Skillnad mellan versioner av "Infektioner i mag-tarmkanalen-provtagning och transport"

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik
Hoppa till navigering Hoppa till sök
 
(13 mellanliggande sidversioner av 4 användare visas inte)
Rad 1: Rad 1:
''Huvudartikel: [[Referensmetodik: Tarminfektioner, 2:a upplagan 2002]]''
+
Till innehållsförteckning för ''[[Referensmetodik: Tarminfektioner, 2:a upplagan 2002]]''
  
 
----
 
----
Rad 7: Rad 7:
 
== A. Bakteriologisk provtagning ==
 
== A. Bakteriologisk provtagning ==
 
=== I. Pinnprov ===  
 
=== I. Pinnprov ===  
1. Som provtagningspinne och transportsubstrat för bakteriologisk odling förordas Copan Amies W/CH N.L1075 innehållande [[Amies kolade transportsubstrat]] samt provtagningspinne. Provtagningskärlet skall all¬tid märkas med personuppgifter, avsändare och provtagningsdatum.
+
1. Som provtagningspinne och transportsubstrat för bakteriologisk odling förordas Copan Amies W/CH N.L1075 innehållande Amies kolade transportsubstrat samt provtagningspinne [http://www.condalab.com/pdf/1535.pdf]. Provtagningskärlet skall alltid märkas med personuppgifter, avsändare och provtagningsdatum.
 
   
 
   
 
==== Provtagning ====
 
==== Provtagning ====
 
a) Pottprov. Provtagningspinnen doppas i feces som lagts på blöja, i värmedesinfekterat bäcken eller ovanpå toalettpapper i ett rent kärl. Kontrollera att spetsen på pinnen blivit förorenad med tarminnehåll. Pinnen sticks ned i transportmediet och lämnas kvar i röret. Rekommenderas i första hand då patienten tar provet själv.
 
a) Pottprov. Provtagningspinnen doppas i feces som lagts på blöja, i värmedesinfekterat bäcken eller ovanpå toalettpapper i ett rent kärl. Kontrollera att spetsen på pinnen blivit förorenad med tarminnehåll. Pinnen sticks ned i transportmediet och lämnas kvar i röret. Rekommenderas i första hand då patienten tar provet själv.
b) Analsvabb. Provtagningspinnen stryks mot ändtarms¬öppningen genast efter avföring innan torkning med papper. Kontrollera att spetsen på pinnen blivit förorenad med tarm¬innehåll. Pinnen sticks ned i transportmediet och lämnas kvar i röret. Används som alternativ metod i lämpliga fall.
+
b) Analsvabb. Provtagningspinnen stryks mot ändtarmsöppningen genast efter avföring innan torkning med papper. Kontrollera att spetsen på pinnen blivit förorenad med tarminnehåll. Pinnen sticks ned i transportmediet och lämnas kvar i röret. Används som alternativ metod i lämpliga fall.
c) Rektalsvabb. Vid rektoskopering tas prov direkt från rektal¬slem¬hinnan med provtagningspinne varefter pinnen sticks ned i transportsubstratet. Rektalsvabb förordas vid diarré med ul¬cerationer i slemhinnan.
+
c) Rektalsvabb. Vid rektoskopering tas prov direkt från rektalslemhinnan med provtagningspinne varefter pinnen sticks ned i transportsubstratet. Rektalsvabb förordas vid diarré med ulcerationer i slemhinnan.
  
 
=== II. Feces i provtagningskärl ===
 
=== II. Feces i provtagningskärl ===
Om undersökningen avser påvisande av toxin med biologisk metod eller immunologisk teknik skall fecesprov i provtagningskärl användas. Provtag¬ningskärl med sked och ytterhylsa används varvid 2-3 skedar feces (totalt ca 10 g vid undersökning av anaerob flora) tas från blöja, värmedesinfekterat bäcken eller från feces lagt på toalettpapper i ett rent kärl. Feces förs ned i provtagningskärlet, locket skruvas till omsorgsfullt, varefter provtagnings¬kärlet märks med namn och personnummer samt avsändare och provtag¬ningsdatum. Därefter förs kärlet ned i ytterhylsan.
+
Om undersökningen avser påvisande av toxin med biologisk metod eller immunologisk teknik skall fecesprov i provtagningskärl användas. Provtagningskärl med sked och ytterhylsa används varvid 2-3 skedar feces (totalt ca 10 g vid undersökning av anaerob flora) tas från blöja, värmedesinfekterat bäcken eller från feces lagt på toalettpapper i ett rent kärl. Feces förs ned i provtagningskärlet, locket skruvas till omsorgsfullt, varefter provtagningskärlet märks med namn och personnummer samt avsändare och provtagningsdatum. Därefter förs kärlet ned i ytterhylsan.
  
 
=== III. Renkultur ===
 
=== III. Renkultur ===
Bakteriologiska renkulturer kan vanligen transporteras i det rekommende¬rade transportsubstratet. För vissa undersökningar vid SMI rekommenderas annat transportsätt. Kultur för epidemiologisk typning av Salmonella spe¬cies, Shigella species, Yersinia species samt kultur eller primärstryk för på¬visande av EHEC och andra patogena E. coli transporteras helst på det snedagarrör som (f.n. kostnadsfritt) tillhandahålls av SMI. Därigenom kan typningen oftast ske en dag snabbare än om det rekommenderade transport¬substratet används.
+
Bakteriologiska renkulturer kan vanligen transporteras i det rekommenderade transportsubstratet. För vissa undersökningar vid Folkhälsomyndigheten rekommenderas annat transportsätt. Kultur för epidemiologisk typning av ''Salmonella'' species, ''Shigella'' species, ''Yersinia'' species samt kultur eller primärstryk för påvisande av EHEC och andra patogena ''E. coli'' transporteras helst på det snedagarrör som (f.n. kostnadsfritt) tillhandahålls av Folkhälsomyndigheten. Därigenom kan typningen oftast ske en dag snabbare än om det rekommenderade transportsubstratet används.
  
 
== B. Provtagning för parasitologisk undersökning ==  
 
== B. Provtagning för parasitologisk undersökning ==  
=== Provtagningsanvisningar ===
+
Se [[Provtagning och transport|provtagningsinstruktion]]
 
 
Allmänt
 
Intag av koltabletter och röntgenkontrastmedel försvårar bedömningen av såväl fixerad som färsk feces och bör undvikas innan provtagning.
 
 
 
==== Provtagningsmaterial ====
 
Provtagningskärl med sked samt passande ytterhylsa användes. SAF-fixativ (sodium acetate – acetic acid – formalin) rekommenderas som transport¬medel för fecesparasiter, då trofozoiter, cystor, maskar och oocystor kan på¬visas med utgångspunkt från SAF-fixerat provmaterial. Formalinfixerat ma¬terial är ej lämpligt för trofozoitpåvisning.
 
 
 
==== Provtagningsinstruktioner ====
 
Feces uppsamlas från blöja eller ren toalettstol där flera lager toalettpapper har lagts på vattnet. Det är mycket viktigt att avföringen ej blandas med urin eller vatten från toalettstolen. Vid mycket lös avföring är det bättre att an¬vända ett engångskärl, t.ex. en pappersrondskål. Två till tre skedar, mängden är beroende av provtagningskärl, se lokala anvisningar, feces förs ned i provtagningskärlet med skeden som sitter i locket. OBS! Om feces innehåller blodiga eller slemmiga partier tas prov även från dessa ställen. Provet blan¬das mycket noggrant med fixativet. Locket skruvas till omsorgsfullt, varefter provtagningskärlet märks med namn, personnummer samt avsändare och provtagningsdatum. Därefter förs provtagningskärlet ned i ytterhylsan.
 
 
 
 
 
==== Cystor, maskägg, etc. ====
 
SAF-fixativ rekommenderas, men en del laboratorier föredrar ofixerade eller formalinfixera prov. Aktuellt parasitologiskt laboratorium bör kontaktas för information innan provtagning sker.
 
 
 
==== Trofozoitpåvisning ====
 
”Färskprov” tas i kärl utan tillsats och bör undersökas inom en timme efter provtagning. Det är därför viktigt att laboratoriet kontaktas innan provtag¬ning sker. Om trikromfärgning önskas blandas nytaget fecesprov med SAF-fixativ enligt provtagningsinstruktionerna ovan.
 
  
 
== C. Provtagning för påvisande av virus, virusantigener eller virusodling ==
 
== C. Provtagning för påvisande av virus, virusantigener eller virusodling ==
Provtagningskärl med sked och ytterhylsa används varvid minst 3-4 skedar feces tas från blöja, värmedesinfekterat bäcken eller feces lagt på toalett¬papper. Prov¬tagningskärlet måste märkas med namn och person¬nummer innan det förs ned i ytterhylsan. Kolade pinnar fungerar ej för påvisning av virus eller virusantigen. Vid diarréutbrott där misstanke om calicivirus förekommer rekommenderas provtagning för mikrobiologisk diagnostik från 3-5 patienter med aktuella symtom. Vid önskemål kan kräkningar under¬sökas men aktuella under¬sök¬ningsmetoder är ej validerade.
+
Provtagningskärl med sked och ytterhylsa används varvid minst 3-4 skedar feces tas från blöja, värmedesinfekterat bäcken eller feces lagt på toalettpapper. Provtagningskärlet måste märkas med namn och personnummer innan det förs ned i ytterhylsan. Kolade pinnar fungerar ej för påvisning av virus eller virusantigen. Vid diarréutbrott där misstanke om calicivirus förekommer rekommenderas provtagning för mikrobiologisk diagnostik från 3-5 patienter med aktuella symtom. Vid önskemål kan kräkningar undersökas men aktuella undersökningsmetoder är ej validerade.
  
 
== D. Blodprov för serologisk undersökning ==
 
== D. Blodprov för serologisk undersökning ==
Serologisk undersökning kan utföras efter särskild överenskommelse. Se¬rum bör avskiljas innan transport. I allmänhet rekommenderas ett par mL serum utan tillsats men med modern teknik klarar man sig vanligen med betydligt mindre volymer. För tolkning av aktuell infektion bör parade sera användas, d.v.s. ett akut prov så tidigt i förloppet som möjligt och ett kon¬valescentprov taget 3-4 veckor efter insjuknandet.
+
Serologisk undersökning kan utföras efter särskild överenskommelse. Serum bör avskiljas innan transport. I allmänhet rekommenderas ett par mL serum utan tillsats men med modern teknik klarar man sig vanligen med betydligt mindre volymer. För tolkning av aktuell infektion bör parade sera användas, d.v.s. ett akut prov så tidigt i förloppet som möjligt och ett konvalescentprov taget 3-4 veckor efter insjuknandet.
  
 
== E. Remiss och transport ==
 
== E. Remiss och transport ==
 
=== Remiss ===
 
=== Remiss ===
Till provet som är märkt med personuppgifter fogas en separat förpackad remiss med uppgifter om patientdata, avsändare, provtagningsdag, prov¬material samt önskad undersökning. På remissen till laboratoriet skall även anges misstänkt infektionsort samt misstänkt smittkälla. Denna information är essentiell för smittskyddsorganisationerna i det epidemiologiska arbetet att snabbt identifiera smittkällor. Även preliminära resultat från avsändande laboratorium bör anges på remiss till referenslaboratorium.
+
Till provet som är märkt med personuppgifter fogas en separat förpackad remiss med uppgifter om patientdata, avsändare, provtagningsdag, provmaterial samt önskad undersökning. På remissen till laboratoriet skall även anges misstänkt infektionsort samt misstänkt smittkälla. Denna information är essentiell för smittskyddsorganisationerna i det epidemiologiska arbetet att snabbt identifiera smittkällor. Även preliminära resultat från avsändande laboratorium bör anges på remiss till referenslaboratorium.
  
 
=== Transport ===
 
=== Transport ===
 
Prov bör omgående sändas till laboratoriet. Parasitologiska ”färskprover” för trofozoitbestämning skall analyseras inom en timme om de inte fixeras (Se Bilaga 6.3).  
 
Prov bör omgående sändas till laboratoriet. Parasitologiska ”färskprover” för trofozoitbestämning skall analyseras inom en timme om de inte fixeras (Se Bilaga 6.3).  
  
Bakteriologiska pinnprov i transportsubstrat skall vara laboratoriet tillhanda inom 24 timmar och fecesprov utan transportmedium för odling skall vara laboratoriet tillhanda inom 6 timmar efter provtagning. Är detta inte möjligt kan transporttiden förlängas till <48 respektive <24 timmar om provet för¬varas och transporteras kylt. Följs inte dessa transporttider finns stor risk att patogener som t.ex. Shigella ej längre är viabla i provet.
+
Bakteriologiska pinnprov i transportsubstrat skall vara laboratoriet tillhanda inom 24 timmar och fecesprov utan transportmedium för odling skall vara laboratoriet tillhanda inom 6 timmar efter provtagning. Är detta inte möjligt kan transporttiden förlängas till <48 respektive <24 timmar om provet förvaras och transporteras kylt. Följs inte dessa transporttider finns stor risk att patogener som t.ex. ''Shigella'' ej längre är viabla i provet.
 
 
Biopsier för odling av Helicobacter pylori skall transporteras i ett speciellt transportmedium, t.ex. Portagerm, och en transporttid om 48 timmar kan accepteras.  
+
Biopsier för odling av ''Helicobacter pylori'' skall transporteras i ett speciellt transportmedium, t.ex. Portagerm, och en transporttid om 48 timmar kan accepteras.  
 
 
För virusanalyser kan feces transporteras vid rumstemperatur. Viruspartik¬lar och virusantigen är förhållandevis stabila under transport. Feces ska ej frysas.
+
För virusanalyser kan feces transporteras vid rumstemperatur. Viruspartiklar och virusantigen är förhållandevis stabila under transport. Feces ska ej frysas.
 
 
För alla prov gäller att de skall förpackas på ett sådant sätt att provmateria¬let kommer fram i oförändrat skick och att innehållet inte kan läcka ut vid ovarsam behandling. Principen provkärl, absorberande material, skydds¬hylsa samt ytterförpackning gäller genomgående. Förpackningar beskrivs i ”Packa provet rätt” som kan hämtas på SMI’s hemsida under rubrik ”Ana¬lyser vid SMI” och i Guidelines for the safe transport of infectious substan¬ces and diagnostic specimens.
+
För alla prov gäller att de skall förpackas på ett sådant sätt att provmaterialet kommer fram i oförändrat skick och att innehållet inte kan läcka ut vid ovarsam behandling. Principen provkärl, absorberande material, skyddshylsa samt ytterförpackning gäller genomgående. Förpackningar beskrivs i ”Packa provet rätt” och i Guidelines for the safe transport of infectious substances and diagnostic specimens.
 +
 
 +
Majoriteten av diagnostiska prov packas enligt SS-EN 829. Särskilt stränga krav gäller för transport av prov som faller under ”Klass 6.2, Smittförande ämnen” enligt ADR-S. Till denna kategori räknas även de diagnostiska prov som med hög sannolikhet innehåller patogener i skyddsklass 2 eller 3 trots att smittrisken vid korrekt förpackning är försumbar. Alla kulturer räknas numera till ”Klass 6.2 Smittförande ämnen”.
  
Majoriteten av diagnostiska prov packas enligt SS-EN 829.
 
Särskilt stränga krav gäller för transport av prov som faller under ”Klass 6.2, Smittförande ämnen” enligt ADR-S. Till denna kategori räknas även de diagnostiska prov som med hög sannolikhet innehåller patogener i skyddsklass 2 eller 3 trots att smittrisken vid korrekt förpackning är för¬sumbar. Alla kulturer räknas numera till ”Klass 6.2 Smittförande ämnen”.
 
  
Arbete pågår för en anpassning av broschyren ”Packa provet rätt” till revi¬derade regelsystem (SRVFS 2001:1). En uppdaterad version kommer så snart denna är fastställd att läggas ut på SMI:s hemsida.
+
http://www.folkhalsomyndigheten.se/pagefiles/12867/packa-provet-ratt.pdf
  
 
== Litteratur ==
 
== Litteratur ==
Rad 71: Rad 55:
  
 
*SRVFS 2001:1 ADR-S Statens räddningsverks föreskrifter om transport av farligt gods på väg och i terräng.
 
*SRVFS 2001:1 ADR-S Statens räddningsverks föreskrifter om transport av farligt gods på väg och i terräng.
 +
 +
*Amies transport medium with charcoal, Condalab [http://www.condalab.com/pdf/1535.pdf]
 
   
 
   
[[Kategori:Provtagning]]
+
[[Kategori:Provtagning-Infektioner i mag-tarmkanalen‎]]

Nuvarande version från 10 januari 2014 kl. 15.39

Till innehållsförteckning för Referensmetodik: Tarminfektioner, 2:a upplagan 2002


Upprepad provtagning ger signifikant fler positiva fynd än enstaka prov. Utbytet torde inte vara större än 70-80 % vid varje provtagningstillfälle. En utredning av gastroenterit efter inhemsk smitta och av personal i riskyrken bör därför omfatta 2-3 prov.

A. Bakteriologisk provtagning[redigera]

I. Pinnprov[redigera]

1. Som provtagningspinne och transportsubstrat för bakteriologisk odling förordas Copan Amies W/CH N.L1075 innehållande Amies kolade transportsubstrat samt provtagningspinne [1]. Provtagningskärlet skall alltid märkas med personuppgifter, avsändare och provtagningsdatum.

Provtagning[redigera]

a) Pottprov. Provtagningspinnen doppas i feces som lagts på blöja, i värmedesinfekterat bäcken eller ovanpå toalettpapper i ett rent kärl. Kontrollera att spetsen på pinnen blivit förorenad med tarminnehåll. Pinnen sticks ned i transportmediet och lämnas kvar i röret. Rekommenderas i första hand då patienten tar provet själv. b) Analsvabb. Provtagningspinnen stryks mot ändtarmsöppningen genast efter avföring innan torkning med papper. Kontrollera att spetsen på pinnen blivit förorenad med tarminnehåll. Pinnen sticks ned i transportmediet och lämnas kvar i röret. Används som alternativ metod i lämpliga fall. c) Rektalsvabb. Vid rektoskopering tas prov direkt från rektalslemhinnan med provtagningspinne varefter pinnen sticks ned i transportsubstratet. Rektalsvabb förordas vid diarré med ulcerationer i slemhinnan.

II. Feces i provtagningskärl[redigera]

Om undersökningen avser påvisande av toxin med biologisk metod eller immunologisk teknik skall fecesprov i provtagningskärl användas. Provtagningskärl med sked och ytterhylsa används varvid 2-3 skedar feces (totalt ca 10 g vid undersökning av anaerob flora) tas från blöja, värmedesinfekterat bäcken eller från feces lagt på toalettpapper i ett rent kärl. Feces förs ned i provtagningskärlet, locket skruvas till omsorgsfullt, varefter provtagningskärlet märks med namn och personnummer samt avsändare och provtagningsdatum. Därefter förs kärlet ned i ytterhylsan.

III. Renkultur[redigera]

Bakteriologiska renkulturer kan vanligen transporteras i det rekommenderade transportsubstratet. För vissa undersökningar vid Folkhälsomyndigheten rekommenderas annat transportsätt. Kultur för epidemiologisk typning av Salmonella species, Shigella species, Yersinia species samt kultur eller primärstryk för påvisande av EHEC och andra patogena E. coli transporteras helst på det snedagarrör som (f.n. kostnadsfritt) tillhandahålls av Folkhälsomyndigheten. Därigenom kan typningen oftast ske en dag snabbare än om det rekommenderade transportsubstratet används.

B. Provtagning för parasitologisk undersökning[redigera]

Se provtagningsinstruktion

C. Provtagning för påvisande av virus, virusantigener eller virusodling[redigera]

Provtagningskärl med sked och ytterhylsa används varvid minst 3-4 skedar feces tas från blöja, värmedesinfekterat bäcken eller feces lagt på toalettpapper. Provtagningskärlet måste märkas med namn och personnummer innan det förs ned i ytterhylsan. Kolade pinnar fungerar ej för påvisning av virus eller virusantigen. Vid diarréutbrott där misstanke om calicivirus förekommer rekommenderas provtagning för mikrobiologisk diagnostik från 3-5 patienter med aktuella symtom. Vid önskemål kan kräkningar undersökas men aktuella undersökningsmetoder är ej validerade.

D. Blodprov för serologisk undersökning[redigera]

Serologisk undersökning kan utföras efter särskild överenskommelse. Serum bör avskiljas innan transport. I allmänhet rekommenderas ett par mL serum utan tillsats men med modern teknik klarar man sig vanligen med betydligt mindre volymer. För tolkning av aktuell infektion bör parade sera användas, d.v.s. ett akut prov så tidigt i förloppet som möjligt och ett konvalescentprov taget 3-4 veckor efter insjuknandet.

E. Remiss och transport[redigera]

Remiss[redigera]

Till provet som är märkt med personuppgifter fogas en separat förpackad remiss med uppgifter om patientdata, avsändare, provtagningsdag, provmaterial samt önskad undersökning. På remissen till laboratoriet skall även anges misstänkt infektionsort samt misstänkt smittkälla. Denna information är essentiell för smittskyddsorganisationerna i det epidemiologiska arbetet att snabbt identifiera smittkällor. Även preliminära resultat från avsändande laboratorium bör anges på remiss till referenslaboratorium.

Transport[redigera]

Prov bör omgående sändas till laboratoriet. Parasitologiska ”färskprover” för trofozoitbestämning skall analyseras inom en timme om de inte fixeras (Se Bilaga 6.3).

Bakteriologiska pinnprov i transportsubstrat skall vara laboratoriet tillhanda inom 24 timmar och fecesprov utan transportmedium för odling skall vara laboratoriet tillhanda inom 6 timmar efter provtagning. Är detta inte möjligt kan transporttiden förlängas till <48 respektive <24 timmar om provet förvaras och transporteras kylt. Följs inte dessa transporttider finns stor risk att patogener som t.ex. Shigella ej längre är viabla i provet.

Biopsier för odling av Helicobacter pylori skall transporteras i ett speciellt transportmedium, t.ex. Portagerm, och en transporttid om 48 timmar kan accepteras.

För virusanalyser kan feces transporteras vid rumstemperatur. Viruspartiklar och virusantigen är förhållandevis stabila under transport. Feces ska ej frysas.

För alla prov gäller att de skall förpackas på ett sådant sätt att provmaterialet kommer fram i oförändrat skick och att innehållet inte kan läcka ut vid ovarsam behandling. Principen provkärl, absorberande material, skyddshylsa samt ytterförpackning gäller genomgående. Förpackningar beskrivs i ”Packa provet rätt” och i Guidelines for the safe transport of infectious substances and diagnostic specimens.

Majoriteten av diagnostiska prov packas enligt SS-EN 829. Särskilt stränga krav gäller för transport av prov som faller under ”Klass 6.2, Smittförande ämnen” enligt ADR-S. Till denna kategori räknas även de diagnostiska prov som med hög sannolikhet innehåller patogener i skyddsklass 2 eller 3 trots att smittrisken vid korrekt förpackning är försumbar. Alla kulturer räknas numera till ”Klass 6.2 Smittförande ämnen”.


http://www.folkhalsomyndigheten.se/pagefiles/12867/packa-provet-ratt.pdf

Litteratur[redigera]

  • WHO/EMC/97:3 Guidelines for the safe transport of infectious substances and diagnostic specimens.
  • SS-EN 829 In-vitro-diagnostik – Transportförpackningar för medicinska och biologiska prover – Krav, provning
  • SRVFS 2001:1 ADR-S Statens räddningsverks föreskrifter om transport av farligt gods på väg och i terräng.
  • Amies transport medium with charcoal, Condalab [2]