Skillnad mellan versioner av "Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:A-K"

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik
Hoppa till navigering Hoppa till sök
(Skapade sidan med '== Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier == === Förklaringar till förkortningar === * '''QU kod''' Quantity and Units code = kod, utan eget inbyggt informatio…')
 
 
(22 mellanliggande sidversioner av samma användare visas inte)
Rad 1: Rad 1:
 +
''Till innehållsförteckningen för [[ Referensmetodik: Bakteriologisk diagnostik av infektioner i hud, mjukdelar, skelett och inre organ]]''
 +
 +
----
 +
''Till artikeln [[Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:L-Y]]''
 +
 +
----
 +
 
== Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier ==
 
== Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier ==
  
Rad 4: Rad 11:
 
===  Förklaringar till förkortningar ===
 
===  Förklaringar till förkortningar ===
  
−
* '''QU kod''' Quantity and Units code = kod, utan eget inbyggt informations¬värde, av C-NPU åsatt ett element eller annat nödvändigt begrepp när det inte finns någon annan professionellt väldefinierad kod.
+
* '''QU kod''' Quantity and Units code = kod, utan eget inbyggt informationsvärde, av C-NPU åsatt ett element eller annat nödvändigt begrepp när det inte finns någon annan professionellt väldefinierad kod.
 
* '''MSH''' = Medical Subject Heading kod.
 
* '''MSH''' = Medical Subject Heading kod.
 
* '''UMLS''' = United Medical Language System.
 
* '''UMLS''' = United Medical Language System.
Rad 13: Rad 20:
 
----
 
----
  
−
=== Bakterielista ===
+
=== Bakterielista A-K ===
  
 
*QU71758---- '''''Abiotrophia adiacens'''''-se ''Granulicatella adiacens''.
 
*QU71758---- '''''Abiotrophia adiacens'''''-se ''Granulicatella adiacens''.
Rad 19: Rad 26:
 
----
 
----
 
   
 
   
−
*MSHD000150---- '''''Acinetobacter'' species''' är gramnegativa stavar i människans normalflora. De ger upphov till opportunistiska infektioner. De ses ofta i urinvägarna, särskilt hos patienter med KAD (kateter à demeure/liggkateter). Bakterierna har låg sjukdomsframkallande förmåga men är ofta antibiotikaresistenta och intres¬santa vid nosokomiala infektioner. Flera olika species finns t.ex.
+
*MSHD000150---- '''''Acinetobacter'' species''' är gramnegativa stavar i människans normalflora. De ger upphov till opportunistiska infektioner. De ses ofta i urinvägarna, särskilt hos patienter med KAD (kateter à demeure/liggkateter). Bakterierna har låg sjukdomsframkallande förmåga men är ofta antibiotikaresistenta och intressanta vid nosokomiala infektioner. Flera olika species finns t.ex.
 
**ATCC19606---- ''A. baumannii'',
 
**ATCC19606---- ''A. baumannii'',
 
**ATCC23055---- ''A. calcoaceticus'',
 
**ATCC23055---- ''A. calcoaceticus'',
Rad 26: Rad 33:
 
----
 
----
  
−
*ATCC33384---- '''''Actinobacillus actinomycetemcomitans''''' är en gramnegativ stav i människans munhåleflora. Den har låg sjukdomsframkallande förmåga men kan orsaka periodontit, munhåleabscess, fistel i thorax och endokardit. Den kan ses i blandinfektion med Actinomyces.
+
*ATCC33384---- '''''Actinobacillus (Aggregatibacter) actinomycetemcomitans''''' är en gramnegativ stav i människans munhåleflora. Den har låg sjukdomsframkallande förmåga men kan orsaka periodontit, munhåleabscess, fistel i thorax och endokardit. Den kan ses i blandinfektion med ''Actinomyces''.
 
*ATCC19392---- '''''Actinobacillus equuli'''''  och '''''A. lignieresii''''' har isolerats vid sårinfektioner och abscesser efter djurbett, '''''A. equuli''''' vid hästbett.
 
*ATCC19392---- '''''Actinobacillus equuli'''''  och '''''A. lignieresii''''' har isolerats vid sårinfektioner och abscesser efter djurbett, '''''A. equuli''''' vid hästbett.
  
 
----
 
----
  
−
*MSHD000190---- '''''Actinomyces'' species''' är en heterogen grupp av anaeroba gram¬positiva stavar i fr.a. luftvägarnas normalflora. Kan ge infektion ([[aktinomykos]]) i ansikte, halsområdet, lunga och kvinnliga bäckenet (som komplikation till intrauterin spiral).
+
*MSHD000190---- '''''Actinomyces'' species''' är en heterogen grupp av anaeroba grampositiva stavar i framför allt luftvägarnas normalflora. Kan ge infektion ([[aktinomykos]]) i ansikte, halsområdet, lunga och kvinnliga bäckenet (som komplikation till intrauterin spiral).
  
 
----
 
----
Rad 39: Rad 46:
 
----
 
----
  
−
MSHD000333---- '''''Aeromonas'' species''' är gramnegativa stavar tillhörande familjen ''Vibrionacae''. De trivs i vatten och kan förekomma normalt i tarmen. De kan orsaka sårinfektioner, septikemi, urinvägsinfektioner och gastroenteriter.
+
*MSHD000333---- '''''Aeromonas'' species''' är gramnegativa stavar tillhörande familjen ''Vibrionacae''. De trivs i vatten och kan förekomma normalt i tarmen. De kan orsaka sårinfektioner, septikemi, urinvägsinfektioner och gastroenteriter.
  
 
----
 
----
  
−
MSHD000421 Alcaligenes species är gramnegativa stavar som trivs i fuktiga miljöer såsom jord och vatten. De ger lågvirulenta, opportunis¬tiska infektioner, fr.a. hos nedgångna patienter – urinvägsinfek¬tion (KAD), bensår, sårinfektion efter amputation av nedre extremitet.
+
*MSHD000421---- '''''Alcaligenes'' species''' är gramnegativa stavar som trivs i fuktiga miljöer såsom jord och vatten. De ger lågvirulenta, opportunistiska infektioner, fr.a. hos nedgångna patienter – urinvägsinfektion (KAD), bensår, sårinfektion efter amputation av nedre extremitet.
−
QU60542
+
 
−
Alfastreptokocker utgör ett samlingsnamn för strepto¬kocker som förekommer i munhåla och på hud. De kan ha alfahemo¬lys, betahemolys eller ingen hemolys. De har låg sjukdoms¬framkallande förmåga men kan orsaka endokardit (särskilt vid tidigare klaffskador).
+
----
−
MSHD009343 Apatogena Neisseria är gramnegativa aeroba kocker som tillhör luftvägarnas normalflora. När begreppet används har N. Gonorrhoeae och N. Meningitidis uteslutits. Neisseria spp har låg sjukdomsframkallande förmåga och betraktas vanligen som normalflora.
+
 
−
ATCC09345 Arcanobacterium haemolyticum (f.d. Corynebacterium hae¬molyticum) är en grampositiv stav som kan ge faryngit och ibland skarlatinaliknande sjukdom, främst hos tonåringar. Fa¬ryngiten svarar dåligt på penicillinterapi men väl på terapi med erytromycin och andra makrolider.  
+
*QU60542---- '''[[Alfastreptokocker]]''' utgör ett samlingsnamn för streptokocker som förekommer i munhåla och på hud. De kan ha alfahemolys, betahemolys eller ingen hemolys. De har låg sjukdomsframkallande förmåga men kan orsaka [[endokardit]] (särskilt vid tidigare klaffskador).
−
MSHD001407 Bacillus species är grampositiva, sporbildande stavar som före¬kommer i vår omgivning. Alla arter utom B. Anthracis och B. Cereus har låg sjukdomsframkallande förmåga.  
+
 
−
ATCC14578 Bacillus anthracis är en klass 3 patogen som kan ge kutan antrax med moderat mortalitet och efter inhalation av sporer pulmonell antrax med upp emot 100 % mortalitet om behand¬ling inte insätts mycket tidigt.
+
----
 +
 
 +
*MSHD009343---- '''Apatogena ''Neisseria'' ''' är gramnegativa aeroba kocker som tillhör luftvägarnas normalflora. När begreppet används har ''N. gonorrhoeae'' och ''N. meningitidis'' uteslutits. ''Neisseria'' spp har låg sjukdomsframkallande förmåga och betraktas vanligen som normalflora.
 +
 
 +
----
 +
 
 +
*ATCC09345---- '''''[[Arcanobacterium haemolyticum]]''''' (f.d. ''Corynebacterium haemolyticum'') är en grampositiv stav som kan ge faryngit och ibland skarlatinaliknande sjukdom, främst hos tonåringar. Faryngiten svarar dåligt på penicillinterapi men väl på terapi med erytromycin och andra makrolider.
 +
 
 +
----
 +
 +
*MSHD001407---- '''''Bacillus'' species''' är grampositiva, sporbildande stavar som förekommer i vår omgivning. Alla arter utom ''B. anthracis'' och ''B. cereus'' har låg sjukdomsframkallande förmåga.
 +
 
 +
----
 
   
 
   
 +
*ATCC14578---- '''''[[Bacillus anthracis]]''''' är en klass 3 patogen som kan ge kutan antrax med moderat mortalitet och efter inhalation av sporer pulmonell antrax med upp emot 100 % mortalitet om behandling inte insätts mycket tidigt.
 +
 +
----
 +
 +
*ATCC14579---- '''''[[Bacillus cereus]]''''' kan bilda ett potent enterotoxin som ger upphov till matförgiftning om den får tillväxa i livsmedel, ofta risrätter. Bakterien har beskrivits vid ortopediska infektioner.
 +
 +
----
 +
 +
*ATCC06051---- '''''[[Bacillus subtilis]]''''' (höbakterien) kan i enstaka fall orsaka en kliniskt signifikant infektion. Det är ofta svårt att avgöra om ett odlingsfynd är en kontamination eller ej.
  
−
ATCC14579 Bacillus cereus kan bilda ett potent enterotoxin som ger upp¬hov till matför¬giftning om den får tillväxa i livsmedel, ofta risrätter. Bakterien har beskrivits vid ortopediska infektioner.
+
----
−
ATCC06051 Bacillus subtilis (höbakterien) kan i enstaka fall orsaka en kliniskt signifikant infektion. Det är ofta svårt att avgöra om ett odlingsfynd är en kontamination eller ej.
+
 
−
ATCC33387 Bacteroides ureolyticus är en gramnegativ stav med oklar taxonomisk tillhörighet. Isoleras från genitala infektioner, orala infektioner och sår.
+
*ATCC33387----''Bacteroides ureolyticus'', se ''Campylobacter ureolyticus''
−
ATCC25285 Bacteroides fragilis-gruppen (innefattar Bacteroides fragilis) är en stor grupp gramnegativa anaeroba stavar i tarmens nor¬malflora. De är vanliga i postoperativa blandin¬fektioner, särskilt efter kirurgi i tarm och kvinnliga genitalia. Flertalet bildar betalaktamas och kan ej behandlas med peni¬cilliner.
+
 
−
MSHD001473 Bartonella species är långsamväxande gramnegativa stavar av vilka åtminstone fyra är patogena hos människa: B. hen¬selae (cat scratch disease), B. bacilliformis  (Oroya fever), B. quin¬tana (skyttegravsfeber) och B. elizabethae (endokar¬dit).
+
----
−
MSHD001644 Bifidobacterium species är grampositiva stavar som tillhör den normala tarmfloran fr.a. hos barn. Ses sällan i samband med infektion.
+
 
−
QU60511 Betahemolyserande streptokocker (betastreptokocker) är en beteckning för stora kolonier av betahemolyserande strep¬tokocker grupp A, C eller G. Referensbeteckning är Streptococcus pyogenes, Grupp C resp. G streptokocker, förkortat S. pyogenes, GCS och GGS. GAS är ett accepterat alternativ till S. pyogenes.
+
*ATCC25285---- '''''[[Bacteroides fragilis]]''-gruppen''' (innefattar ''Bacteroides fragilis'') är en stor grupp gramnegativa anaeroba stavar i tarmens normalflora. De är vanliga i postoperativa blandinfektioner, särskilt efter kirurgi i tarm och kvinnliga genitalia. Flertalet bildar betalaktamas och kan ej behandlas med penicilliner.  
−
ATCC49260 Bilophila wadsworthia är en anaerob gramnegativ stav som främst associerats med appendicit.
+
 
−
MSHD001884 Bordetella är små gramnegativa stavar.
+
----
−
ATCC19395 Bordetella bronchiseptica tillhör luftvägsfloran hos människa och djur. I undantagsfall kan den hos människa orsaka pneu¬monit och sårinfektion.
 
−
ATCC15311 Bordetella parapertussis orsakar en kikhosteliknande sjuk¬domsbild.
 
−
ATCC09797 Bordetella pertussis ger upphov till kikhosta. Symtomen beror bl.a. på bakteriens toxinbildning.
 
−
MSHD001898 Borrelia species
 
−
Borrelia tillhör spiroketerna. Ett mycket stort antal arter finns, t.ex.
 
−
ATCC35210 B. burgdorferi,
 
−
ATCC51383 B. garinii och
 
−
ATCC51567 B. afzelii är av störst intresse vid borrelios. Sjukdomen kan ha många olika symtom bl.a. erytema migrans, led- och muskel¬symtom, trötthet, encefalit och myokardit. Med fästingar sprids spiroketerna från djur till människa.
 
−
QU66137 B. recurrentis orsakar återfallsfeber, en sjukdom som uteslutande sprids med vägglöss. Liknande sjukdomstillstånd kan orsakas av många andra arter av Borrelia.
 
−
MSHD001951 Brevibacterium species finns i mejeriprodukter men tillhör även den normala hudfloran. En distinkt ostlukt kännetecknar många isolat. Den orsakar sällan infektion hos människa men infektioner i samband med främmande kropp, dialysvätska, osteomyelit och meningit finns beskrivna.
 
−
MSHD002002 Brucella species är gramnegativa stavar som klassas som BSL 3 patogener p.g.a. av sin stora förmåga att orsaka labo¬ratorie- infektioner. Alla tillhör samma art men kan indelas i olika sub¬species med vissa skillnader i värdspecificitet.
 
−
ATCC23448 B. abortus har främst nötboskap som värd,
 
−
ATCC23456 B. melitensis har get, samt
 
−
ATCC23444 B. suis svin som värdar. Dessa samt vissa andra typer kan smitta människa via opasteuriserade mejeriprodukter. Septi¬kemi, ofta med svängande feber och sekundär osteo¬myelit, kan ses hos denna sällsynta importsjukdom.
 
−
MSHD019117 Burkholderia species (f.d. Pseudomonas) är aeroba gramne¬gativa stavar.
 
 
   
 
   
 +
*MSHD001473---- '''''[[Bartonella]]'' species''' är långsamväxande gramnegativa stavar av vilka åtminstone fyra är patogena hos människa: ''B. henselae'' (cat scratch disease), ''B. bacilliformis''  (Oroya fever), ''B. quintana'' (skyttegravsfeber) och ''B. elizabethae'' (endokardit).
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD001644---- '''''Bifidobacterium'' species''' är grampositiva stavar som tillhör den normala tarmfloran fr.a. hos barn. Ses sällan i samband med infektion.
 +
 +
----
 +
 +
*QU60511---- '''Betahemolyserande streptokocker''' (betastreptokocker) är en beteckning för stora kolonier av betahemolyserande streptokocker grupp A, C eller G. Referensbeteckning är ''Streptococcus pyogenes'', Grupp C resp. G streptokocker, förkortat ''S. pyogenes'', GCS och GGS. GAS är ett accepterat alternativ till ''S. pyogenes''.
  
−
ATCC25416 Burkholderia cepacia trivs i fuktiga miljöer. Den ger låg¬viru¬lenta, opportunistiska infektioner, fr.a. hos patienter med ned¬satt immunförsvar eller cystisk fibros (empyem, pneumoni, UVI, sårinfektion).
+
----
−
ATCC23344 Burkholderia mallei är en BSL 3 patogen som huvudsakligen drabbar häst (glanders) med förmåga att också ge allvarlig sjukdom hos människa. Smittar främst vid laboratoriearbete men kan i enstaka fall överföras direkt från häst till människa.
 
−
ATCC23343 Burkholderia  pseudomallei är även den en BSL 3 patogen p.g.a. sin förmåga att lätt ge upphov till laboratorieinfektioner. Förekommer allmänt i jord och vatten i Sydostasien men infek¬tioner-melioidos- är ovanliga hos turister.
 
−
QU66010 Campylobacter jejuni/coli-gruppen är en grupp av gram¬negativa (böjda) stavar som ingår i tarmfloran hos nötboskap, hönsfåglar och husdjur. Människor kan smittas genom ofull¬ständigt uppvärmda kycklingar och mejeri¬produkter, men i de flesta fall är smittkällan okänd. Sjukdomssymtomen är diarré, magsmärtor, feber och ibland kräkningar.
 
−
ATCC35979 Capnocytophaga canimorsus (f.d. DF-2) är en gramnegativ stav i fr.a. hundens normala munflora. Bakterien kan efter hundbett or¬saka sårinfektion, sepsis, meningit och i enstaka fall endokardit.
 
−
ATCC27872 Capnocytophaga ochracea förekommer i munhålan hos människa och har förknippats med periodontit.
 
−
ATCC15826 Cardiobacterium hominis är en gramnegativ stav i luftvägar¬nas normalflora. Enda beskrivna sjukdomstillstånd är endo¬kardit (med eller utan skada på hjärtklaffar).
 
−
MSHD002689 Chlamydia species är små obligat intracellulära, gramnega¬tiva stavar.
 
−
ATCCVR2282 Chlamydophila pneumoniae, f.d. TWAR, förekommer över hela världen. Bakterien kan ge upphov till faryngit, sinuit, bronkit och pneumoni.
 
−
ATCCVR571 Chlamydia trachomatis är en, i Sverige, vanlig orsak till sexu¬ellt överförbar genital infektion, uretrit, salpingit m.m. Vissa serotyper kan ge trakom repektive lymfogranuloma venereum. Närbesläktade
 
−
ATCCVR125 Chlamydia psittaci orsakar ornitos. Klassas som BSL 3 pato¬gen.
 
−
ATCC13253 Chryseobacterium meningosepticum (f.d. Flavobac¬terium meningosepticum) är en gramnegativ stav som förekommer nor¬malt i jord och vatten men ej ingår i människans normal¬flora. I sällsynta fall ger den septikemi och meningit hos nyfödda. Bakterien är mycket antibiotikaresistent.
 
−
MSHD002954 Citrobacter som tillhör familjen Enterobacteriaceae, är rela¬tivt ovanliga gramnegativa stavar i tarmfloran. Flera olika species finns t.ex.
 
−
ATCC25405 C. amalonaticus,
 
−
ATCC08090 C. freundii,
 
−
ATCC27028 C. koseri (f.d. C. diversus). De kan orsaka nosokomial urinvägs¬infektion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi.
 
−
MSHD003013 Clostridium species är anaeroba grampositiva sporbildande stavar som förekommer i vår omgivning och i tarmens nor¬mal¬flora.
 
−
ATCC638 Clostridium bifermentans
 
−
ATCC25763 Clostridium botulinum orsakar botulism. Tre kliniska huvud¬grupper kan urskiljas- klassisk botulism som matförgiftning, spädbarns¬botulism efter kolonisering av tarmen och sårbotulism som följd av toxinbildning i sår infekterade med sporer.
 
−
ATCC09689 Clostridium difficile kan förekomma i normalfloran fr.a. hos barn men kan genom sina enterotoxiner ge svårbehandlad ofta anti¬biotikaassocierad diarré om den får dominera i tarmfloran. Den svåraste formen är pseudomembranös enterokolit.
 
−
ATCC19400 Clostridium fallax,
 
−
ATCC19401 Clostridium histolyticum och
 
−
ATCC17861 Clostridium novyi kan ge klassisk gasbrand.
 
−
ATCC13124 Clostridium perfringens förekommer i vår omgivning och tarmens normalflora. Den orsakar klassisk gasbrand men ses vanligare i postoperativa bukinfektioner, sårinfektioner och vid kolecystit. Enterotoxinbildande stammar kan ge matför¬gift¬ning.
 
 
   
 
   
 +
*ATCC49260---- '''''Bilophila wadsworthia''''' är en anaerob gramnegativ stav som främst associerats med appendicit.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD001884---- '''''Bordetella''''' är små gramnegativa stavar.
 +
**ATCC19395---- ''Bordetella bronchiseptica'' tillhör luftvägsfloran hos människa och djur. I undantagsfall kan den hos människa orsaka pneumonit och sårinfektion.
 +
**ATCC15311---- ''[[Bordetella parapertussis]]'' orsakar en kikhosteliknande sjukdomsbild.
 +
**ATCC09797---- ''[[Bordetella pertussis]]'' ger upphov till kikhosta. Symtomen beror bl.a. på bakteriens toxinbildning.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD001898 '''''Borrelia'' species'''. ''Borrelia'' tillhör spiroketerna. Ett antal arter finns, t.ex.
 +
**ATCC35210---- ''[[Borrelia burgdorferi]]'',
 +
**ATCC51383---- ''[[Borrelia garinii]]'' och
 +
**ATCC51567---- ''[[Borrelia afzelii]]'' är av störst intresse vid borrelios. Sjukdomen kan ha många olika symtom bl.a. erytema migrans, led- och muskelsymtom, trötthet, encefalit och myokardit. Med fästingar sprids spiroketerna från djur till människa.
 +
**QU66137---- ''[[Borrelia recurrentis]]'' orsakar återfallsfeber, en sjukdom som uteslutande sprids med vägglöss. Liknande sjukdomstillstånd kan orsakas av många andra arter av ''Borrelia''.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD001951---- '''''Brevibacterium'' species''' finns i mejeriprodukter men tillhör även den normala hudfloran. En distinkt ostlukt kännetecknar många isolat. Den orsakar sällan infektion hos människa men infektioner i samband med främmande kropp, dialysvätska, osteomyelit och meningit finns beskrivna.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD002002---- '''''[[Brucella|Brucella'' species]]''' är gramnegativa stavar som klassas som BSL 3 patogener p.g.a. av sin stora förmåga att orsaka laboratorieinfektioner. Alla tillhör samma art men kan indelas i olika subspecies med vissa skillnader i värdspecificitet.
 +
**ATCC23448----''B. abortus'' har främst nötboskap som värd,
 +
**ATCC23456---- ''B. melitensis'' har get, samt
 +
**ATCC23444---- ''B. suis'' svin som värdar. Dessa samt vissa andra typer kan smitta människa via opasteuriserade mejeriprodukter. Septikemi, ofta med svängande feber och sekundär osteomyelit, kan ses hos denna sällsynta importsjukdom.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD019117---- '''''Burkholderia'' species''' (f.d. ''Pseudomonas'') är aeroba gramnegativa stavar.
 +
**ATCC25416---- ''[[Burkholderia cepacia]]'' trivs i fuktiga miljöer. Den ger lågvirulenta, opportunistiska infektioner, fr.a. hos patienter med nedsatt immunförsvar eller cystisk fibros (empyem, pneumoni, UVI, sårinfektion).
 +
**ATCC23344---- ''[[Burkholderia mallei]]'' är en BSL 3 patogen som huvudsakligen drabbar häst (glanders) med förmåga att också ge allvarlig sjukdom hos människa. Smittar främst vid laboratoriearbete men kan i enstaka fall överföras direkt från häst till människa.
 +
**ATCC23343---- ''[[Burkholderia  pseudomallei]]'' är även den en BSL 3 patogen p.g.a. sin förmåga att lätt ge upphov till laboratorieinfektioner. Förekommer allmänt i jord och vatten i Sydostasien men infektioner-melioidos- är ovanliga hos turister.
 +
 +
----
 +
 +
*QU66010---- '''''[[Campylobacter]] jejuni/coli'''''-gruppen är en grupp av gramnegativa (böjda) stavar som ingår i tarmfloran hos nötboskap, hönsfåglar och husdjur. Människor kan smittas genom ofullständigt uppvärmda kycklingar och mejeriprodukter, men i de flesta fall är smittkällan okänd. Sjukdomssymtomen är diarré, magsmärtor, feber och ibland kräkningar.
 +
 +
*----''Campylobacter ureolyticus'' (tidigare ''Bacteroides ureolyticus''), är en  anaerob gramnegativ stav med oklar taxonomisk tillhörighet, som 2010  reklassificierades till genus ''Campylobacter''. Isoleras från genitala  infektioner, orala infektioner och sår.
 +
 +
----
 +
 +
*ATCC35979---- '''''Capnocytophaga canimorsus''''' (f.d. DF-2) är en gramnegativ stav i fr.a. hundens normala munflora. Bakterien kan efter hundbett orsaka sårinfektion, sepsis, meningit och i enstaka fall endokardit.
 +
*ATCC27872---- '''''Capnocytophaga ochracea''''' förekommer i munhålan hos människa och har förknippats med periodontit.
 +
 +
----
 +
 +
*ATCC15826---- '''''Cardiobacterium hominis''''' är en gramnegativ stav i luftvägarnas normalflora. Enda beskrivna sjukdomstillstånd är endokardit (med eller utan skada på hjärtklaffar).
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD002689---- '''''Chlamydia'' species''' är små obligat intracellulära, gramnegativa stavar.
 +
**ATCCVR2282---- ''[[Chlamydophila pneumoniae]]'', f.d. TWAR, förekommer över hela världen. Bakterien kan ge upphov till faryngit, sinuit, bronkit och pneumoni.
 +
**ATCCVR571---- ''[[Chlamydia trachomatis]]'' är en, i Sverige, vanlig orsak till sexuellt överförbar genital infektion, uretrit, salpingit m.m. Vissa serotyper kan ge trakom repektive lymfogranuloma venereum. Närbesläktade
 +
**ATCCVR125---- ''Chlamydia (Chlamydophila) psittaci'' orsakar ornitos. Klassas som BSL 3 patogen.
 +
 +
----
 +
 +
*ATCC13253---- '''''Chryseobacterium meningosepticum''''' (f.d. ''Flavobacterium meningosepticum'') är en gramnegativ stav som förekommer normalt i jord och vatten men ej ingår i människans normalflora. I sällsynta fall ger den septikemi och meningit hos nyfödda. Bakterien är mycket antibiotikaresistent.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD002954--- '''''Citrobacter''''' som tillhör familjen ''Enterobacteriaceae'', är relativt ovanliga gramnegativa stavar i tarmfloran. Flera olika species finns t.ex.
 +
**ATCC25405---- ''C. amalonaticus'',
 +
**ATCC08090---- ''C. freundii'',
 +
**ATCC27028---- ''C. koseri'' (f.d. ''C. diversus''). De kan orsaka nosokomial urinvägsinfektion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD003013---- '''''Clostridium'' species''' är anaeroba grampositiva sporbildande stavar som förekommer i vår omgivning och i tarmens normalflora.
 +
**ATCC638---- ''Clostridium bifermentans''
 +
**ATCC25763---- ''[[Clostridium botulinum]]'' orsakar botulism. Tre kliniska huvudgrupper kan urskiljas- klassisk botulism som matförgiftning, spädbarnsbotulism efter kolonisering av tarmen och sårbotulism som följd av toxinbildning i sår infekterade med sporer.
 +
**ATCC09689---- ''[[Clostridium difficile]]'' kan förekomma i normalfloran fr.a. hos barn men kan genom sina enterotoxiner ge svårbehandlad ofta antibiotikaassocierad diarré om den får dominera i tarmfloran. Den svåraste formen är pseudomembranös enterokolit.
 +
**ATCC19400---- ''Clostridium fallax'',
 +
**ATCC19401---- ''Clostridium histolyticum'' och
 +
**ATCC17861---- ''Clostridium novyi'' kan ge klassisk gasbrand.
 +
**ATCC13124---- ''[[Clostridium perfringens]]'' förekommer i vår omgivning och tarmens normalflora. Den orsakar klassisk gasbrand men ses vanligare i postoperativa bukinfektioner, sårinfektioner och vid kolecystit. Enterotoxinbildande stammar kan ge matförgiftning.
 +
**ATCC12464---- ''Clostridium septicum'' förekommer i tarmens normalflora. Den kan ge septikemi och nekrotiserande enterokolit hos patienter med malignitet i buken (lymfom, leukemi, karcinom), diabetes eller grav hjärtsjukdom.
 +
**MSHD003017---- ''[[Clostridium tetani]]'' finns i jord och tarmens normalflora. Bakterien bildar tetanustoxin som ger upphov till stelkramp. Sjukdomen är mycket ovanlig eftersom de flesta personer är vaccinerade.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD003352---- '''''Corynebacterium'' species''' är grampositiva stavar som förekommer i hudens normalflora. De brukar grupperas som difteroida ("koryneforma") stavar tillsammans med liknande bakterier. Artidentifikation är vanligen svår och sällan kliniskt motiverad. De ses ofta som kontamination. Det är nödvändigt med upprepade fynd för att säkerställa relevans. Vissa arter har dock stor klinisk betydelse.
 +
**ATCC14665---- ''Corynebacterium aquaticum'' räknas som en vattenorganism. Ett fåtal fall med humana infektioner finns beskrivna och inkluderar bakteriemi, endokardit, meningit, CAPD-peritonit och cellulit efter skada med högtryckstvätt.
 +
**ATCC27010---- ''[[Corynebacterium diphtheriae]]'' ger difteri. Huvudsakligen importfall. Vanligen ses svår tonsillit, men även sårinfektioner förekommer. Hos ovaccinerade personer kan toxinproducerande stammar ge skador på hjärta och nervsystem.
 +
**ATCC43734---- ''Corynebacterium jeikeium'' (f.d. ''C.'' JK) ses oftast vid infektioner hos sjukhusvårdade patienter som under lång tid behandlats med bredspektrumantibiotika. Bakterien är ofta antibiotikaresistent. Den kan ge sårinfektion, septikemi och "främmande kroppsinfektioner".
 +
**ATCC43042---- ''[[Corynebacterium urealyticum]]'' (f.d. ''C.'' D2). Vid urinvägsinfektion med denna bakterie ses ibland ärtsoppsliknande illaluktande urin. Stenbildning är vanlig p.g.a. bakteriens ureasproduktion. Även sårinfektion, peritonit, och septikemi förekommer. Bakterien är ofta antibiotikaresistent.
 +
 +
----
  
−
ATCC12464 Clostridium septicum förekommer i tarmens normalflora. Den kan ge septikemi och nekrotiserande enterokolit hos patienter med malignitet i buken (lymfom, leukemi, karci¬nom), diabetes eller grav hjärtsjukdom.
+
*MSHD003381---- '''''[[Coxiella]]''''' ingår tillsammans med genera ''Rickettsia'' och ''Ehrlichia'' i ordningen ''Rickettsiales''.
−
MSHD003017 Clostridium tetani finns i jord och tarmens normalflora. Bakt¬erien bildar tetanustoxin som ger upphov till stelkramp. Sjuk¬domen är mycket ovanlig eftersom de flesta personer är vac¬cinerade.
 
−
MSHD003352 Corynebacterium species är grampositiva stavar som före¬kommer i hudens normalflora. De brukar grupperas som difte¬roida ("koryneforma") stavar tillsammans med liknande bakte¬rier. Artidentifikation är vanligen svår och sällan kliniskt moti¬verad. De ses ofta som kontamination. Det är nödvändigt med upprepade fynd för att säkerställa relevans. Vissa arter har dock stor klinisk betydelse.
 
−
ATCC14665 Corynebacterium aquaticum räknas som en vattenorganism. Ett fåtal fall med humana infektioner finns beskrivna och inkluderar bakteriemi, endokardit, meningit, CAPD-peritonit och cellulit efter skada med högtryckstvätt.
 
−
ATCC27010 Corynebacterium diphtheriae ger difteri. Huvudsakligen im¬portfall. Vanligen ses svår tonsillit, men även sårinfektioner före¬kommer. Hos ovaccinerade personer kan toxinproducerande stammar ge skador på hjärta och nervsystem.
 
−
ATCC43734 Corynebacterium jeikeium (f.d. C. JK) ses oftast vid infek¬tioner hos sjukhusvårdade patienter som under lång tid be¬handlats med bredspektrumantibiotika. Bakterien är ofta anti¬biotikaresistent. Den kan ge sårinfektion, septikemi och "främmande kropps¬infektioner".
 
−
ATCC43042 Corynebacterium urealyticum (f.d. C. D2). Vid urinvägsinfek¬tion med denna bakterie ses ibland ärtsoppsliknande illaluktande urin. Stenbildning är vanlig p.g.a. bakteriens ureasproduktion. Även sårinfektion, peritonit, och septikemi förekommer. Bakterien är ofta antibiotikaresistent.
 
−
MSHD003381 Coxiella ingår tillsammans med genera Rickettsia och Ehrlichia i ordningen Rickettsiales.
 
 
   
 
   
  
−
MSHD016997 Coxiella burnetii orsakar akut och kronisk Q-feber. Förknip¬pas med atypisk pneumoni kan också ligga bakom odlingsne¬gativ endo¬kardit.
+
**MSHD016997---- ''Coxiella burnetii'' orsakar akut och kronisk Q-feber. Förknippas med atypisk pneumoni kan också ligga bakom odlingsnegativ endokardit.
−
QU60517 Difteroida stavar är en gruppbeteckning för oftast föga pato¬gena grampositiva stavar vilka förekommer i den ordinära hud¬floran.
+
 
−
ATCC23834 Eikenella corrodens är en gramnegativ stav i normalfloran i munhåla, tarm och urogenitalia. Den anses kunna orsaka mun¬håle¬abscesser, empyem, artrit, bakteriemi och meningit.  
+
----
−
MSHD020594 Edwardsiella species är gramnegativa stavar som förekom¬mer i tarmens normalflora.
+
 
−
ATCC15947 Edwardsiella tarda är ett inte ovanligt fynd vid extraintestinala infektioner. Misstänks även kunna orsaka enterit.
+
*QU60517---- '''Difteroida stavar''' är en gruppbeteckning för oftast föga patogena grampositiva stavar vilka förekommer i den ordinära hudfloran.
−
UMLSCUIC
+
 
−
1010492 Enterobacter species är gramnegativa stavar tillhörande
+
----
−
MSHD004755 Enterobacteriaceae och förekommer i tarmens normal¬flora.
 
−
ATCC13048 Enterobacter aerogenes kan ge upphov till opportunistiska infektioner i urinvägar, bensår m.m. Hos immundefekta pati¬enter kan den ge septikemi.
 
−
QU66285 Enterobacter agglomerans – se Pantoea agglomerans.
 
−
ATCC13047 Enterobacter cloacae kan orsaka nosokomial urinvägsinfek¬tion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi.
 
−
MSHD016983 Enterokocker är grampositiva kocker som förekommer i tar¬mens normalflora. Vankomycinresistenta E. faecalis och E. faecium (VRE) har varit ovanliga i Sverige.
 
−
ATCC25788 Enterococcus casseliflavus är ovanligt fynd vid infektioner hos människa. Den innehåller van C  och kan därför förväxlas med VRE.
 
−
ATCC19433 Enterococcus faecalis är den kliniskt vanligaste enterokocken. Den isoleras främst från urinvägar och sår, men kan ge septikemi och endokardit.
 
 
   
 
   
 +
*ATCC23834---- '''''Eikenella corrodens''''' är en gramnegativ stav i normalfloran i munhåla, tarm och urogenitalia. Den anses kunna orsaka munhåleabscesser, empyem, artrit, bakteriemi och meningit.
  
−
ATCC19434 Enterococcus faecium utgör en mindre men ökande del av alla enterokockisolat. Den isoleras främst från urinvägar och sår men kan ge septikemi och endokardit. Den är ofta mycket re¬sistent mot antibiotika men i Sverige med enstaka undantag känslig för vankomycin. Den kan ha betydelse som nosoko¬mial smitta.
+
----
−
ATCC35038 Enterococcus gallinarium -se Enterococcus casseliflavus.
 
−
ATCC19414 Erysipelothrix rhusiopathiae är en grampositiv stav som främst är djurpatogen. Den kan hos människa (särskilt slaktare, veteri¬närer och fiskare) ge erysipeloid (hudinfektion). Artrit, lymfangit och endokardit finns även beskrivet.
 
−
ATCC11775 Escherichia coli är en gramnegativ stav tillhörande Entero¬bacteriaceae i tarmens normalflora. Den är vanligt förekom¬mande i naturen och bland djur. Vanligaste orsaken till urin¬vägsinfektioner. Kan även förkomma vid septikemi, neonatal meningit, sårinfektion, abscesser, endokardit, pneumoni och gastroenteriter med varierande virulensmekanismer (EHEC, EIEC, EPEC, ETEC).
 
−
MSHD005051 Eubacterium species är grampositiva anaeroba stavar i mun¬hålans och tarmens normalflora. Sällsynt orsak till sår¬infek¬tioner och abscesser och då vanligen som del i en bland¬flora. Har beskrivits orsaka periodontala infektioner.
 
−
MSHD005417 Flavobacterium species är ett samlingsnamn på ett stort antal närbesläktade arter som förekommer i jord och vatten. Bakterierna är lågvirulenta. Den kliniskt mest kända
 
−
ATCC13253 F. meningosepticum är numera omdöpt till Chrysobacte¬rium meningosepticum.
 
−
ATCC06223 Francisella tularensis är en gramnegativ stavbakterie, som förekommer bland gnagare, insekter och i kontaminerat vat¬ten. Stor variation i förekomst mellan åren. Även människan smittas av denna zoonos. Förekommer främst i Gästrikland, Hälsing¬land och Dalarna men har på senare tid diagnostiserats längre söderut. Kan lokalt ge sår, lymfkörtelsvullnad, feber, pneumoni. Vanligtvis serologisk diagnostik då risk för labo¬ratoriesmitta finns vid odling. Klassas som BSL 3 patogen.
 
 
   
 
   
 +
*MSHD020594---- '''''Edwardsiella'' species''' är gramnegativa stavar som förekommer i tarmens normalflora.
 +
**ATCC15947---- ''Edwardsiella tarda'' är ett inte ovanligt fynd vid extraintestinala infektioner. Misstänks även kunna orsaka enterit.
 +
 +
----
 +
 +
*UMLSCUIC 1010492---- '''''Enterobacter'' species''' är gramnegativa stavar tillhörande
 +
*MSHD004755---- '''''Enterobacteriaceae''''' och förekommer i tarmens normalflora.
 +
**ATCC13048---- ''Enterobacter aerogenes'' kan ge upphov till opportunistiska infektioner i urinvägar, bensår m.m. Hos immundefekta patienter kan den ge septikemi.
 +
**QU66285---- ''Enterobacter agglomerans'' – se ''Pantoea agglomerans''.
 +
**ATCC13047---- ''Enterobacter cloacae'' kan orsaka nosokomial urinvägsinfektion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi.
 +
 +
----
 +
 +
*MSHD016983---- '''[[Enterokocker]]''' är grampositiva kocker som förekommer i tarmens normalflora. Vankomycinresistenta ''E. faecalis'' och ''E. faecium'' (VRE) har fram till 2007 varit ovanliga i Sverige.
 +
**ATCC25788---- ''[[Enterococcus casseliflavus]]'' är ovanligt fynd vid infektioner hos människa. Den innehåller ''van'' C  och kan därför förväxlas med VRE.
 +
**ATCC19433---- ''[[Enterococcus faecalis]]'' är den kliniskt vanligaste enterokocken. Den isoleras främst från urinvägar och sår, men kan ge septikemi och endokardit.
 +
**ATCC19434---- ''[[Enterococcus faecium]]'' utgör en mindre men ökande del av alla enterokockisolat. Den isoleras främst från urinvägar och sår men kan ge septikemi och endokardit. Den är ofta mycket resistent mot antibiotika men i Sverige med enstaka undantag känslig för vankomycin. Den kan ha betydelse som nosokomial smitta.
 +
**ATCC35038---- ''[[Enterococcus gallinarum]]'' -se ''Enterococcus casseliflavus''.
 +
 +
----
 +
 +
*ATCC19414---- '''''Erysipelothrix rhusiopathiae''''' är en grampositiv stav som främst är djurpatogen. Den kan hos människa (särskilt slaktare, veterinärer och fiskare) ge erysipeloid (hudinfektion). Artrit, lymfangit och endokardit finns även beskrivet.
 +
 +
----
 +
 +
*ATCC11775---- '''''[[Escherichia coli]]''''' är en gramnegativ stav tillhörande ''Enterobacteriaceae'' i tarmens normalflora. Den är vanligt förekommande i naturen och bland djur. Vanligaste orsaken till urinvägsinfektioner. Kan även förkomma vid septikemi, neonatal meningit, sårinfektion, abscesser, endokardit, pneumoni och gastroenteriter med varierande virulensmekanismer (EHEC, EIEC, EPEC, ETEC).
 +
 +
----
  
−
MSHD005673 Fusobacterium species är gramnegativa anaeroba stavar som förekommer i munhålans, tarmens och genitalias normalflora.
+
*MSHD005051---- '''''Eubacterium'' species''' är grampositiva anaeroba stavar i munhålans och tarmens normalflora. Sällsynt orsak till sårinfektioner och abscesser och då vanligen som del i en blandflora. Har beskrivits orsaka periodontala infektioner.
−
ATCC25286 Fusobacterium necrophorum kan ge svåra septiska adeniter och s.k. nekrobacillos eller Lemière´s syndrom. Vanligen före¬kommer den dock som del i blandflora (Vincent angina, peri¬tonsillära abscesser, bukinfektioner m.m.).
+
 
−
ATCC25586 Fusobacterium nucleatum kan ge akut nekrotiserande gingi¬vit och peritonsillära abscesser och bukabscesser i blandin¬fektion.
+
----
−
ATCC 12344 Grupp A streptokocker (GAS), är vid sidan av Strepto¬coccus pyogenes (S. pyogenes) referensbeteckning för beta¬hemo¬lyserande streptokocker grupp A. S. pyogenes är den bakterie som orsakar scharla¬kansfe¬ber, halsfluss, impetigo, erysipelas, sår¬infektioner, fasciiter och septikemi liksom sekundär glomerulonefrit och reuma¬tisk feber.
+
 
−
ATCC13813 Grupp B streptokocker (GBS) är vid sidan av Streptococcus agalactiae referensbeteckning för streptokocker tillhörande grupp B. Den tillhör den normala tarmfloran och uretra/vaginalfloran hos kvinnor. I anslutning till förlossning kan barnet infekteras och få septikemi/meningit. För urinvägarna har den klassificerats som tveksamt patogen (I 5:2).
+
*MSHD005417---- '''''Flavobacterium'' species''' är ett samlingsnamn på ett stort antal närbesläktade arter som förekommer i jord och vatten. Bakterierna är lågvirulenta. Den kliniskt mest kända
−
UMLSCUIC
+
**ATCC13253---- ''F. meningosepticum'' är numera omdöpt till'' Chrysobacterium meningosepticum''.
−
0318158 Grupp C streptokocker, GCS, är referensbeteckning för beta¬hemolyserande streptokocker Grupp C (S. dysgalactiae subsp. equisimilis). De kan liksom S. pyogenes ge faryngotonsillit, hud- och sårinfektion, septikemi m.m. liksom sekundär glomerulonefrit och reumatisk feber.
+
 
−
UMLSCUIC
+
----
−
0318159 Grupp D streptokocker, GDS. Streptokock grupp D-anti¬gen associeras vanligen till enterokocker men förekommer också hos Streptococcus bovis och hos några arter av Pedio¬coccus.
+
 
−
UMLSCUIC
+
*ATCC06223---- '''''[[Francisella tularensis]]''''' är en gramnegativ stavbakterie, som förekommer bland gnagare, insekter och i kontaminerat vatten. Stor variation i förekomst mellan åren. Även människan smittas av denna zoonos. Förekommer främst i Gästrikland, Hälsingland och Dalarna men har på senare tid diagnostiserats längre söderut. Kan lokalt ge sår, lymfkörtelsvullnad, feber, pneumoni. Vanligtvis serologisk diagnostik då risk för laboratoriesmitta finns vid odling. Klassas som BSL 3 patogen.
−
0318162 Grupp G streptokocker, GGS, är referensbeteckning för beta¬hemolyserande streptokocker Grupp G (S. dysgalactiae subsp. equisimilis). De kan liksom S. pyo¬genes ge faryngotonsillit, hud- och sårinfektion, septikemi m.m. liksom sekundär glomerulonefrit och reumatisk feber.
+
 
 +
----
 
   
 
   
  
−
ATCC14018 Gardnerella vaginalis är en gramlabil stav i den normala vaginalfloran. Den har associerats med bakteriell vaginos och isoleras ibland postpartum i blod och i material från endome¬trium. Den kan orsaka infektion efter abort.
+
*MSHD005673---- '''''Fusobacterium'' species''' är gramnegativa anaeroba stavar som förekommer i munhålans, tarmens och genitalias normalflora.
−
ATCC27824 Gemella morbillorum karakteriserades tidigare som Strepto¬coccus morbillorum. Det är en grampositiv kock som isoleras från övre luftvägarna och i enstaka fall orsakat endokardit.
+
**ATCC25286---- ''Fusobacterium necrophorum'' kan ge svåra septiska adeniter och s.k. nekrobacillos eller Lemière´s syndrom. Vanligen förekommer den dock som del i blandflora (Vincent angina, peritonsillära abscesser, bukinfektioner m.m.).
−
Gonokocker är en accepterad beteckning för Neisseria go¬norrhoeae.
+
**ATCC25586---- ''Fusobacterium nucleatum'' kan ge akut nekrotiserande gingivit och peritonsillära abscesser och bukabscesser i blandinfektion.
−
ATCC49175 Granulicatella adiacens (f.d. Abiotrophia adiacens) är gram¬positiva kocker som tillhör alfastreptokockerna. De ingår i den normala svalgfloran. Omfattar s.k. B6-beroende strepto¬kocker. Kan i sällsynta fall ge endokardit.
+
 
−
MSHD006190 Haemophilus species är gramnegativa stavar. Namnet an¬spelar på att odlingssubstraten måste berikas med blod eller nöd¬vändiga tillväxtfaktorer för att bakterien skall växa.
+
----
−
ATCC 19415 Haemophilus aphrophilus förekommer i svalgfloran hos hun¬dar. Kan orsaka endokardit hos människa.
+
 
−
ATCC33940 Haemophilus ducreyi orsakar mjuk chanker, en sexuellt över¬förd sjukdom som ger ytliga genitala sår och lymfkörtel¬enga¬gemang i ljumskarna. Förekommer huvudsakligen i tro¬piska länder, sällsynt i Sverige.
+
*ATCC 12344---- '''[[Grupp A streptokocker]] (GAS),''' är vid sidan av '' [[Streptococcus pyogenes]] '' (''S. pyogenes'') referensbeteckning för betahemolyserande streptokocker grupp A. ''S. pyogenes'' är den bakterie som orsakar scharlakansfeber, halsfluss, impetigo, erysipelas, sårinfektioner, fasciiter och septikemi liksom sekundär glomerulonefrit och reumatisk feber.
−
ATCC33391 Haemophilus influenzae förekommer i luftvägarnas normal¬flora framför allt hos barn men kan orsaka luftvägsinfektioner såsom otit, sinuit, epiglottit, bronkit, empyem. Den kan även ge upphov till konjunktivit, septikemi, meningit, osteomyelit, en¬dokardit, perikardit. Vid invasiv sjukdom har serologisk subtyp b varit vanligast. Efter introduktion av vaccination är sådana infektioner numera sällsynt förekommande.
+
 
−
ATCC33392 Haemophilus parainfluenzae förekommer även den i luft¬vägarnas normalflora. Den orsakar sällan luftvägsinfektion men kan ge upphov till septikemi, endokardit, pankreasabscess, postoperativ buk¬infektion och i sällsynta fall meningit.
+
----
 +
 
 +
*ATCC13813---- '''[[Grupp B streptokocker (GBS)]]''' är vid sidan av ''Streptococcus agalactiae'' referensbeteckning för streptokocker tillhörande grupp B. Den tillhör den normala tarmfloran och uretra/vaginalfloran hos kvinnor. I anslutning till förlossning kan barnet infekteras och få septikemi/meningit. För urinvägarna har den klassificerats som tveksamt patogen (I 5:2).
 +
 
 +
----
 +
 
 +
*UMLSCUIC 0318158---- '''[[Grupp C streptokocker]], GCS''', är referensbeteckning för betahemolyserande streptokocker Grupp C (''S. dysgalactiae'' subsp. ''equisimilis'' och subsp. ''dysgalactiae'', den senare ej humanpatogen). De kan liksom ''S. pyogenes'' ge faryngotonsillit, hud- och sårinfektion, septikemi m.m. liksom sekundär glomerulonefrit och reumatisk feber.
 +
 
 +
----
 +
 
 +
*UMLSCUIC 0318159---- '''Grupp D streptokocker, GDS'''. Streptokock grupp D-antigen associeras vanligen till enterokocker men förekommer också hos ''Streptococcus bovis'' och hos några arter av ''Pediococcus''.
 +
 
 +
----
 +
 
 +
*UMLSCUIC 0318162---- '''[[Grupp G streptokocker]], GGS''', är referensbeteckning för betahemolyserande streptokocker Grupp G (''S. dysgalactiae'' subsp. ''equisimilis''). De kan liksom ''S. pyogenes'' ge faryngotonsillit, hud- och sårinfektion, septikemi m.m. liksom sekundär glomerulonefrit och reumatisk feber.
 +
 
 +
----
 
   
 
   
  
−
ATCC29241 Haemophilus paraphrophilus  kan förekomma i luftvägarna och orsakar endokardit, osteomyelit, hjärnabscess. Har också isolerats från urin från barn med missbildningar i urinvägarna.
+
*ATCC14018---- '''''[[Gardnerella vaginalis]]''''' är en gramlabil stav i den normala vaginalfloran. Den har associerats med bakteriell vaginos och isoleras ibland postpartum i blod och i material från endometrium. Den kan orsaka infektion efter abort.
−
ATCC13337 Hafnia alvei är en i tarmfloran förekommande gramnegativ stav tillhörande Enterobacteriaceae. Den liknar Enterobacter och är en sällsynt orsak till urinvägsinfektion och sårinfektion.
+
 
−
ATCC43504 Helicobacter pylori (f.d. Campylobacter pylori) är en gram¬negativ liten stav som kan påvisas i slemhinnan i mag¬säcken. Den blir vanligare med ökad levnadsålder. Bakterien orsakar genom kraftig ureasaktivitet och slemhinneinvasivitet gastrit samt sår i ventrikel och duodenum. Den är också starkt associerad till magcancer.
+
----
−
ATCC23330 Kingella kingae är en gramnegativ stav som förekommer nor¬malt i de övre luftvägarna och urogenitalia. Den är en ovan¬lig orsak till invasiv infektion (septikemi, septisk artrit, diskit och endokardit).
+
 
−
MSHD007709 Klebsiella species är gramnegativa stavar tillhörande Entero¬bacteriaceae förekommande i tarmfloran.
+
*ATCC27824---- '''''Gemella morbillorum''''' karakteriserades tidigare som ''Streptococcus morbillorum''. Det är en grampositiv kock som isoleras från övre luftvägarna och i enstaka fall orsakat endokardit.
−
ATCC31898 Klebsiella ornithinolytica är ovanlig i kliniska isolat. Dekar¬boxylerar aminosyran ornitin till skillnad från andra arter inom Klebsiella.  
+
 
−
ATCC13182 Klebsiella oxytoca utgör ca 10 % av alla Klebsiella och ger samma sjukdomspanorama som K. pneumoniae.
+
----
−
ATCC13883 Klebsiella pneumoniae kan orsaka  nosokomial urinvägs¬infek¬tion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi, bukinfek¬tioner m.m.
+
 
−
ATCC11296 Klebsiella pneumoniae subspecies ozaenae kan ge upphov till "stinknäsa" (kolonisation av nässlemhinnan), samt i un¬dantags¬fall andra luftvägsinfektioner och urinvägsinfektion.
+
*'''Gonokocker''' är en accepterad beteckning för ''Neisseria gonorrhoeae''.
−
ATCC13884 Klebsiella rhinoscleromatis associeras med rhinosclerom, en i tropikerna förekommande slemhinneförhårdning i näsan. Ovan¬ligt fynd i Sverige.
+
 
 +
----
 +
 
 +
*ATCC49175---- '''''Granulicatella adiacens''''' (f.d. ''Abiotrophia adiacens'') är grampositiva kocker som tillhör alfastreptokockerna. De ingår i den normala svalgfloran. Omfattar s.k. B6-beroende streptokocker. Kan i sällsynta fall ge endokardit.
 +
 
 +
*MSHD006190---- '''''Haemophilus'' species''' är gramnegativa stavar. Namnet anspelar på att odlingssubstraten måste berikas med blod eller nödvändiga tillväxtfaktorer för att bakterien skall växa.
 +
**ATCC 19415---- ''Haemophilus aphrophilus'' förekommer i svalgfloran hos hundar. Kan orsaka endokardit hos människa.
 +
**ATCC33940---- ''[[Haemophilus ducreyi]]'' orsakar mjuk chanker, en sexuellt överförd sjukdom som ger ytliga genitala sår och lymfkörtelengagemang i ljumskarna. Förekommer huvudsakligen i tropiska länder, sällsynt i Sverige.
 +
**ATCC33391---- ''[[Haemophilus influenzae]]'' förekommer i luftvägarnas normalflora framför allt hos barn men kan orsaka luftvägsinfektioner såsom otit, sinuit, epiglottit, bronkit, empyem. Den kan även ge upphov till konjunktivit, septikemi, meningit, osteomyelit, endokardit, perikardit. Vid invasiv sjukdom har serologisk subtyp b varit vanligast. Efter introduktion av vaccination är sådana infektioner numera sällsynt förekommande.
 +
**ATCC33392---- ''Haemophilus parainfluenzae'' förekommer även den i luftvägarnas normalflora. Den orsakar sällan luftvägsinfektion men kan ge upphov till septikemi, endokardit, pankreasabscess, postoperativ bukinfektion och i sällsynta fall meningit.
 +
**ATCC29241---- ''Haemophilus paraphrophilus'' kan förekomma i luftvägarna och orsakar endokardit, osteomyelit, hjärnabscess. Har också isolerats från urin från barn med missbildningar i urinvägarna.
 +
 
 +
----
 +
 
 +
*ATCC13337---- '''''Hafnia alvei''''' är en i tarmfloran förekommande gramnegativ stav tillhörande ''Enterobacteriaceae''. Den liknar ''Enterobacter'' och är en sällsynt orsak till urinvägsinfektion och sårinfektion.
 +
 
 +
----
 +
 
 +
*ATCC43504---- '''''[[Helicobacter pylori]]''''' (f.d. ''Campylobacter pylori'') är en gramnegativ liten stav som kan påvisas i slemhinnan i magsäcken. Den blir vanligare med ökad levnadsålder. Bakterien orsakar genom kraftig ureasaktivitet och slemhinneinvasivitet gastrit samt sår i ventrikel och duodenum. Den är också starkt associerad till magcancer.
 +
 
 +
----
 +
 
 +
*ATCC23330---- '''''Kingella kingae''''' är en gramnegativ stav som förekommer normalt i de övre luftvägarna och urogenitalia. Den är en ovanlig orsak till invasiv infektion (septikemi, septisk artrit, diskit och endokardit).
 +
 
 +
----
 +
 
 +
*MSHD007709---- '''''Klebsiella'' species''' är gramnegativa stavar tillhörande ''Enterobacteriaceae'' förekommande i tarmfloran.
 +
**ATCC31898---- ''Klebsiella ornithinolytica'' är ovanlig i kliniska isolat. Dekarboxylerar aminosyran ornitin till skillnad från andra arter inom ''Klebsiella''.  
 +
**ATCC13182---- ''[[Klebsiella oxytoca]]'' utgör ca 10 % av alla ''Klebsiella'' och ger samma sjukdomspanorama som ''K. pneumoniae''.
 +
**ATCC13883---- ''[[Klebsiella pneumoniae]]'' kan orsaka  nosokomial urinvägsinfektion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi, bukinfektioner m.m.
 +
**ATCC11296---- ''Klebsiella pneumoniae'' subspecies ''ozaenae '' kan ge upphov till "stinknäsa" (kolonisation av nässlemhinnan), samt i undantagsfall andra luftvägsinfektioner och urinvägsinfektion.
 +
**ATCC13884---- ''Klebsiella rhinoscleromatis'' associeras med rhinosklerom, en i tropikerna förekommande slemhinneförhårdning i näsan. Ovanligt fynd i Sverige.
 
   
 
   
  
−
QU60527 Koagulasnegativa stafylokocker (KNS) är en gruppbe¬teck¬ning för stafylokocker och snarlika bakterier som inte produce¬rar enzymet koagulas, vilket skiljer dem från S. aureus. S. epidermidis är vanligaste species och finns i hudens normal¬flora. Sjukdomsframkallande förmågan är låg men infektioner utgående från främmande kroppar före¬kommer. Sjukhus¬stammar är ofta antibiotikaresistenta. Van¬lig konta¬minant.
+
----
−
MSHD007778 Lactobacillus species är grampositiva stavar tillhörande nor¬malfloran i munhåla, tarm och vagina. Deras sjukdoms¬fram-kallande förmåga är låg men de förekommer som konta¬mi¬nation i bakteriologiska prov. Enstaka fall av UVI och endo¬kardit har beskrivits.
+
 
−
MSHD017045 Lactococcus species är grampositiva kocker närbesläktade med streptokocker och enterokocker. Kan ibland vara konta¬mi¬nanter. Enstaka blododlingsfynd från patienter med konst¬gjorda hjärtklaffar finns rapporterat.
+
*QU60527---- '''Koagulasnegativa stafylokocker (KNS)''' är en gruppbeteckning för stafylokocker och snarlika bakterier som inte producerar enzymet koagulas, vilket skiljer dem från ''S. aureus''. ''S.'' ''epidermidis'' är vanligaste species och finns i hudens normalflora. Sjukdomsframkallande förmågan är låg men infektioner utgående från främmande kroppar förekommer. Sjukhusstammar är ofta antibiotikaresistenta. Vanlig kontaminant.
−
ATCC33152 Legionella pneumophila är en gramnegativ stav som normalt förekommer i sötvatten och jord. Via vatten (befuktning, vat¬ten¬beredare) kan den vid stora smittdoser ge upphov till svår¬artad lunginflammation. Individer med nedsatt immun¬försvar är speciellt känsliga. Andra legionellaarter kan ge liknande sjukdomsbild.
+
 
−
MSHD007919 Leptospira species är spiroketer med än så länge ofullstän¬digt kartlagd taxonomi. De ger upphov till lepto¬spiros, ett sam¬lingsnamn för akuta febersjukdomar hos djur och män¬niskor.
+
 
−
ATCC14201 Leptotrichia buccalis  är en anaerob gramnegativ stav, som normalt förekommer i munhålan men även gastrointestinalt. Har isolerats vid infektioner i huvud-halsområdet och i blododlingar från immundefekta patienter samt rapporterats ge asymptomatisk bakteriemi efter tandingrepp.
+
[[Kategori:Bakterier]]
−
MSHD007934 Leuconostoc species är grampositiva kocker som tillhör nor¬mal¬floran i magtarmkanalen och huden. Bakterien är låg¬viru¬lent. Enstaka fall av endokardit finns rapporterade liksom fynd från dialysat, likvor och sår.
+
[[Kategori:Infektioner i hud, mjukdelar, skelett och inre organ]]
−
ATCC15313 Listeria monocytogenes är en cefalosporinresistent grampo¬sitiv stavbakterie som förekommer i vår omgivning och ibland i vår tarmflora. Via livsmedel kan den ge septikemi och me¬ningit. Den kan tillväxa i kylskåpstemperatur. Speciellt utsatta är gravida kvinnor och deras foster/barn samt individer med nedsatt immunförsvar.
 
−
Meningokocker är en accepterad beteckning för Neisseria meningitidis.
 
−
MSHD008837 Micrococcus species är grampositiva kocker närmast släkt med koagulasnegativa stafylokocker och inbegrips i gruppbe¬teck¬ningen KNS. De finns i naturen och i huden hos männi¬skor och djur. Låg sjukdomsframkallande förmåga.
 
−
MSHD017904 Mobiluncus är gramnegativa, anaeroba, krökta stavar. De har associerats med bakteriell vaginos.
 
−
MSHD009016 Moraxella species är kockoida gramnegativa, aeroba bakte¬rier som ofta förekommer som normalflora i luftvägarna. I undan¬tagsfall ger de upphov till konjunktivit (M. lacunata), akut otit och laryngit (M. catarrhalis) men är endast i sällsynta fall inva¬siva.
 
−
ATCC25238 Moraxella catarrhalis  är en gramnegativ kock i luftvägarnas normalflora framför allt hos barn. Den anses orsaka ca 10 % av akuta otiter samt kunna orsaka trakeit och laryngit. Nästan alla stammar bildar betalaktamas.
 
−
MSHD020596 Morganella species är gramnegativa stavar tillhörande Ente¬robacteriaceae vilka förekommer i tarmfloran.
 
−
ATCC25830 Morganella morganii (f.d. Proteus morganii) kan orsaka nosokomial urinvägsinfektion, sårinfektion, bakteriemi och i enstaka fall meningit.
 
−
ATCC12600, QU71320 MRSA-meticillinresistenta Staphylococcus aureus som innehåller mecA-gen. De har fr.a. förknippats med allvarliga nosokomiala utbrott.
 
−
MSHD009161 Mycobacterium species är grampositiva, syrafasta och aeroba stavar.
 
−
QU66471 Mycobacterium avium-intracellulare är två olika arter av mykobakterier vilka är mycket svåra att särskilja på labo¬rato¬riet. De behandlas därför som en egen grupp. De före¬kommer normalt i jord, vatten och hos djur och har en låg sjukdomsframkallande förmåga. Hos individer med normalt immunförsvar kan de ge adeniter och lungtuberkulosliknande sjukdom men hos individer med AIDS ger de oftast generalis¬erad sjukdom.
 
−
ATCC29571 Mycobacterium malmoense kan ge kronisk lunginfektion som röntgenologiskt påminner om lungtuberkulos. Fall med cervi¬kal adenit finns beskrivna.
 
−
ATCC927 Mycobacterium marinum (även kallad M. balnei) förekom¬mer i såväl sött som salt vatten. Bakterien ger upphov till hudle¬sioner som till utseendet påminner om reumatoida no¬duli. Smitta kan överföras via swimming-pooler, akvarier, fiske och andra vattenaktiviteter.
 
−
ATCC27294 Mycobacterium tuberculosis (tuberkelbakterien, tbb) ger up¬phov till tuberkulos. Vanligast är lungtuberkulos men infek¬tionen kan slå ner i andra organ (meningit m.m.). Särskilt ut¬satta är individer med nedsatt immunförsvar (AIDS, under¬näring). Klassas som BSL 3 patogen.
 
−
MSHD009174 Mycoplasma species är små bakterier som saknar cellvägg.
 
−
QU66494 Mycoplasma genitalium är en av 14 mykoplasmor av humant ursprung och har associerats med akut icke gonorrhoeisk uretrit (NGU). Bakterien är långsamväxande och påvisas därför före¬trädesvis med PCR.
 
−
ATCC23114 Mycoplasma hominis isoleras från urogenitaltrakten hos både män och kvinnor. Vid förekomst i större mängd kan de even¬tuellt ge uretrit, prostatit, vaginos och endometrit.
 
−
ATCC15531 Mycoplasma pneumoniae är en vanlig orsak till atypisk pneu¬moni med feber, hosta och huvudvärk.
 
−
MSHD009343 Neisseria species är gramnegativa aeroba kocker som (med undantag av N. gonorrhoeae) tillhör luftvägarnas normalflora. När begreppet används har N. gonorrhoeae och N. meningitidis ute¬slutits. Övriga Neisseria spp har låg sjukdomsframkallande för¬måga och betraktas vanligen som normalflora. Dessa innefattar N. elongata, N. flavescens, N. sicca, N. subflava m.fl.
 
−
ATCC19424 Neisseria gonorrhoeae (gonokocker) orsakar gonorré. Van¬ligen sexuellt överförd smitta. Uretrit är vanligaste symtom. Andra symtom kan vara vaginal flytning, prostatit, artrit, septi¬kemi m.m. I samband med förlossning kan barnets ögon bli infekterade.
 
−
ATCC13077 Neisseria meningitidis (meningokocker) kan asymtomatiskt finnas i nasofarynx. Bakterien kan ge upphov till septikemi och meningit. I sällsynta fall har den isolerats från ledvätska, peri¬kardvätska, genitalia och rektum.
 
−
ATCC51223 N. weaveri är en gramnegativ stav tillhörande Neisseriaceae och kan hittas vid infektion efter hundbett.
 
−
MSHD009615 Nocardia species är grampositiva, "grenade" stavar som finns i jord och vatten. De kan ge opportunistiska infektioner (N. asteroides och N. brasiliensis), särskilt hos individer med nedsatt immunförsvar, vanligen utgående från luftvä¬garna.
 
−
QU60523 Nonfermentativa gramnegativa stavar är en grupp¬be¬teckning för i miljön förekommande aeroba bakterier främst tillhörande Pseudomonas-, Flavo- och Alcaligenes-släktena samt Steno¬trophomonas och Burkholderia. Deras sjuk¬doms¬framkallande förmåga är låg men de kan ge op¬portu¬nistiska infektioner.
 
−
ATCC 27155
 
−
Pantoea agglomerans (f.d. Enterobacter agglomerans) är en gramnegativ stav tillhörande Enterobacteriaceae som före¬kommer i tarmens normalflora. Den kan ge upphov till oppor¬tunistiska infektioner i urinvägar, bensår m.m. Hos immun¬defekta patienter kan den ge septikemi.
 
−
ATCC43137 Pasteurella multocida är en gramnegativ stav i munfloran hos hund och katt. Sårinfektion efter djurbett är vanligt. Septikemi, osteit och pneumoni ses som komplikation. Infektionerna är ofta svårläkta trots att bakterien in vitro är mycket antibiotika¬känslig.
 
−
MSHD010376 Pediococcus är fakultativt anaeroba grampositiva kocker som kan kolonisera grönsaker och andra matvaror och kan också förstöra bryggerijäst. De är föga patogena för växter och djur inklusive människa.
 
−
MSHD010460 Peptococcus utgörs av anaeroba grampositiva kocker till¬hörande normalfloran i munhålan, mag- tarmkanalen och kvinnliga genitalia. Peptokockerna omfattar numera endast species Peptococcus niger övriga har överförts till genus Peptostreptococcus.
 
−
MSHD010462 Peptostreptococcus species är anaeroba grampositiva kocker som tillhör människans normalflora. De isoleras i abscesser utgångna från mag- tarmkanal, genitalia, luftvägar samt i hjärn¬abscesser.
 
−
ATCC14029 Plesiomonas shigelloides är en gramnegativ stav som finns i vatten i subtropiska och tropiska områden. Den kan ge gast¬ro¬enterit. Endast i undantagsfall ger bakterien extraintestinala infektioner.
 
−
ATCC33400 Pneumokocker  är en accepterad beteckning för Strepto¬coccus pneumoniae.
 
−
MSHD017861 Porphyromonas species är gramnegativa anaeroba stavar i munfloran, urogenitalt samt i tarmen. Kan orsaka infektioner i nedre luftvägar samt i huvud, nacke och munhålan.
 
−
MSHD018720 Prevotella species (f.d. Bacteroides spp) är gramnegativa an¬aeroba stavar i luftvägar och tarm.
 
−
ATCC29303 Prevotella bivia och
 
−
ATCC29426 Prevotella disiens ger bäckeninfektioner (endometrit).
 
−
ATCC25845 Prevotella melaninogenica ses tillsammans med aeroba bakterier i svår¬läkta sår, abscesser och osteiter.
 
−
MSHD011424 Propionibacterium species är grampositiva anaeroba stavar i hudens normalflora. De kan ge upphov till lågvirulenta infek¬tioner, särskilt i samband med insättande av främmande mate¬rial inom ortopedi och kärlkirurgi. Nedsatt immunförsvar medför ökad infektionsrisk.
 
−
ATCC06919 Propionibacterium acnes är den vanligaste arten.
 
−
ATCC14157 Propionibacterium propionicum (tidigare benämnd Arachnia propionica) tillhör den normala konjunktivalfloran men anses orsaka kanalikulit i tårkanalen.
 
−
MSHD011511 Proteus species är gramnegativa, rörliga stavar tillhörande Enterobacteriaceae som förekommer i tarmfloran.
 
−
ATCC29906 Proteus mirabilis är den vanligaste proteusarten. Den kan orsaka urinvägsinfektion. Genom bakteriens ureasproduktion bildas ibland urinvägskonkrement. Bakterien ger även sår¬infektion, bakteriemi och i enstaka fall meningit.
 
−
ATCC 33519 Proteus penneri (tidigare Proteus vulgaris biotyp 1) kan or¬saka urinvägsinfektioner men också bakteremi och i enstaka fall meningit. Oftare antibiotikaresistent än P. mirabilis.
 
−
ATCC13315 Proteus vulgaris kan orsaka urinvägsinfektion. Genom bakt¬eriens ureasproduktion bildas ibland urinvägskonkrement. Bakterien ger även sårinfektion, bakteriemi och i enstaka fall meningit.
 
−
MSHD011532 Providencia species är relativt ovanliga gramnegativa stavar till¬hörande Enterobacteriaceae i tarmfloran. Flera species finns t.ex.
 
−
ATCC09886 Providencia alcalifaciens,
 
−
ATCC29944 Providencia rettgeri (f.d. Proteus rettgeri),
 
−
ATCC29914 Providencia stuartii. De kan orsaka nosokomial urinvägsinfektion, sår¬infektion, bakteriemi och i enstaka fall meningit.
 
−
MSHD011549 Pseudomonas species är gramnegativa, aeroba, non-fermen¬tativa stavar. De är vanligt förekommande på växter, i jord och vatten.
 
−
ATCC10145 Pseudomonas aeruginosa kan även förekomma i tarmfloran, särskilt i samband med sjukhusvård. Den kan ge sårinfektion (grönaktigt var) och nosokomial urinvägsinfektion, extern otit, empyem, pneumoni, ögoninfektion (efter skada eller opera¬tion). Septikemi, endokardit och meningit finns beskrivet samt follikulit efter bad i bubbelpool.
 
−
ATCC13525 Pseudomonas fluorescens trivs i fuktiga miljöer. Den kan ge lågvirulenta, opportunistiska infektioner särskilt hos individer med nedsatt immunförsvar. Bakterien isoleras från urinvägar, sår och empyem.
 
−
ATCC17588 Pseudomonas stutzeri ger lågvirulenta, opportunistiska in¬fektioner, fr.a. hos patienter med nedsatt immunförsvar - em¬pyem, urinvägsinfektion, sårinfektion.
 
−
ATCC06939 Rhodococcus equi är en grampositiv stav som normalt före¬kommer i jord och växter. R. equi har låg sjukdoms¬framkal¬lande förmåga och orsakar infektioner (hudinfektion, pneu¬moni och septikemi) nästan uteslutande hos individer med nedsatt immunförsvar (AIDS m.m.).
 
−
MSHD012281 Rickettsia species är små obligat intracellulära bakterier som brukar indelas i tyfusgruppen med R. prowazekii som orsakar fläcktyfus och spotted fever-gruppen med bl.a. R. rickettsii som orsakar Rocky mountain spotted fever. Sprids med bl.a. löss, loppor och fästingar. Flera species klassas som BSL 3 patogener.
 
−
ATCC17931 Rothia dentocariosa är en grampositiv stav nära besläktad med aktinomyceterna. Den förekommer i övre luftvägarna och brukar placeras under beteckningen difteroida stavar. De har beskrivits vid endokardit.
 
−
ATCC43971 Salmonella enterica. Salmonella tillhör Enterobacteriaceae och är gramnegativa stavar. Alla kliniskt relevanta stammar tillhör arten S. enterica som är ett nybildat artnamn. Mer än två tusen olika serotyper finns beskrivna. Dessa används till vardags som ”artnamn”. Vanligaste serotyperna är S. Enteriti¬dis, S. Typhimurium. Genom otillräckligt värmda livsmedel kan bakte¬rierna ge gastrointestinal infektion med diarré. I sällsynta fall förekommer septikemi och urinvägsinfektion. Både in¬hemska och importerade fall förekommer. Salmonella Typhi är en hu¬manadapterad serotyp som ger tyfoid¬feber, vilken kan börja som en gastrointestinal infektion där septiska symtom senare dominerar genom bakteriens invasiva förmåga. Sekundärt till septikemin kan artrit, osteo¬myelit, abscesser m.m. förekomma. Mindre virulenta är S. Paratyphi A och B.
 
−
MSHD020357 Selenomonas är en anaerob stavbakterie som finns i subgingivan vid periodontit.
 
−
MSHD012705 Serratia species är relativt ovanliga gramnegativa stavar tillhö¬rande Enterobacteriaceae i tarmfloran.
 
−
QU66694 Serratia liquefaciens kan orsaka nosokomial urinvägsinfek¬tion, sårinfektion (stora brännskador), bakteriemi och i en¬staka fall meningit.
 
−
ATCC13880 Serratia marcescens kan orsaka nosokomial urinvägsinfek¬tion, osteit, sårinfektion (stora brännskador), bakteriemi och i en¬staka fall meningit. Nosokomiala utbrott finns beskrivna från neonatalavdelningar samt från blodpåsar. Mest känd är de röd¬pigmenterade varianterna av denna bakterie som ”järteckens¬bakterie”.
 
−
ATCC08071 Shewanella putrefaciens (f.d. Pseudomonas putrefaciens), är en gramnegativ stav som normalt lever i fuktig miljö. Den har låg sjukdomsframkallande förmåga men kan förekomma i blod¬odlingar. Isoleras också från urinvägar, bensår och ab¬scesser.
 
−
MSHD012760 Shigella species är gramnegativa stavar tillhörande Entero¬bacteriaceae. Fyra olika species finns: S. boydii, S. dysente¬riae, S. flexneri och S. sonnei. Taxonomiskt är de egentligen invasiva kloner av E. coli. Bakterierna kan med kontaminerad föda, vatten eller kontaktsmitta ge gastrointestinal infektion. Diarrén karakteriseras av blodtillblandning (rödsot) genom bakteriens invasiva förmåga i tarmslemhinnan. Endast sällan invaderas blodbanan.
 
−
MSHD013139 Spirillum är beteckningen på en grupp spiroketer som återfinns i munhåla och svalg. De ses bl.a. i preparat från periodontit.
 
−
QU66699 Spirillum minus är en av två bakterier som förknippas med råttbettsfeber. Den är gramnegativ men har inte odlats fram på syntetiska medier. Mikroskopi och injektion på marsvin kan användas för diagnostik. Jfr. Streptobacillus moniliformis.
 
−
Stafylokocker se Staphylococcus species.
 
−
MSHD013210 Staphylococcus species är grampositiva, katalaspositiva kocker. De förekommer i hudens normalflora.
 
−
ATCC12600 Staphylococcus aureus är en vanlig orsak till abscesser, impe¬tigo och sårinfektioner. S. aureus kan även förekomma i urin¬odling hos kateteriserade patienter eller som tecken på en em¬bolisering till urinvägarna. Andra manifestationer är oste¬omye¬lit, artrit, empyem, septikemi, meningit, endokardit och toxic shock syndrome. Toxinutlöst matförgiftning förekom¬mer. MRSA (meticillinresistent S. au¬reus) är resistent mot alla betalaktamantibiotika och ibland även mot andra antibiotika. Den utgör därigenom ett nosokomi¬alt problem.
 
−
ATCC14990 Staphylococcus epidermidis är den vanligaste koagulasnega¬tiva stafylokocken i hudens normalflora. Den har låg sjuk¬doms¬framkallande förmåga men kan ge infektioner utgående från främmande kroppar. Sjukhusstammar är ofta antibiotika¬resis¬tenta. Vanlig kontaminant.
 
−
QU66716 Staphylococcus lugdunensis kan ge abscesser, septikemi, en¬dokardit, graft- och protesinfektioner m.m. Infektionerna har ofta ett mer akut förlopp än man väntar sig av koagulas¬nega¬tiva stafylokocker. Dock ses långdragna svårbehandlade in¬fektioner av typ hidroadenit, paronyki och mastit.
 
−
ATCC15305 Staphylococcus saprophyticus kan ge kraftig akut cystit hos kvinnor främst i fertil ålder. Ofta täta miktioner vilket ger låga bakterietal vid urinodling.
 
−
ATCC13637 Stenotrophomonas maltophilia (f.d. Xanthomonas/Pseu¬domonas maltophilia) är en gramnegativ stav som trivs i fuktig miljö. Den ses i urinvägar (KAD), bensår och absces¬ser. Trots låg sjukdoms¬framkallande förmåga förekommer den vid ett flertal olika infektionstyper inkluderande sepsis och meningit. Alltid resistent mot imipenem och meropenem. Nosokomialt problem fr.a. på IVA.
 
−
ATCC25296 Stomatococcus mucilaginosus är en grampositiv kock som normalt finns i munhålan. Hos främst immundefekta patienter kan den ge upphov till endokardit, bakteremi, intravaskulär kateterinfektion, meningit och peritonit.
 
−
ATCC 14647 Streptobacillus moniliformis är en gramnegativ stav som orsakar råttbettsfeber.
 
−
MSHD013291 Streptococcus species är grampositiva, katalasnegativa kocker. De indelas traditionellt efter sin hemolys på bloda¬garplattor. Alfastreptokocker ger en grön hemolys eller ingen he¬molys, betahemolyserande streptokocker (eller förenklat betastreptokocker) ger en klar hemolys. Alfastrepto¬kocker används i denna bok som gruppbeteckning för ej när¬mare identifierade streptokocker där de vanligaste arterna är ute¬slutna och närmare identifiering ej anses kliniskt nödvän¬dig. De är normalflora i munhåla, svalg och tarm där de ofta har sina egna ekologiska nischer. Streptokocker kan med serologisk metodik indelas i olika grupper.
 
−
Streptococcus agalactiae, se Grupp B Streptokocker.
 
−
ATCC33397 Streptococcus anginosus ingår i Streptococcus milleri- grup¬pen (S. anginosus, S. constellatus, S. intermedius). Den finns normalt i luftvägar, mag-tarmkanal och hud. Den kan ge em¬pyem, abscesser, septikemi, meningit och endokardit.
 
−
ATCC33317 Streptococcus bovis tillhör GDS (grupp D streptokocker). Den finns normalt i mag-tarmkanal och luftvägar. Den kan orsaka septikemi (statistisk koppling mellan kolonmalignitet och S. bovis i blod) och endokardit.
 
−
ATCC27823 Streptococcus constellatus ingår i Streptococcus milleri-grup¬pen.
 
−
QU66726 Streptococcus milleri-gruppen är en gruppbeteckning för små betahemolyserande streptokocker tillhörande S. angino¬sus, S. constellatus och S. intermedius. De tillhör normalflo¬ran men förekommer också i olika typer av abscesser.
 
−
ATCC27335 Streptococcus intermedius ingår i Streptococcus milleri- grup¬pen (S. anginosus, S. constellatus, S. intermedius). Den före¬kommer normalt i munhåla, luftvägar och tarm. Den kan orsaka endokardit, abscesser och meningit.
 
−
ATCC29178 Streptococcus iniae-orsakad cellulit har beskrivits efter hudskador hos arbetare i fiskodlingar.
 
−
ATCC3399 Streptococcus mitis ingår i gruppen alfastreptokocker. Den före¬kommer normalt i munhåla, luftvägar och tarm. Den kan orsaka endokardit och abscesser.
 
−
ATCC25175 Streptococcus mutans ingår i gruppen alfastreptokocker. Den förekommer normalt i munhåla, luftvägar och tarm. Den kan orsaka endokardit och medverkar till bildningen av dentala plaque.
 
−
ATCC35037 Streptococcus oralis (f.d. S. mitior) ingår i gruppen alfa¬strep¬tokocker. Den förekommer normalt i munhåla, luft¬vägar och tarm, och återfinns vid endokardit.
 
−
ATCC33400 Streptococcus pneumoniae (pneumokocker) orsakar akut otit, sinuit, pneumoni, septikemi och meningit. Bakterien har tidi¬gare alltid varit känslig för penicillin men på senare år är resi¬stensutveckling mot penicilliner och andra antibiotika ett väx¬ande problem.
 
−
Streptococcus pyogenes, se Grupp A streptokocker.
 
−
ATCC 7073 Streptococcus salivarius ingår i gruppen alfastreptokocker. Den förekommer normalt i munhåla och tarm. Den återfinns vid endokardit.
 
−
ATCC10556 Streptococcus sanguis ingår i gruppen alfastreptokocker. Den förekommer normalt i munhåla, luftvägar och tarm. Den kan orsaka endokardit och sinuit och medverkar vid bildningen av dentala plaque.
 
−
Streptokocker Grupp B, se Grupp B streptokocker.
 
−
Streptokocker Grupp C, se Grupp C streptokocker.
 
−
Streptokocker Grupp D, se Grupp D streptokocker.
 
−
Streptokocker Grupp G, se Grupp G streptokocker.
 
−
MSHD014210 Treponema pallidum tillhör spiroketerna och ger upphov till syfilis (lues). Sjukdomen sprids huvudsakligen sexuellt och kan ha en mycket varierande symtombild. Primärinfek¬tionen är ett sår med regional lymfkörtelsvullnad. Sekundär¬fasen kan domineras av mukokutana lesioner, feber och generell lymf¬körtelsvullnad. I tertiärstadiet ses framför allt symtom från cirkulations- och nervsystem.
 
−
ATCC27618 Ureaplasma urealyticum har som övriga ureaplasma in¬kom¬plett cellvägg. De förekommer normalt i urogenitaltrakten hos män och kvinnor. Vid förekomst i större mängd kan de even¬tuellt ge uretrit, prostatit, vaginos och endometrit.
 
−
ATCC10790 Veillonella parvula är en anaerob gramnegativ kock med låg patogenicitet. Kan i sällsynta fall ses vid infektioner i huvud, nacke och luftvägar.
 
−
MSHD014733 Vibrio species är gramnegativa, oxidaspositiva böjda stavar (måsvingar). De är vanligt förekommande i marina miljöer. Många arter är halofila och kräver salt i substraten för att tillväxa.
 
−
ATCC17749 Vibrio alginolyticus kan ge hudinfektioner, cellulit och extern otit. Eftersom bakteriens normala nisch är vattenassocierade miljöer, ses infektioner framförallt hos fiskare och simmare. Hos immundefekta kan bakterien ge livshotande bakteriemi.
 
−
MSHD014734 Vibrio cholerae förekommer i sött eller bräckt kontaminerat vatten, frukt och grönsaker. Vissa serotyper, typ O1 (och O139), ger upphov till sjukdomen kolera och producerar ett toxin (koleratoxinet (CT)). Vattentunna diarréer kan leda till extrem dehydrering. Kolera har funnits i Sverige men finns nu huvudsakligen i tropiska länder.
 
−
ATCC33539 Vibrio damsela kan liksom Vibrio alginolyticus ge sårinfektioner efter hudtrauma i salt eller bräckt vatten.
 
−
ATCC17802 Vibrio parahemolyticus förekommer i tempererat saltvatten över hela världen. Den kan kontaminera skaldjur och hos män¬niska ge toxinutlöst matförgiftning. Den kan ge sällsynta op¬portunistiska infektioner i sår, öga och öra.
 
−
ATCC27562 Vibrio vulnificus förekommer i havsvatten. Den har uttalad sjukdomsframkallande förmåga (sommartid) och kan ge sår¬infektioner och septikemi, det senare bl.a. efter intagande av råa ostron. Individer med leversjukdom är särskilt känsliga.
 
−
MSHD016983, QU71318 VRE är beteckning för vankomycinresistenta enterokocker.
 
−
MSHD016968 Wolinella species är gramnegativa anaeroba stavar som till¬hör luftvägarnas normalflora. Bakterien kan påvisas vid periodontit.
 
−
MSHD015007 Yersinia species är gramnegativa stavar tillhörande Entero¬bacteriaceae.
 
−
ATCC09610 Yersinia enterocolitica Inom arten finns kloner som har inva¬siv förmåga. Serotyp O3 är vanligast i Sverige. Kan genom kon¬taminerad föda ge diarré eller lymfadenit liknande appen¬dicit. Även artrit och bakteriemi har beskrivits.
 
−
ATCC19428 Yersina pestis orsakar pest och antas vara ansvarig för de stora epi¬demierna av digerdöd i Europa under medeltiden. Sjukdomen förekom i två former, böldpest och lungpest. Böldpest uppstod efter bett av infekterade loppor för vilka svartråttor var reser¬voar. Om infektionen nådde lungorna kunde infektionen spri¬das genom aerosol som då gav en primär infektion i lungorna hos den infekterade. Pest förekommer i stora delar av världen med olika gnagare som reservoar. Klassas som BSL 3 pato¬gen.
 
−
ATCC29833 Yersinia pseudotuberculosis ses fr.a. hos djur men kan or¬saka gastroenterit hos människa.
 

Nuvarande version från 10 november 2012 kl. 23.03

Till innehållsförteckningen för Referensmetodik: Bakteriologisk diagnostik av infektioner i hud, mjukdelar, skelett och inre organ

Till artikeln Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier:L-Y

Kort beskrivning av kliniskt intressanta bakterier[redigera]

Förklaringar till förkortningar[redigera]

  • QU kod Quantity and Units code = kod, utan eget inbyggt informationsvärde, av C-NPU åsatt ett element eller annat nödvändigt begrepp när det inte finns någon annan professionellt väldefinierad kod.
  • MSH = Medical Subject Heading kod.
  • UMLS = United Medical Language System.
  • ATCC = American Type Culture Collection accession number.
  • NCTC = National collection of type cultures.


Bakterielista A-K[redigera]

  • QU71758---- Abiotrophia adiacens-se Granulicatella adiacens.
  • MSHD000150---- Acinetobacter species är gramnegativa stavar i människans normalflora. De ger upphov till opportunistiska infektioner. De ses ofta i urinvägarna, särskilt hos patienter med KAD (kateter à demeure/liggkateter). Bakterierna har låg sjukdomsframkallande förmåga men är ofta antibiotikaresistenta och intressanta vid nosokomiala infektioner. Flera olika species finns t.ex.
    • ATCC19606---- A. baumannii,
    • ATCC23055---- A. calcoaceticus,
    • ATCC15309---- A. lwoffii.
  • ATCC33384---- Actinobacillus (Aggregatibacter) actinomycetemcomitans är en gramnegativ stav i människans munhåleflora. Den har låg sjukdomsframkallande förmåga men kan orsaka periodontit, munhåleabscess, fistel i thorax och endokardit. Den kan ses i blandinfektion med Actinomyces.
  • ATCC19392---- Actinobacillus equuli och A. lignieresii har isolerats vid sårinfektioner och abscesser efter djurbett, A. equuli vid hästbett.
  • MSHD000190---- Actinomyces species är en heterogen grupp av anaeroba grampositiva stavar i framför allt luftvägarnas normalflora. Kan ge infektion (aktinomykos) i ansikte, halsområdet, lunga och kvinnliga bäckenet (som komplikation till intrauterin spiral).
  • ATCC11563---- Aerococcus viridans är en grampositiv kock, närbesläktad med enterokocker. Den kan förekomma vid urinvägsinfektion, septikemi, endokardit och meningit.
  • MSHD000333---- Aeromonas species är gramnegativa stavar tillhörande familjen Vibrionacae. De trivs i vatten och kan förekomma normalt i tarmen. De kan orsaka sårinfektioner, septikemi, urinvägsinfektioner och gastroenteriter.
  • MSHD000421---- Alcaligenes species är gramnegativa stavar som trivs i fuktiga miljöer såsom jord och vatten. De ger lågvirulenta, opportunistiska infektioner, fr.a. hos nedgångna patienter – urinvägsinfektion (KAD), bensår, sårinfektion efter amputation av nedre extremitet.
  • QU60542---- Alfastreptokocker utgör ett samlingsnamn för streptokocker som förekommer i munhåla och på hud. De kan ha alfahemolys, betahemolys eller ingen hemolys. De har låg sjukdomsframkallande förmåga men kan orsaka endokardit (särskilt vid tidigare klaffskador).
  • MSHD009343---- Apatogena Neisseria är gramnegativa aeroba kocker som tillhör luftvägarnas normalflora. När begreppet används har N. gonorrhoeae och N. meningitidis uteslutits. Neisseria spp har låg sjukdomsframkallande förmåga och betraktas vanligen som normalflora.
  • ATCC09345---- Arcanobacterium haemolyticum (f.d. Corynebacterium haemolyticum) är en grampositiv stav som kan ge faryngit och ibland skarlatinaliknande sjukdom, främst hos tonåringar. Faryngiten svarar dåligt på penicillinterapi men väl på terapi med erytromycin och andra makrolider.
  • MSHD001407---- Bacillus species är grampositiva, sporbildande stavar som förekommer i vår omgivning. Alla arter utom B. anthracis och B. cereus har låg sjukdomsframkallande förmåga.
  • ATCC14578---- Bacillus anthracis är en klass 3 patogen som kan ge kutan antrax med moderat mortalitet och efter inhalation av sporer pulmonell antrax med upp emot 100 % mortalitet om behandling inte insätts mycket tidigt.
  • ATCC14579---- Bacillus cereus kan bilda ett potent enterotoxin som ger upphov till matförgiftning om den får tillväxa i livsmedel, ofta risrätter. Bakterien har beskrivits vid ortopediska infektioner.
  • ATCC06051---- Bacillus subtilis (höbakterien) kan i enstaka fall orsaka en kliniskt signifikant infektion. Det är ofta svårt att avgöra om ett odlingsfynd är en kontamination eller ej.
  • ATCC33387----Bacteroides ureolyticus, se Campylobacter ureolyticus
  • ATCC25285---- Bacteroides fragilis-gruppen (innefattar Bacteroides fragilis) är en stor grupp gramnegativa anaeroba stavar i tarmens normalflora. De är vanliga i postoperativa blandinfektioner, särskilt efter kirurgi i tarm och kvinnliga genitalia. Flertalet bildar betalaktamas och kan ej behandlas med penicilliner.
  • MSHD001473---- Bartonella species är långsamväxande gramnegativa stavar av vilka åtminstone fyra är patogena hos människa: B. henselae (cat scratch disease), B. bacilliformis (Oroya fever), B. quintana (skyttegravsfeber) och B. elizabethae (endokardit).
  • MSHD001644---- Bifidobacterium species är grampositiva stavar som tillhör den normala tarmfloran fr.a. hos barn. Ses sällan i samband med infektion.
  • QU60511---- Betahemolyserande streptokocker (betastreptokocker) är en beteckning för stora kolonier av betahemolyserande streptokocker grupp A, C eller G. Referensbeteckning är Streptococcus pyogenes, Grupp C resp. G streptokocker, förkortat S. pyogenes, GCS och GGS. GAS är ett accepterat alternativ till S. pyogenes.
  • ATCC49260---- Bilophila wadsworthia är en anaerob gramnegativ stav som främst associerats med appendicit.
  • MSHD001884---- Bordetella är små gramnegativa stavar.
    • ATCC19395---- Bordetella bronchiseptica tillhör luftvägsfloran hos människa och djur. I undantagsfall kan den hos människa orsaka pneumonit och sårinfektion.
    • ATCC15311---- Bordetella parapertussis orsakar en kikhosteliknande sjukdomsbild.
    • ATCC09797---- Bordetella pertussis ger upphov till kikhosta. Symtomen beror bl.a. på bakteriens toxinbildning.
  • MSHD001898 Borrelia species. Borrelia tillhör spiroketerna. Ett antal arter finns, t.ex.
    • ATCC35210---- Borrelia burgdorferi,
    • ATCC51383---- Borrelia garinii och
    • ATCC51567---- Borrelia afzelii är av störst intresse vid borrelios. Sjukdomen kan ha många olika symtom bl.a. erytema migrans, led- och muskelsymtom, trötthet, encefalit och myokardit. Med fästingar sprids spiroketerna från djur till människa.
    • QU66137---- Borrelia recurrentis orsakar återfallsfeber, en sjukdom som uteslutande sprids med vägglöss. Liknande sjukdomstillstånd kan orsakas av många andra arter av Borrelia.
  • MSHD001951---- Brevibacterium species finns i mejeriprodukter men tillhör även den normala hudfloran. En distinkt ostlukt kännetecknar många isolat. Den orsakar sällan infektion hos människa men infektioner i samband med främmande kropp, dialysvätska, osteomyelit och meningit finns beskrivna.
  • MSHD002002---- Brucella species är gramnegativa stavar som klassas som BSL 3 patogener p.g.a. av sin stora förmåga att orsaka laboratorieinfektioner. Alla tillhör samma art men kan indelas i olika subspecies med vissa skillnader i värdspecificitet.
    • ATCC23448----B. abortus har främst nötboskap som värd,
    • ATCC23456---- B. melitensis har get, samt
    • ATCC23444---- B. suis svin som värdar. Dessa samt vissa andra typer kan smitta människa via opasteuriserade mejeriprodukter. Septikemi, ofta med svängande feber och sekundär osteomyelit, kan ses hos denna sällsynta importsjukdom.
  • MSHD019117---- Burkholderia species (f.d. Pseudomonas) är aeroba gramnegativa stavar.
    • ATCC25416---- Burkholderia cepacia trivs i fuktiga miljöer. Den ger lågvirulenta, opportunistiska infektioner, fr.a. hos patienter med nedsatt immunförsvar eller cystisk fibros (empyem, pneumoni, UVI, sårinfektion).
    • ATCC23344---- Burkholderia mallei är en BSL 3 patogen som huvudsakligen drabbar häst (glanders) med förmåga att också ge allvarlig sjukdom hos människa. Smittar främst vid laboratoriearbete men kan i enstaka fall överföras direkt från häst till människa.
    • ATCC23343---- Burkholderia pseudomallei är även den en BSL 3 patogen p.g.a. sin förmåga att lätt ge upphov till laboratorieinfektioner. Förekommer allmänt i jord och vatten i Sydostasien men infektioner-melioidos- är ovanliga hos turister.
  • QU66010---- Campylobacter jejuni/coli-gruppen är en grupp av gramnegativa (böjda) stavar som ingår i tarmfloran hos nötboskap, hönsfåglar och husdjur. Människor kan smittas genom ofullständigt uppvärmda kycklingar och mejeriprodukter, men i de flesta fall är smittkällan okänd. Sjukdomssymtomen är diarré, magsmärtor, feber och ibland kräkningar.
  • ----Campylobacter ureolyticus (tidigare Bacteroides ureolyticus), är en anaerob gramnegativ stav med oklar taxonomisk tillhörighet, som 2010 reklassificierades till genus Campylobacter. Isoleras från genitala infektioner, orala infektioner och sår.
  • ATCC35979---- Capnocytophaga canimorsus (f.d. DF-2) är en gramnegativ stav i fr.a. hundens normala munflora. Bakterien kan efter hundbett orsaka sårinfektion, sepsis, meningit och i enstaka fall endokardit.
  • ATCC27872---- Capnocytophaga ochracea förekommer i munhålan hos människa och har förknippats med periodontit.
  • ATCC15826---- Cardiobacterium hominis är en gramnegativ stav i luftvägarnas normalflora. Enda beskrivna sjukdomstillstånd är endokardit (med eller utan skada på hjärtklaffar).
  • MSHD002689---- Chlamydia species är små obligat intracellulära, gramnegativa stavar.
    • ATCCVR2282---- Chlamydophila pneumoniae, f.d. TWAR, förekommer över hela världen. Bakterien kan ge upphov till faryngit, sinuit, bronkit och pneumoni.
    • ATCCVR571---- Chlamydia trachomatis är en, i Sverige, vanlig orsak till sexuellt överförbar genital infektion, uretrit, salpingit m.m. Vissa serotyper kan ge trakom repektive lymfogranuloma venereum. Närbesläktade
    • ATCCVR125---- Chlamydia (Chlamydophila) psittaci orsakar ornitos. Klassas som BSL 3 patogen.
  • ATCC13253---- Chryseobacterium meningosepticum (f.d. Flavobacterium meningosepticum) är en gramnegativ stav som förekommer normalt i jord och vatten men ej ingår i människans normalflora. I sällsynta fall ger den septikemi och meningit hos nyfödda. Bakterien är mycket antibiotikaresistent.
  • MSHD002954--- Citrobacter som tillhör familjen Enterobacteriaceae, är relativt ovanliga gramnegativa stavar i tarmfloran. Flera olika species finns t.ex.
    • ATCC25405---- C. amalonaticus,
    • ATCC08090---- C. freundii,
    • ATCC27028---- C. koseri (f.d. C. diversus). De kan orsaka nosokomial urinvägsinfektion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi.
  • MSHD003013---- Clostridium species är anaeroba grampositiva sporbildande stavar som förekommer i vår omgivning och i tarmens normalflora.
    • ATCC638---- Clostridium bifermentans
    • ATCC25763---- Clostridium botulinum orsakar botulism. Tre kliniska huvudgrupper kan urskiljas- klassisk botulism som matförgiftning, spädbarnsbotulism efter kolonisering av tarmen och sårbotulism som följd av toxinbildning i sår infekterade med sporer.
    • ATCC09689---- Clostridium difficile kan förekomma i normalfloran fr.a. hos barn men kan genom sina enterotoxiner ge svårbehandlad ofta antibiotikaassocierad diarré om den får dominera i tarmfloran. Den svåraste formen är pseudomembranös enterokolit.
    • ATCC19400---- Clostridium fallax,
    • ATCC19401---- Clostridium histolyticum och
    • ATCC17861---- Clostridium novyi kan ge klassisk gasbrand.
    • ATCC13124---- Clostridium perfringens förekommer i vår omgivning och tarmens normalflora. Den orsakar klassisk gasbrand men ses vanligare i postoperativa bukinfektioner, sårinfektioner och vid kolecystit. Enterotoxinbildande stammar kan ge matförgiftning.
    • ATCC12464---- Clostridium septicum förekommer i tarmens normalflora. Den kan ge septikemi och nekrotiserande enterokolit hos patienter med malignitet i buken (lymfom, leukemi, karcinom), diabetes eller grav hjärtsjukdom.
    • MSHD003017---- Clostridium tetani finns i jord och tarmens normalflora. Bakterien bildar tetanustoxin som ger upphov till stelkramp. Sjukdomen är mycket ovanlig eftersom de flesta personer är vaccinerade.
  • MSHD003352---- Corynebacterium species är grampositiva stavar som förekommer i hudens normalflora. De brukar grupperas som difteroida ("koryneforma") stavar tillsammans med liknande bakterier. Artidentifikation är vanligen svår och sällan kliniskt motiverad. De ses ofta som kontamination. Det är nödvändigt med upprepade fynd för att säkerställa relevans. Vissa arter har dock stor klinisk betydelse.
    • ATCC14665---- Corynebacterium aquaticum räknas som en vattenorganism. Ett fåtal fall med humana infektioner finns beskrivna och inkluderar bakteriemi, endokardit, meningit, CAPD-peritonit och cellulit efter skada med högtryckstvätt.
    • ATCC27010---- Corynebacterium diphtheriae ger difteri. Huvudsakligen importfall. Vanligen ses svår tonsillit, men även sårinfektioner förekommer. Hos ovaccinerade personer kan toxinproducerande stammar ge skador på hjärta och nervsystem.
    • ATCC43734---- Corynebacterium jeikeium (f.d. C. JK) ses oftast vid infektioner hos sjukhusvårdade patienter som under lång tid behandlats med bredspektrumantibiotika. Bakterien är ofta antibiotikaresistent. Den kan ge sårinfektion, septikemi och "främmande kroppsinfektioner".
    • ATCC43042---- Corynebacterium urealyticum (f.d. C. D2). Vid urinvägsinfektion med denna bakterie ses ibland ärtsoppsliknande illaluktande urin. Stenbildning är vanlig p.g.a. bakteriens ureasproduktion. Även sårinfektion, peritonit, och septikemi förekommer. Bakterien är ofta antibiotikaresistent.
  • MSHD003381---- Coxiella ingår tillsammans med genera Rickettsia och Ehrlichia i ordningen Rickettsiales.


    • MSHD016997---- Coxiella burnetii orsakar akut och kronisk Q-feber. Förknippas med atypisk pneumoni kan också ligga bakom odlingsnegativ endokardit.
  • QU60517---- Difteroida stavar är en gruppbeteckning för oftast föga patogena grampositiva stavar vilka förekommer i den ordinära hudfloran.
  • ATCC23834---- Eikenella corrodens är en gramnegativ stav i normalfloran i munhåla, tarm och urogenitalia. Den anses kunna orsaka munhåleabscesser, empyem, artrit, bakteriemi och meningit.
  • MSHD020594---- Edwardsiella species är gramnegativa stavar som förekommer i tarmens normalflora.
    • ATCC15947---- Edwardsiella tarda är ett inte ovanligt fynd vid extraintestinala infektioner. Misstänks även kunna orsaka enterit.
  • UMLSCUIC 1010492---- Enterobacter species är gramnegativa stavar tillhörande
  • MSHD004755---- Enterobacteriaceae och förekommer i tarmens normalflora.
    • ATCC13048---- Enterobacter aerogenes kan ge upphov till opportunistiska infektioner i urinvägar, bensår m.m. Hos immundefekta patienter kan den ge septikemi.
    • QU66285---- Enterobacter agglomerans – se Pantoea agglomerans.
    • ATCC13047---- Enterobacter cloacae kan orsaka nosokomial urinvägsinfektion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi.
  • MSHD016983---- Enterokocker är grampositiva kocker som förekommer i tarmens normalflora. Vankomycinresistenta E. faecalis och E. faecium (VRE) har fram till 2007 varit ovanliga i Sverige.
    • ATCC25788---- Enterococcus casseliflavus är ovanligt fynd vid infektioner hos människa. Den innehåller van C och kan därför förväxlas med VRE.
    • ATCC19433---- Enterococcus faecalis är den kliniskt vanligaste enterokocken. Den isoleras främst från urinvägar och sår, men kan ge septikemi och endokardit.
    • ATCC19434---- Enterococcus faecium utgör en mindre men ökande del av alla enterokockisolat. Den isoleras främst från urinvägar och sår men kan ge septikemi och endokardit. Den är ofta mycket resistent mot antibiotika men i Sverige med enstaka undantag känslig för vankomycin. Den kan ha betydelse som nosokomial smitta.
    • ATCC35038---- Enterococcus gallinarum -se Enterococcus casseliflavus.
  • ATCC19414---- Erysipelothrix rhusiopathiae är en grampositiv stav som främst är djurpatogen. Den kan hos människa (särskilt slaktare, veterinärer och fiskare) ge erysipeloid (hudinfektion). Artrit, lymfangit och endokardit finns även beskrivet.
  • ATCC11775---- Escherichia coli är en gramnegativ stav tillhörande Enterobacteriaceae i tarmens normalflora. Den är vanligt förekommande i naturen och bland djur. Vanligaste orsaken till urinvägsinfektioner. Kan även förkomma vid septikemi, neonatal meningit, sårinfektion, abscesser, endokardit, pneumoni och gastroenteriter med varierande virulensmekanismer (EHEC, EIEC, EPEC, ETEC).
  • MSHD005051---- Eubacterium species är grampositiva anaeroba stavar i munhålans och tarmens normalflora. Sällsynt orsak till sårinfektioner och abscesser och då vanligen som del i en blandflora. Har beskrivits orsaka periodontala infektioner.
  • MSHD005417---- Flavobacterium species är ett samlingsnamn på ett stort antal närbesläktade arter som förekommer i jord och vatten. Bakterierna är lågvirulenta. Den kliniskt mest kända
    • ATCC13253---- F. meningosepticum är numera omdöpt till Chrysobacterium meningosepticum.
  • ATCC06223---- Francisella tularensis är en gramnegativ stavbakterie, som förekommer bland gnagare, insekter och i kontaminerat vatten. Stor variation i förekomst mellan åren. Även människan smittas av denna zoonos. Förekommer främst i Gästrikland, Hälsingland och Dalarna men har på senare tid diagnostiserats längre söderut. Kan lokalt ge sår, lymfkörtelsvullnad, feber, pneumoni. Vanligtvis serologisk diagnostik då risk för laboratoriesmitta finns vid odling. Klassas som BSL 3 patogen.


  • MSHD005673---- Fusobacterium species är gramnegativa anaeroba stavar som förekommer i munhålans, tarmens och genitalias normalflora.
    • ATCC25286---- Fusobacterium necrophorum kan ge svåra septiska adeniter och s.k. nekrobacillos eller Lemière´s syndrom. Vanligen förekommer den dock som del i blandflora (Vincent angina, peritonsillära abscesser, bukinfektioner m.m.).
    • ATCC25586---- Fusobacterium nucleatum kan ge akut nekrotiserande gingivit och peritonsillära abscesser och bukabscesser i blandinfektion.
  • ATCC 12344---- Grupp A streptokocker (GAS), är vid sidan av Streptococcus pyogenes (S. pyogenes) referensbeteckning för betahemolyserande streptokocker grupp A. S. pyogenes är den bakterie som orsakar scharlakansfeber, halsfluss, impetigo, erysipelas, sårinfektioner, fasciiter och septikemi liksom sekundär glomerulonefrit och reumatisk feber.
  • ATCC13813---- Grupp B streptokocker (GBS) är vid sidan av Streptococcus agalactiae referensbeteckning för streptokocker tillhörande grupp B. Den tillhör den normala tarmfloran och uretra/vaginalfloran hos kvinnor. I anslutning till förlossning kan barnet infekteras och få septikemi/meningit. För urinvägarna har den klassificerats som tveksamt patogen (I 5:2).
  • UMLSCUIC 0318158---- Grupp C streptokocker, GCS, är referensbeteckning för betahemolyserande streptokocker Grupp C (S. dysgalactiae subsp. equisimilis och subsp. dysgalactiae, den senare ej humanpatogen). De kan liksom S. pyogenes ge faryngotonsillit, hud- och sårinfektion, septikemi m.m. liksom sekundär glomerulonefrit och reumatisk feber.
  • UMLSCUIC 0318159---- Grupp D streptokocker, GDS. Streptokock grupp D-antigen associeras vanligen till enterokocker men förekommer också hos Streptococcus bovis och hos några arter av Pediococcus.
  • UMLSCUIC 0318162---- Grupp G streptokocker, GGS, är referensbeteckning för betahemolyserande streptokocker Grupp G (S. dysgalactiae subsp. equisimilis). De kan liksom S. pyogenes ge faryngotonsillit, hud- och sårinfektion, septikemi m.m. liksom sekundär glomerulonefrit och reumatisk feber.


  • ATCC14018---- Gardnerella vaginalis är en gramlabil stav i den normala vaginalfloran. Den har associerats med bakteriell vaginos och isoleras ibland postpartum i blod och i material från endometrium. Den kan orsaka infektion efter abort.
  • ATCC27824---- Gemella morbillorum karakteriserades tidigare som Streptococcus morbillorum. Det är en grampositiv kock som isoleras från övre luftvägarna och i enstaka fall orsakat endokardit.
  • Gonokocker är en accepterad beteckning för Neisseria gonorrhoeae.
  • ATCC49175---- Granulicatella adiacens (f.d. Abiotrophia adiacens) är grampositiva kocker som tillhör alfastreptokockerna. De ingår i den normala svalgfloran. Omfattar s.k. B6-beroende streptokocker. Kan i sällsynta fall ge endokardit.
  • MSHD006190---- Haemophilus species är gramnegativa stavar. Namnet anspelar på att odlingssubstraten måste berikas med blod eller nödvändiga tillväxtfaktorer för att bakterien skall växa.
    • ATCC 19415---- Haemophilus aphrophilus förekommer i svalgfloran hos hundar. Kan orsaka endokardit hos människa.
    • ATCC33940---- Haemophilus ducreyi orsakar mjuk chanker, en sexuellt överförd sjukdom som ger ytliga genitala sår och lymfkörtelengagemang i ljumskarna. Förekommer huvudsakligen i tropiska länder, sällsynt i Sverige.
    • ATCC33391---- Haemophilus influenzae förekommer i luftvägarnas normalflora framför allt hos barn men kan orsaka luftvägsinfektioner såsom otit, sinuit, epiglottit, bronkit, empyem. Den kan även ge upphov till konjunktivit, septikemi, meningit, osteomyelit, endokardit, perikardit. Vid invasiv sjukdom har serologisk subtyp b varit vanligast. Efter introduktion av vaccination är sådana infektioner numera sällsynt förekommande.
    • ATCC33392---- Haemophilus parainfluenzae förekommer även den i luftvägarnas normalflora. Den orsakar sällan luftvägsinfektion men kan ge upphov till septikemi, endokardit, pankreasabscess, postoperativ bukinfektion och i sällsynta fall meningit.
    • ATCC29241---- Haemophilus paraphrophilus kan förekomma i luftvägarna och orsakar endokardit, osteomyelit, hjärnabscess. Har också isolerats från urin från barn med missbildningar i urinvägarna.
  • ATCC13337---- Hafnia alvei är en i tarmfloran förekommande gramnegativ stav tillhörande Enterobacteriaceae. Den liknar Enterobacter och är en sällsynt orsak till urinvägsinfektion och sårinfektion.
  • ATCC43504---- Helicobacter pylori (f.d. Campylobacter pylori) är en gramnegativ liten stav som kan påvisas i slemhinnan i magsäcken. Den blir vanligare med ökad levnadsålder. Bakterien orsakar genom kraftig ureasaktivitet och slemhinneinvasivitet gastrit samt sår i ventrikel och duodenum. Den är också starkt associerad till magcancer.
  • ATCC23330---- Kingella kingae är en gramnegativ stav som förekommer normalt i de övre luftvägarna och urogenitalia. Den är en ovanlig orsak till invasiv infektion (septikemi, septisk artrit, diskit och endokardit).
  • MSHD007709---- Klebsiella species är gramnegativa stavar tillhörande Enterobacteriaceae förekommande i tarmfloran.
    • ATCC31898---- Klebsiella ornithinolytica är ovanlig i kliniska isolat. Dekarboxylerar aminosyran ornitin till skillnad från andra arter inom Klebsiella.
    • ATCC13182---- Klebsiella oxytoca utgör ca 10 % av alla Klebsiella och ger samma sjukdomspanorama som K. pneumoniae.
    • ATCC13883---- Klebsiella pneumoniae kan orsaka nosokomial urinvägsinfektion, sårinfektion, pneumoni och bakteriemi, bukinfektioner m.m.
    • ATCC11296---- Klebsiella pneumoniae subspecies ozaenae kan ge upphov till "stinknäsa" (kolonisation av nässlemhinnan), samt i undantagsfall andra luftvägsinfektioner och urinvägsinfektion.
    • ATCC13884---- Klebsiella rhinoscleromatis associeras med rhinosklerom, en i tropikerna förekommande slemhinneförhårdning i näsan. Ovanligt fynd i Sverige.


  • QU60527---- Koagulasnegativa stafylokocker (KNS) är en gruppbeteckning för stafylokocker och snarlika bakterier som inte producerar enzymet koagulas, vilket skiljer dem från S. aureus. S. epidermidis är vanligaste species och finns i hudens normalflora. Sjukdomsframkallande förmågan är låg men infektioner utgående från främmande kroppar förekommer. Sjukhusstammar är ofta antibiotikaresistenta. Vanlig kontaminant.
Hämtad från "http://referensmetodik.folkhalsomyndigheten.se/index.php?title=Kort_beskrivning_av_kliniskt_intressanta_bakterier:A-K&oldid=12588"