruppbestämning
Bacteroides fragilis-gruppen:
Kanamycin och vankomycinresistenta. Katalaspositiv. Indolnegativ. Eventuellt kan colistin och oxgalla komplettera diagnostiken.
Övriga gramnegativa stavar framgår av tabell 12.
Övrigt Lactobacillus species Se referensmetodik I 5. Actinomyces species Se agens associerade med specifika sjukdomstillstånd.
Tabell 12. Anaeroba gramnegativa stavar, minimikriterier
Vankomycin Kanamycin Colistin Oxgalla Katalas Indol Övrigt Porphyromonas species S R R - + Svartpigmenterade kolonier. Indolpositiv. Fusobacterium species R S S - + Prevotella species R R R/S S - -/+ Prevotella spp är indolnegativa, dock är P. intermedia indolpos. Bacteroides species R S S - +/-
Bilophila R S +++ -