Calicivirus-Laboratoriediagnostik
Till huvudartikeln Calicivirus
Se också bilagan
Laboratoriediagnostik av Calicivirus
Allmänt
Calicivirus diagnostiseras rutinmässigt med EM eller PCR. Elektronmikroskopi används vid SMI för att påvisa medlemmar i calicivirusfamiljen och Norwalk-liknande och Sapporo-liknande virus kan särskiljas morfologiskt. För epidemiologiska utredningar används PCR och sekvensering.
Referensmetodik
EM är referensmetod. Då calicivirus är genetiskt mycket heterogent kan PCR ej ännu anses ha status som referensmetod. EM-metodens känslighet är 106 viruspartiklar /mL fecessuspension. Utsvaras: Med EM påvisas/påvisas ej Norwalk-liknande eller Sapporo-liknande calicivirus.
Alternativ laboratoriediagnostik
PCR
PCR används också rutinmässigt vid flera svenska diagnostiska laboratorier ( Bilaga 4.2 ). Primers som identifierar Norwalk-liknande calicivirus tillhörande genogrupp 1 och 2 används. PCR för Sapporo-liknande calicivirus finns etable-rad men an¬vänds för närvarande ej i diagnostiska sammanhang. Primers är riktade mot konserverade delar av polymerasgenen. Känsligheten för PCR är högre än EM, men den genetiska variationen inom calicivirusfamiljen resulterar i att alla cali¬civirusisolat inte för närvarande kan påvisas med PCR. Utsvaras: Calicivirus PCR positiv/negativ.
Antigen-ELISA
Metod finns ej etablerad i Sverige. Försök utomlands har visat på stora immunologiska skillnader mellan medlemmarna i calicivirusgruppen vilket försvårat etablering av en ELISA-test för påvisande av flertalet calicivirus. Ett flertal antigen påvisningsmetoder med ELISA är under utprövning och skulle utgöra ett värdefullt komplement till PCR/EM.
Serologi
Rekombinant framställda calicivirusproteiner finns producerade i USA för användning i serologiska test. I Sverige utförs ingen serologi för närvarande.
Kvalitetskontroll
Kvalitetskontroll sker med nationella och internationella laboratoriejämförelser. Externa kvalitetspanaler finns ej att tillgå.
Svarsrutin
Se ovan.
Laboratorierapportering
Calicivirusinfektioner är ej anmälningspliktiga enligt smittskyddslagen.