Enterokocker och streptokocker-minimikriterier vid speciesbestämning
Till innehållsförteckningen för Referensmetodik: Laboratoriemetoder
Minimikriterier för speciesbestämning av enterokocker och streptokocker
Karakteristiskt koloniutseende.Växer både i aerob och anaerob miljö. Grampositiva kocker i kedjor eller i diploställning. Katalasnegativa.
Enterococcus faecalis
Typisk kolonimorfologi. Växer på 6,5 % NaCl-agar. Positiv för pyrrolydonylarylamidas. Galla-eskulinpositiv. Tellurit (konc. 0,04 %) positiv. Arabinosnegativ.
Anm. Även Grupp D streptokocker blir positiva i galla-eskulin.
Enterococcus casseliflavus kan vara positiva för tellurit (<3 %).
Enterococcus faecium
Växer på 6,5 % NaCl-agar. Positiv för pyrrolydonylarylamidas. Galla-eskulinpositiv. Tellurit ( konc. 0,04 %) negativ. Arabinospositiv.
Anm. Även Grupp D streptokocker blir positiva i galla-eskulin.
Vankomycinresistenta enterokocker (VRE), referensmetodik
Följ denna länk för mikrobiologisk referensmetodik för diagnostik av VRE.
VRE (vankomycinresistenta Enterococcus faecalis eller Enterococcus faecium) är orörliga. Isolatet skall verifieras, för närvarande med avseende på van A -och van B-gen samt typas epidemiologiskt.
I Smittskyddsinstitutets kunskapsunderlag Vankomycinresistenta-enterokocker-VRE-2011 finns olika aspekter av problemområdet VRE beskrivna.[1] Kunskapsunderlaget innehåller avsnitt om diagnostisk referensmetodik av VRE, som ligger till grund för de som presenteras i denna Wikiupplaga. Det ska observeras att kunskapsunderlagets version inte underkastats konsensusbeslut, varför endast Wikiupplagan har status som referensmetodik.
Streptococcus pneumoniae, pneumokocker elementkod ATCC 33400
Grampositiva diplokocker, ibland i korta kedjor, med alfahemolys. Kolonierna är ofta släta, navlade 0,5-1 mm i diameter stora eller slemmiga glänsande kolonier på ca 5 mm i diameter. Kolonimorfologin kan variera beroende på om pneumokockerna är kapslade eller ej. De icke kapslade liknar alfastreptokocker och skiljs från dessa genom att de är optochinkänsliga, vilket testas med optochinlapp på blodagarplatta (gränsvärde enligt tillverkaren). Vid tveksamhet kan pneumokockerna testas med gallöslighetstest, varvid bakteriernas känslighet för natriumdeoxycholat (2 % eller 10 %) studeras.
Pneumokocker lyserar när natriumdeoxycholat tillsätts vilket inte alfastreptokocker gör. Dock kan < 1 % av pneumokocker vara icke känsliga för natriumdeoxycholat. Ett isolat som misstänks vara pneumokocker, men som inte kunnat verifieras, kan sändas till Smittskyddsinstitutet för vidare typning.
Streptococcus pyogenes, grupp A Streptokocker (GAS), elementkod ATCC 12344
Betahemolys på blodagar. Stora kolonier med påvisbart Lancefieldantigen A.
Streptococcus agalactiae, grupp B Streptokocker (GBS), elemetkod ATCC 13813
Varierande hemolys (alfa, beta eller ingen) på blodagar. Lancefield-antigen B påvisbart eller positiv CAMP-test.
Gruppbestämning
Enterokocker
Växer på 6,5 % NaCl-agar. Positiv agglutinationstest för Lancefield D. Galla-eskulinpositiv (observera att även grupp D streptokocker blir positiva).
Grupp C Streptokocker (GCS), elementkod UMLSCUIC 0318158
Stora betahemolyserande kolonier med positivt agglutinationstest för Lancefieldantigen C. Anm. VP-negativ.
Grupp G Streptokocker (GGS)
Stora betahemolyserande kolonier med positivt agglutinationstest för Lancefieldantigen G. Anm. VP-negativ.
Streptokocker tillhörande Streptococcus milleri-gruppen, elementkod QU 66726
Typisk kolonimorfologi ofta nålspetsstora (pinpoint). Växer bäst i CO2-miljö.Varierande hemolys (alfa, beta eller ingen) på blod-agar. Påvisbar agglutination för Lancefieldantigen A, C, G, H eller F. VP-positiv. Innefattar Streptococcus anginosus, Streptococcus constellatus, Streptococcus intermedius.
Anm. Stor variation i koloniutseende och hemolys. Ofta typisk lukt av smörkola.
Grupp D Streptokocker (GDS)
Ingen växt på 6,5 % NaCl-agar. Positiv på galla-eskulinagar. Negativ PYR-test. Påvisbar agglutination för Lancefield-D-antigen. Inkluderar exempelvis Streptococcus bovis och Pediococcus. Anm. Av intresse vid septikemi.
Alfastreptokocker, elementkod QU 60542
Varierande hemolys (alfa eller ingen) på blodagar.
Innefattar ett flertal arter såsom Streptococcus mitis, Streptococcus salivarius, Streptococcus sanguis, Granulicatella species, Gemella species, Aerococcus species., Stomatococcus species, Lactococcus species.
Benämningen kräver att arterna under speciesbestämning är uteslutna via subjektiva eller objektiva metoder.
Tabell 9. Sammanfattande tabell för speciesbestämning av enterokocker/streptokocker
Bakterie | Galla-eskulin | Växt i 6,5 % NaCl | Lancefield-
grupp |
Optochin-
känslighet |
Gall-
löslighet |
PYR | Tellurit (0,04 %) | Arabinos | CAMP-test | Rörlighet | VP |
Enterococcus faecalis | + | + | D | - | - | + | + | - | - | - | + |
Enterococcus faecium | + | + | D | - | - | + | - | + | - | - | + |
Streptococcus pneumoniae | - | - | - | + | + | - | - | - | - | - | - |
Streptococcus pyogenes (GAS) | - | - | A | - | - | + | - | - | - | - | - |
Streptococcus agalactiae (GBS) | - | - | B | - | - | - | - | - | + | - | + |
Vissa stammar av S. pneumoniae kan vara PYR-positiva.