Nonfermentativa-, långsamväxande-, och övriga gramnegativa stavar-diagnostiska minimikriterier
Till innehållsförteckningen för Referensmetodik: Bakteriologisk diagnostik av infektioner i hud, mjukdelar, skelett och inre organ
och
Referensmetodik: Laboratoriemetoder
Nonfermentativa gramnegativa stavar-speciesbestämning, minimikriterier
Glukosnonfermenterande med god växt på MacConkey-agar.
Achromobacter xylosoxidans subsp xylosoxidans, elementkod ATCC 27061
Rörlig gramnegativ stav. Oxidas- och katalaspositiv. Nitrit- och citratpositiv. AD- och ureanegativ. Kommersiella brickor kan vara till hjälp, men presumtivt identifierade isolat från CF-patiener bör skickas till hänvisningslab (CCUG) för feno- och genotypisk identifiering på grund av risk för förväxling med Ralstonia och Burkholderia.
Acinetobacter species, elementkod MSHD 000150
Kockoid gramnegativ stav. Oxidasnegativ. Orörlig. ONPG-negativ. AD-negativ samt LD-negativ.
Burkholderia cepacia-komplexet, elementkod ATCC 25416
Gramnegativa stavar som växer på selektiva cepaciaplattor. Oxidaspositiv. Laktospositiv. Antingen LD- eller OD-positiv. Antingen sackaros- eller adonitol-positiv (gäller inte genomovar. VI). Bakterier som uppfyller dessa kriterier isolerade från CF-patient skickas för verifiering och vidare typning till hänvisningslaboratorium.
Observera att Ralstonia pikettii som också växer på referenssubstratet kan vara svåra att skilja från B. cepacia. Ralstonia är oxidaspositiv och laktospositiv men genomgående negativ för LD, OD, sackaros och adenitol. Sådana isolat från CF-patienter skickas också till hänvisningslaboratorium.
Burkholderia gladioli, elementkod ATCC 10248
Gramnegativa stavar som kan växa på selektiva cepaciaplattor. Oxidasnegativ med god växt på MacConkeyagar. Laktos-, LD- och OD-negativa. Glukospositiv och xylospositiv.
Pseudomonas aeruginosa, elementkod ATCC 10145
Växer vanligtvis enbart i aerob miljö men undantag finns. Oxidaspositiv. Typisk doft och typiskt utseende. Från CF-patienter är isolaten ofta mukoida alternativt mycket små kolonier.
Alternativt: Oxidaspositiv med växt i 42 oC. AD-positiv samt LD-negativ. Anm. Aeromonas kan uteslutas med spot-indol (positiv).
Kommersiella analysbrickor som API 20NE eller RapID NF Plus kan användas som komplement i oklara fall med specificitet ca 90 %.
Stenotrophomonas maltophilia, elementkod ATCC 13637
S. maltophilia är oxidasnegativa gramnegativa stavar med god växt på MacConkeyagar. ONPG-positiv, AD-negativ och LD-positiv. Dnas-positiv. Imipenem- och meropenemresistent. Ringa växt på selektiv Pseudomonas-cetrimid-agar.
Långsamväxande gramnegativa stavar-speciesbestämning, minimikriterier
Växer bäst i CO2-miljö.
Haemophilus influenzae, elementkod ATCC 33391
Gramnegativa pleomorfa stavar, oxidaspositiv, X- och V- faktorberoende. Växer bäst på chokladagarplatta med tillsats av 5 – 10 % CO2. Växer utan -hemolys på hästblodagarplatta (V-faktor behöver tillföras t.ex. i form av amning med Staphylococcus aureus). Om ytterligare identifiering erfordras; negativt porfyrintest samt kommersiell testbricka, t.ex. API-NH.
Haemophilus parainfluenzae, elementkod ATCC 33392
Gramnegativa pleomorfa stavar, oxidaspositiv, V-faktorberoende. Växer bäst på chokladagarplatta med tillsats av 5 – 10 % CO2. Växer utan -hemolys på hästblodagarplatta (V-faktor behöver tillföras t.ex. i form av amning med Staphylococcus aureus).
Om ytterligare identifiering erfordras; positivt porfyrintest samt kommersiell testbricka, t.ex. API-NH.
Actinobacillus actinomycetemcomitans, elementkod ATCC 33384
Oxidasnegativa gramnegativa stavar. Katalas- och nitritpositiva. Indol-, urea-, LD- och OD-negativa.
Tabell 13. Sammanfattande tabellarium Haemophilus species
X- faktor lapp V-faktor lapp X + V- faktor lapp Porfyrin test -hemolys på hästblod agarplatta Haemophilus influenzae 0 växt 0 växt Växt Neg Nej Haemophilus haemolyticus 0 växt 0 växt Växt Neg Ja Haemophilus parainfluenzae 0 växt Växt Växt Pos Nej Haemophilus parahaemolyticus 0 växt Växt Växt Pos Ja Haemophilus aphrophilus Växt Växt Växt Pos (svag) Nej Haemophilus paraphrophilus 0 växt Växt Växt Neg Nej
Tabell 11. Speciesbestämning, minimikriterier för vissa långsamväxande gramnegativa stavar
OX* KAT NIT IND URE LD OD AN AG Beta-hem GFER + - + - - + + + - + Eikenella corrodens** - + - + - - + + - Bacteroides ureolyticus + - - + - - - - - + Cardiobacterium hominis - + + - - - - - - - Actinobacillus actinomycetemcomi-tans - + - - - - - - - + Haemophilus aphrophilus + - - - - - - - + Capnocytophaga canimorsus - - - - - - - Capnocytophaga ochracea + - - - - - - + - Kingella kingae
- OX=Oxidas, KAT=Katalas, NIT=Nitratreduktion, IND=Indoltest, URE=Ureastest, LD=Lysindekarboxylas, OD=Ornitindekarboxylas, AN=Anaerob växt, AG=Agargrävare, beta-hem=betahemolys, GFER=Glukosfermentation
+=Positiv reaktion/egenskap (95 %),- =Negativ reaktion/egenskap (95 %), (+) varierande reaktion/egenskap.
- 6 % av Eikenella är katalaspositiva.
Gruppbestämning
Innefattar bl.a. Brucella species, Francisella species.
Övriga gramnegativa stavar Speciesbestämning, minimikriterier Pasteurella multocida Växer i aerob och anaerob miljö. Växer ej på MacConkeyagar. Oxidas- och katalas¬positiv. Indolpositiv. Typisk lukt på blodagar. Anm. API är av värde. Referensmetodik I 1 Aeromonas species, Vibrio species, Plesiomonas species, Campylobacter, Salmo¬nella, Shigella, Yersinia.
Agens associerade med speciella sjukdomstillstånd eller Klass 3 organismer Bartonella, Brucella, Streptobacillus moniliformis, Burkholderia, Francisella, Rickettsia species.
Enterobacteriaceae, diagnostiska minimikriterier
Grundkriterier
Växer i aerob och anaerob miljö. Oxidasnegativa, undantag Plesiomonas shigelloides. Glukosfermenterande med god växt på MacConkey agarplatta.
Gruppbestämning
Gramnegativa stavar tillhörande Enterobacteriaceae
Bakterier som uppfyller grundkriterierna. Innefattar bland annat Edwardsiella, Enterobacter species, Klebsiella species, Proteus species, Serratia species, Citrobacter species, Hafnia alveii.
Tabell 10a. Genus/speciesbestämning, minimikriterier för Enterobacteriaceae
| Bakterie | Laktosjäsning | VP | ONPG | Indol | Urea | H2S | LD | OD |
| Enterobacter aerogenes | + | + | + | - | - | - | + | + |
| Enterobacter cloacae | + | + | + | - | + | - | - | + |
| Escherichia coli | +/- | - | + | + | - | - | + | +/- |
| Escherichia coli, ONPG- | - | - | - | + | - | - | + | +/- |
| Klebsiella oxytoca | + | + | + | + | + | - | + | - |
| Klebsiella ornitolytica | + | + | + | + | + | - | + | + |
| Klebsiella pneumoniae | + | + | + | - | + | - | + | - |
| Morganella morganii | - | - | - | + | + | - | - | + |
| Proteus mirabilis 1). | - | +/- | - | - | + | + | - | + |
| Proteus vulgaris | - | - | - | + | + | + | - | - |
| Providentia species | - | - | - | + | -/+ | - | - | - |
| Salmonella, flera 2) och 3). | - | - | - | - | - | + | + | + |
| Salmonella Paratyphi A | - | - | - | - | - | - | - | + |
| Salmonella Typhi | - | - | - | - | - | + | + | - |
| Shigella dysenteriae, flexneri, boydii | - | - | - | -/+ | - | - | - | - |
| Shigella sonnei | - | - | + | - | - | - | - | + |
| Yersinia enterococlitica | - | - | + | +/- | +/- | - | - | + |
| Yersinia pseudotubeculosis | - | - | +/- | - | + | - | - | - |
- 1). Indolnegativ, OD-negativ Proteus kan misstänkas vara P. penneri. Dessa är alltid ampicillinresistentra och maltospositiva
- 2). Salmonella, Shigella och Yersinia verifieras enligt särskild metodik, följ respektive länk
- 3). S. Virchov (grupp C) och S. Arizona kan vara lac+.
Tabell 10b. Genus/speciesbestämning, minimikriterier för Enterobacteriaceae
| Bakterie | Laktosjäsning | VP | ONPG | Indol | Urea | H2S | LD | OD | Citrat | ADO | ARA | DNas |
| Citrobacter amalonaticus | +/- | - | + | + | + | - | - | + | + | - | + | |
| Citrobacter freundii | +/- | - | + | - | +/- | + | - | -/+ | ||||
| Citrobacter koseri Lac- | - | - | + | + | + | - | - | + | + | + | + | |
| Citrobacter koseri, Lac+ | + | - | + | + | + | - | - | + | + | + | + | |
| Serratia liquefaciens | - | + | + | - | - | - | + | + | + | - | + | + |
| Serratia marcescens | - | + | + | - | -/+ | - | + | + | + | - | - | + |