Skillnad mellan versioner av "Enterokocker och streptokocker-minimikriterier vid speciesbestämning"

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik
Hoppa till navigering Hoppa till sök
 
(25 mellanliggande sidversioner av 2 användare visas inte)
Rad 9: Rad 9:
  
  
−
=== ''Enterococcus faecalis'' ===
+
=== ''Enterococcus faecalis'','' Enterococcus faecium'' och vankomycinresistenta enterokocker (VRE), referensmetodik ===
  
−
Typisk kolonimorfologi. Växer på 6,5 % NaCl-agar. Positiv för pyrrolydonylarylamidas. Galla-eskulinpositiv. Tellurit (konc. 0,04 %) positiv. Arabinosnegativ.
+
*Diagnostiska minimikriterier för enterokocker och de vanligaste arterna inklusive VRE redovisas i [[Bilagor till VRE-diagnostiken]].
  
−
Anm. Även Grupp D streptokocker blir positiva i galla-eskulin.
+
*I artikeln [[Vankomycinresistenta enterokocker (VRE), referensmetodik]] beskrivs utförligt mikrobiologisk referensmetodik för diagnostik av VRE.
  
−
''Enterococcus casseliflavus'' kan vara positiva för tellurit (<3 %).
 
  
−
=== ''Enterococcus faecium'' ===
+
I Folkhälsomyndighetens (Smittskyddsinstitutets) kunskapsunderlag ''Vankomycinresistenta-enterokocker-VRE-2011'' finns olika aspekter av problemområdet VRE beskrivna.<Ref>[http://www.folkhalsomyndigheten.se/pagefiles/12851/vankomycinresistenta-enterokocker-VRE.pdf Vankomycinresistenta-enterokocker-VRE-2011-11-1]]</Ref> Kunskapsunderlaget innehåller avsnitt om diagnostisk referensmetodik av VRE, som ligger till grund för de som presenteras i denna Wikiupplaga. Det ska observeras att kunskapsunderlagets version inte underkastats konsensusbeslut, varför endast Wikiupplagan har status som referensmetodik.
  
−
Växer på 6,5 % NaCl-agar. Positiv för pyrrolydonylarylamidas. Galla-eskulinpositiv. Tellurit ( konc. 0,04 %) negativ. Arabinospositiv.
+
=== ''Streptococcus pneumoniae'', pneumokocker elementkod ATCC 33400 === 
  
−
Anm. Även Grupp D streptokocker blir positiva i galla-eskulin.
+
Grampositiva diplokocker, ibland i korta kedjor, med alfahemolys. Kolonierna är ofta släta, navlade 0,5-1 mm i diameter stora eller slemmiga glänsande kolonier på ca 5 mm i diameter. Kolonimorfologin kan variera beroende på om pneumokockerna är kapslade eller ej. De icke kapslade liknar alfastreptokocker och skiljs från dessa genom att de är optochinkänsliga, vilket testas med optochinlapp på blodagarplatta (gränsvärde enligt tillverkaren).  OBS att ca 1 % av pneumokocker kan vara optochin-resistenta.  
  
−
=== ''Streptococcus pneumoniae'', pneumokocker  elementkod ATCC 33400 ===
+
Vid tveksamhet kan pneumokockerna testas med gallöslighetstest, varvid bakteriernas känslighet för natriumdeoxycholat (2 % eller 10 %) studeras. Pneumokocker lyserar när natriumdeoxycholat tillsätts vilket inte alfastreptokocker gör. Dock kan < 1 % av pneumokocker vara icke känsliga för natriumdeoxycholat.  
−
 
−
Grampositiva diplokocker, ibland i korta kedjor, med alfahemolys. Kolonierna är ofta släta, navlade 0,5-1 mm i diameter stora eller slemmiga glänsande kolonier på ca 5 mm i diameter. Kolonimorfologin kan variera beroende på om pneumokockerna är kapslade eller ej. De icke kapslade liknar alfastreptokocker och skiljs från dessa genom att de är optochinkänsliga, vilket testas med optochinlapp på blodagarplatta (gränsvärde enligt tillverkaren). Vid tveksamhet kan pneumokockerna testas med gallöslighetstest, varvid bakteriernas känslighet för natriumdeoxycholat (2 % eller 10 %) studeras.  
 
  
−
Pneumokocker lyserar när natriumdeoxycholat tillsätts vilket inte alfastreptokocker gör. Dock kan < 1 % av pneumokocker vara icke känsliga för natriumdeoxycholat. Ett isolat som misstänks vara pneumokocker, men som inte kunnat verifieras, kan sändas till Smittskyddsinstitutet för vidare typning.
+
Ett isolat som misstänks vara pneumokocker, men som inte kunnat verifieras, kan sändas till Folkhälsomyndigheten för vidare typning.
  
 +
Se för övrigt artikel [[Streptococcus pneumoniae]]
  
 
=== ''Streptococcus pyogenes'', grupp A Streptokocker (GAS), elementkod ATCC 12344 ===
 
=== ''Streptococcus pyogenes'', grupp A Streptokocker (GAS), elementkod ATCC 12344 ===
  
−
Betahemolys på blodagar. Stora kolonier med påvisbart Lancefieldantigen A.
+
Se [[Streptococcus pyogenes]]
  
 
=== Streptococcus agalactiae, grupp B Streptokocker (GBS), elemetkod ATCC 13813 ===
 
=== Streptococcus agalactiae, grupp B Streptokocker (GBS), elemetkod ATCC 13813 ===
  
−
Varierande hemolys (alfa, beta eller ingen) på blodagar. Lancefield-antigen B påvisbart eller positiv CAMP-test.
+
Se [[Streptococcus agalactiae (GBS)]]
−
 
 
  
 
== Gruppbestämning ==
 
== Gruppbestämning ==
Rad 44: Rad 41:
 
=== Enterokocker ===
 
=== Enterokocker ===
  
−
Växer på 6,5 % NaCl-agar. Positiv agglutinationstest för Lancefield D. Galla-eskulinpositiv (observera att även grupp D streptokocker blir positiva).
+
Diagnostiska minimikriterier för enterokocker och de vanligaste arterna inklusive VRE redovisas i [[Bilagor till VRE-diagnostiken]].
−
 
 
  
 
=== Grupp C Streptokocker (GCS), elementkod UMLSCUIC 0318158 ===
 
=== Grupp C Streptokocker (GCS), elementkod UMLSCUIC 0318158 ===
Rad 57: Rad 53:
 
Anm. VP-negativ.
 
Anm. VP-negativ.
  
−
=== Streptokocker tillhörande Streptococcus milleri-gruppen, elementkod QU 66726 ===
+
=== Streptokocker tillhörande ''Streptococcus anginosus''-gruppen (tidigare ''S. milleri''-gruppen) ===
  
−
Typisk kolonimorfologi ofta nålspetsstora (pinpoint). Växer bäst i CO2-miljö.Varierande hemolys (alfa, beta eller ingen) på blod-agar. Påvisbar agglutination för Lancefieldantigen A, C, G, H eller F. VP-positiv. Innefattar ''Streptococcus anginosus, Streptococcus constellatus, Streptococcus intermedius''. [[Typas enligt särskilt schema]]
+
Typisk kolonimorfologi ofta nålspetsstora (pinpoint). Växer bäst i CO<SUB>2</SUB>-miljö.Varierande hemolys (alfa, beta eller ingen) på blod-agar. Påvisbar agglutination för Lancefieldantigen A, C, G, H eller F. VP-positiv. Innefattar ''Streptococcus anginosus, Streptococcus constellatus, Streptococcus intermedius''.  
  
 
Anm. Stor variation i koloniutseende och hemolys. Ofta typisk lukt av smörkola.
 
Anm. Stor variation i koloniutseende och hemolys. Ofta typisk lukt av smörkola.
Rad 65: Rad 61:
 
=== Grupp D Streptokocker (GDS) ===
 
=== Grupp D Streptokocker (GDS) ===
  
−
Ingen växt på 6,5 % NaCl-agar. Positiv på galla-eskulinagar. Negativ PYR-test. Påvisbar agglutination för Lancefi¬eld-D-antigen. Inkluderar exempelvis Streptococcus bovis och Pediococcus.
+
Ingen växt på 6,5 % NaCl-agar. Positiv på galla-eskulinagar. Negativ PYR-test. Påvisbar agglutination för Lancefield-D-antigen. Inkluderar exempelvis ''Streptococcus bovis'' och ''Pediococcus''.
 
Anm. Av intresse vid septikemi.
 
Anm. Av intresse vid septikemi.
−
 
−
 
  
 
=== Alfastreptokocker, elementkod QU 60542 ===
 
=== Alfastreptokocker, elementkod QU 60542 ===
Rad 77: Rad 71:
  
 
Benämningen kräver att arterna under speciesbestämning är uteslutna via subjektiva eller objektiva metoder.
 
Benämningen kräver att arterna under speciesbestämning är uteslutna via subjektiva eller objektiva metoder.
−
 
−
=== Vankomycinresistenta enterokocker (VRE) ===
 
−
 
−
VRE (vankomycinresistenta ''Enterococcus faecalis'' eller ''Enterococcus faecium''). VRE är orörliga. Isolatet skall verifieras, för närvarande med avseende på van A -och van B-gen samt typas epidemiologiskt.
 
−
 
−
Anm. Växer på 6,5 % NaCl-agar. Positiv pyrrolydonylarylamidas. Positiv i agglutinationstest för Lancefield D. Galla-eskulinpositiv (observera att även andra grupp D streptokocker blir positiva). Tellurit positiv/negativ. van C förekommer hos vissa rörliga enterokocker (''E. casseliflavus, E. gallinarium'').
 
−
 
−
 
  
 
== Tabell 9. Sammanfattande tabell för speciesbestämning av enterokocker/streptokocker ==
 
== Tabell 9. Sammanfattande tabell för speciesbestämning av enterokocker/streptokocker ==
Rad 110: Rad 96:
 
|''Enterococcus faecium'' || +|| + || D ||- ||- ||+|| -|| +|| - ||- ||+     
 
|''Enterococcus faecium'' || +|| + || D ||- ||- ||+|| -|| +|| - ||- ||+     
 
|-bgcolor="#CCCCFF"
 
|-bgcolor="#CCCCFF"
−
|''Streptococcus pneumoniae''|| -|| - || - ||+ || +||-* || -|| -|| - ||- ||-
+
|''Streptococcus pneumoniae''|| -|| - || - ||+ || +||-<math>^1</math> || -|| -|| - ||- ||-
 
|-bgcolor="#EBC2AF"
 
|-bgcolor="#EBC2AF"
 
|''Streptococcus pyogenes'' (GAS)  || -|| -|| A ||- ||- ||+ || -|| -|| - ||- ||-   
 
|''Streptococcus pyogenes'' (GAS)  || -|| -|| A ||- ||- ||+ || -|| -|| - ||- ||-   
Rad 116: Rad 102:
 
|''Streptococcus agalactiae'' (GBS)|| -|| -|| B ||- ||- ||-|| -|| -|| + ||- ||+       
 
|''Streptococcus agalactiae'' (GBS)|| -|| -|| B ||- ||- ||-|| -|| -|| + ||- ||+       
 
|}
 
|}
−
*= Vissa stammar av ''S. pneumoniae'' kan vara PYR-positiva.
+
<math>^1</math>Vissa stammar av ''S. pneumoniae'' kan vara PYR-positiva.
 +
 
 +
==Länkar==
  
 +
<references/>
  
 
[[Kategori:Diagnostiska minimikriterier]]
 
[[Kategori:Diagnostiska minimikriterier]]

Nuvarande version från 14 januari 2014 kl. 16.05

Till innehållsförteckningen för Referensmetodik: Laboratoriemetoder

Minimikriterier för speciesbestämning av enterokocker och streptokocker[redigera]

Karakteristiskt koloniutseende.Växer både i aerob och anaerob miljö. Grampositiva kocker i kedjor eller i diploställning. Katalasnegativa.


Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium och vankomycinresistenta enterokocker (VRE), referensmetodik[redigera]


I Folkhälsomyndighetens (Smittskyddsinstitutets) kunskapsunderlag Vankomycinresistenta-enterokocker-VRE-2011 finns olika aspekter av problemområdet VRE beskrivna.[1] Kunskapsunderlaget innehåller avsnitt om diagnostisk referensmetodik av VRE, som ligger till grund för de som presenteras i denna Wikiupplaga. Det ska observeras att kunskapsunderlagets version inte underkastats konsensusbeslut, varför endast Wikiupplagan har status som referensmetodik.

Streptococcus pneumoniae, pneumokocker elementkod ATCC 33400[redigera]

Grampositiva diplokocker, ibland i korta kedjor, med alfahemolys. Kolonierna är ofta släta, navlade 0,5-1 mm i diameter stora eller slemmiga glänsande kolonier på ca 5 mm i diameter. Kolonimorfologin kan variera beroende på om pneumokockerna är kapslade eller ej. De icke kapslade liknar alfastreptokocker och skiljs från dessa genom att de är optochinkänsliga, vilket testas med optochinlapp på blodagarplatta (gränsvärde enligt tillverkaren). OBS att ca 1 % av pneumokocker kan vara optochin-resistenta.

Vid tveksamhet kan pneumokockerna testas med gallöslighetstest, varvid bakteriernas känslighet för natriumdeoxycholat (2 % eller 10 %) studeras. Pneumokocker lyserar när natriumdeoxycholat tillsätts vilket inte alfastreptokocker gör. Dock kan < 1 % av pneumokocker vara icke känsliga för natriumdeoxycholat.

Ett isolat som misstänks vara pneumokocker, men som inte kunnat verifieras, kan sändas till Folkhälsomyndigheten för vidare typning.

Se för övrigt artikel Streptococcus pneumoniae

Streptococcus pyogenes, grupp A Streptokocker (GAS), elementkod ATCC 12344[redigera]

Se Streptococcus pyogenes

Streptococcus agalactiae, grupp B Streptokocker (GBS), elemetkod ATCC 13813[redigera]

Se Streptococcus agalactiae (GBS)

Gruppbestämning[redigera]

Enterokocker[redigera]

Diagnostiska minimikriterier för enterokocker och de vanligaste arterna inklusive VRE redovisas i Bilagor till VRE-diagnostiken.

Grupp C Streptokocker (GCS), elementkod UMLSCUIC 0318158[redigera]

Stora betahemolyserande kolonier med positivt agglutinationstest för Lancefieldantigen C. Anm. VP-negativ.

Grupp G Streptokocker (GGS)[redigera]

Stora betahemolyserande kolonier med positivt agglutinationstest för Lancefieldantigen G. Anm. VP-negativ.

Streptokocker tillhörande Streptococcus anginosus-gruppen (tidigare S. milleri-gruppen)[redigera]

Typisk kolonimorfologi ofta nålspetsstora (pinpoint). Växer bäst i CO2-miljö.Varierande hemolys (alfa, beta eller ingen) på blod-agar. Påvisbar agglutination för Lancefieldantigen A, C, G, H eller F. VP-positiv. Innefattar Streptococcus anginosus, Streptococcus constellatus, Streptococcus intermedius.

Anm. Stor variation i koloniutseende och hemolys. Ofta typisk lukt av smörkola.

Grupp D Streptokocker (GDS)[redigera]

Ingen växt på 6,5 % NaCl-agar. Positiv på galla-eskulinagar. Negativ PYR-test. Påvisbar agglutination för Lancefield-D-antigen. Inkluderar exempelvis Streptococcus bovis och Pediococcus. Anm. Av intresse vid septikemi.

Alfastreptokocker, elementkod QU 60542[redigera]

Varierande hemolys (alfa eller ingen) på blodagar.

Innefattar ett flertal arter såsom Streptococcus mitis, Streptococcus salivarius, Streptococcus sanguis, Granulicatella species, Gemella species, Aerococcus species., Stomatococcus species, Lactococcus species.

Benämningen kräver att arterna under speciesbestämning är uteslutna via subjektiva eller objektiva metoder.

Tabell 9. Sammanfattande tabell för speciesbestämning av enterokocker/streptokocker[redigera]

Bakterie Galla-eskulin Växt i 6,5 % NaCl Lancefield-

grupp

Optochin-

känslighet

Gall-

löslighet

PYR Tellurit (0,04 %) Arabinos CAMP-test Rörlighet VP
Enterococcus faecalis + + D - - + + - - - +
Enterococcus faecium + + D - - + - + - - +
Streptococcus pneumoniae - - - + + - - - - - -
Streptococcus pyogenes (GAS) - - A - - + - - - - -
Streptococcus agalactiae (GBS) - - B - - - - - + - +

Vissa stammar av S. pneumoniae kan vara PYR-positiva.

Länkar[redigera]

  1. ↑ Vankomycinresistenta-enterokocker-VRE-2011-11-1]
Hämtad från "http://referensmetodik.folkhalsomyndigheten.se/index.php?title=Enterokocker_och_streptokocker-minimikriterier_vid_speciesbestämning&oldid=13439"